Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y8DBC3

Protein Details
Accession A0A4Y8DBC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-310SGIVKPKPTPRVPKPPKEPKAPKEPKPAKEPKABasic
362-382ATPSSGKKRGRPAKEKTSDTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
243-378REKPAPSGRGRGRPAKPDSEKKIKVPSGRGRDRPSSGIVKPKPTPRVPKPPKEPKAPKEPKPAKEPKAPKEPKPAKEPKAAKTPKSPKEKVVVEKKTPGKRGRPAKVPAAEGDVDEKPAATPSSGKKRGRPAKEKT
388-414TSKKRKASDDAGTPSSAGRGRPKKVKA
Subcellular Location(s) mito 14.5, cyto_mito 9.333, nucl 8.5, cyto_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Amino Acid Sequences MLRSISNSLNPLFGSPRKSTTEDRFEGEKDRESTMSSPNDITLTEFNQALARYPALLDKYAKDTKEGVTPLQELDRFRYVEAPAKFKDGSNTFSIEDVTKLVDWKLRHGAYRPGFLKKVGKNSDELVEAATKDAFDYYKTNPTDIGVVINKLKDPLMGIGPATASLILSVRYPDHVTFFSDECFKWLVNDGEHKPTPKYNVSEFEKIHAAAKSLATRLRVNPLQIEKVAFVIIKESEPVLVPREKPAPSGRGRGRPAKPDSEKKIKVPSGRGRDRPSSGIVKPKPTPRVPKPPKEPKAPKEPKPAKEPKAPKEPKPAKEPKAAKTPKSPKEKVVVEKKTPGKRGRPAKVPAAEGDVDEKPAATPSSGKKRGRPAKEKTSDTPVSATPTSKKRKASDDAGTPSSAGRGRPKKVKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.35
4 0.38
5 0.43
6 0.48
7 0.52
8 0.58
9 0.54
10 0.56
11 0.54
12 0.51
13 0.53
14 0.49
15 0.47
16 0.39
17 0.39
18 0.35
19 0.35
20 0.35
21 0.36
22 0.36
23 0.31
24 0.29
25 0.27
26 0.27
27 0.24
28 0.25
29 0.2
30 0.18
31 0.18
32 0.17
33 0.17
34 0.18
35 0.18
36 0.17
37 0.17
38 0.15
39 0.13
40 0.14
41 0.17
42 0.17
43 0.2
44 0.2
45 0.2
46 0.28
47 0.32
48 0.32
49 0.31
50 0.31
51 0.3
52 0.35
53 0.34
54 0.28
55 0.27
56 0.28
57 0.27
58 0.29
59 0.3
60 0.24
61 0.27
62 0.3
63 0.27
64 0.26
65 0.29
66 0.26
67 0.31
68 0.33
69 0.34
70 0.3
71 0.34
72 0.34
73 0.31
74 0.37
75 0.31
76 0.32
77 0.29
78 0.3
79 0.26
80 0.26
81 0.26
82 0.19
83 0.17
84 0.14
85 0.13
86 0.1
87 0.11
88 0.12
89 0.15
90 0.14
91 0.19
92 0.26
93 0.27
94 0.29
95 0.31
96 0.39
97 0.38
98 0.47
99 0.45
100 0.42
101 0.41
102 0.42
103 0.48
104 0.43
105 0.49
106 0.46
107 0.45
108 0.42
109 0.42
110 0.41
111 0.34
112 0.29
113 0.21
114 0.16
115 0.15
116 0.13
117 0.11
118 0.09
119 0.07
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.1
124 0.13
125 0.21
126 0.22
127 0.22
128 0.21
129 0.22
130 0.22
131 0.19
132 0.2
133 0.12
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.1
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.09
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.12
172 0.11
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.19
177 0.2
178 0.25
179 0.26
180 0.27
181 0.25
182 0.25
183 0.28
184 0.26
185 0.27
186 0.24
187 0.31
188 0.35
189 0.39
190 0.37
191 0.35
192 0.32
193 0.29
194 0.28
195 0.21
196 0.17
197 0.12
198 0.13
199 0.13
200 0.13
201 0.15
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.21
206 0.21
207 0.21
208 0.24
209 0.24
210 0.24
211 0.23
212 0.22
213 0.17
214 0.16
215 0.15
216 0.11
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.1
227 0.12
228 0.13
229 0.16
230 0.2
231 0.2
232 0.23
233 0.26
234 0.3
235 0.3
236 0.39
237 0.41
238 0.45
239 0.49
240 0.55
241 0.56
242 0.57
243 0.58
244 0.59
245 0.6
246 0.61
247 0.65
248 0.66
249 0.65
250 0.6
251 0.65
252 0.6
253 0.58
254 0.58
255 0.59
256 0.59
257 0.64
258 0.67
259 0.64
260 0.65
261 0.63
262 0.56
263 0.51
264 0.47
265 0.42
266 0.45
267 0.42
268 0.43
269 0.45
270 0.5
271 0.53
272 0.54
273 0.61
274 0.6
275 0.69
276 0.72
277 0.77
278 0.8
279 0.84
280 0.84
281 0.85
282 0.87
283 0.82
284 0.84
285 0.83
286 0.81
287 0.81
288 0.83
289 0.77
290 0.78
291 0.81
292 0.76
293 0.77
294 0.78
295 0.75
296 0.77
297 0.77
298 0.74
299 0.75
300 0.78
301 0.74
302 0.75
303 0.77
304 0.71
305 0.75
306 0.75
307 0.7
308 0.72
309 0.72
310 0.66
311 0.68
312 0.72
313 0.71
314 0.75
315 0.72
316 0.66
317 0.68
318 0.71
319 0.69
320 0.7
321 0.7
322 0.65
323 0.7
324 0.74
325 0.73
326 0.74
327 0.73
328 0.71
329 0.72
330 0.77
331 0.77
332 0.77
333 0.75
334 0.76
335 0.72
336 0.66
337 0.58
338 0.52
339 0.44
340 0.36
341 0.34
342 0.25
343 0.22
344 0.19
345 0.17
346 0.12
347 0.14
348 0.14
349 0.11
350 0.16
351 0.23
352 0.34
353 0.43
354 0.47
355 0.52
356 0.63
357 0.72
358 0.77
359 0.78
360 0.77
361 0.79
362 0.84
363 0.84
364 0.78
365 0.78
366 0.7
367 0.62
368 0.56
369 0.47
370 0.43
371 0.39
372 0.37
373 0.35
374 0.41
375 0.49
376 0.52
377 0.58
378 0.58
379 0.65
380 0.69
381 0.7
382 0.7
383 0.69
384 0.7
385 0.65
386 0.59
387 0.51
388 0.43
389 0.39
390 0.33
391 0.27
392 0.31
393 0.37
394 0.45