Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y8D3L3

Protein Details
Accession A0A4Y8D3L3    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MAPKMPLRPAAKNKRKEPPYPSSNHydrophilic
96-126PRDMRRRTASHNVKRVPKRLQKRGAREMKEDBasic
186-210LNEPQKPPSKFRKRQIHKTWLPTHLHydrophilic
600-626EVEQRLKRKREWDKRPKGKRVEWKSLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-19RPAAKNKRKEPP
100-203RRRTASHNVKRVPKRLQKRGAREMKEDNTPTVNANKRKPGSSRGRIRAETAKKLGILADKKRASKGATNVAGIITRAARPKIRKNALNEPQKPPSKFRKRQIHK
605-621LKRKREWDKRPKGKRVE
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito_nucl 13, mito 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039182  Pop1  
IPR009723  Pop1_N  
IPR012590  POPLD_dom  
Gene Ontology GO:0005655  C:nucleolar ribonuclease P complex  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0001682  P:tRNA 5'-leader removal  
Pfam View protein in Pfam  
PF06978  POP1  
PF08170  POPLD  
Amino Acid Sequences MAPKMPLRPAAKNKRKEPPYPSSNGRNDAGRGPAMKRNKIMDARSIMTQTADAALKNGDLDLQSFLNAREYEIKALEDGMKRSKGALSTRAFQQVPRDMRRRTASHNVKRVPKRLQKRGAREMKEDNTPTVNANKRKPGSSRGRIRAETAKKLGILADKKRASKGATNVAGIITRAARPKIRKNALNEPQKPPSKFRKRQIHKTWLPTHLWHAKRAKMTEPKEPLWRMAIPLNSTEKSYRPTHRAGGSRGAVVWDMSYMSTIGLKGSVESIEKVLLAIGIPEMDVNSAKGAKWRAGRRSWNGWLSREVKEQRLQIGPAVAFWDIHEDSDSNATNVSKKSMRQVLIRIHPSAFLEAWTELLRLSKLQHPTVQLEDLRFEMGSIEITGPGSTEALIGILHPYFQSEDDQEPHAQTFTSLAGVTNPASLPANSVLSFSIMDPRLRYQPRKVELPDPADEEANFELAELLSSWPADQSPASSHLFDRDTRYKATRLPSQKALNRRKTLAPPGTFPSISERDPPIPIMLLASRMSNSSAAQGSWTLIAPWKCILPIWYGLMHFPLSSGANPRFGGLQELRQSHFEHGVPWFPADYPGTNAGYAWEVEQRLKRKREWDKRPKGKRVEWKSLDLGGGRKGELGLGWACDFEKVAGLSKLPDNEQSNATSGDGSETTAEPKDKTVENPFNQLSSRTFSSLLSSPMAELTASTELTTIRLTLLTRGVATPSARIYRLPAESTISEDSINSTSTTHSTLRQEWLSLVPAPLHKKPPPNTKAKDLKNIGKIPFNTPLPQRVQLLTKSLLQNPPLQYPKEKNDSDNHPMVPGEEDLVGFVTTGEYNLAEGKGIAFGTVFAREMVKETRSRGLREGCLCVVRNAGETVGRLARWESA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.86
3 0.84
4 0.82
5 0.81
6 0.8
7 0.78
8 0.77
9 0.76
10 0.76
11 0.72
12 0.65
13 0.59
14 0.53
15 0.49
16 0.45
17 0.39
18 0.35
19 0.34
20 0.4
21 0.45
22 0.48
23 0.5
24 0.5
25 0.55
26 0.59
27 0.59
28 0.59
29 0.56
30 0.52
31 0.51
32 0.47
33 0.39
34 0.32
35 0.29
36 0.21
37 0.18
38 0.17
39 0.13
40 0.13
41 0.13
42 0.13
43 0.12
44 0.12
45 0.09
46 0.09
47 0.1
48 0.11
49 0.11
50 0.12
51 0.13
52 0.13
53 0.18
54 0.17
55 0.18
56 0.23
57 0.25
58 0.27
59 0.27
60 0.27
61 0.22
62 0.24
63 0.28
64 0.25
65 0.27
66 0.3
67 0.31
68 0.3
69 0.32
70 0.32
71 0.32
72 0.33
73 0.38
74 0.36
75 0.39
76 0.43
77 0.49
78 0.46
79 0.42
80 0.45
81 0.46
82 0.5
83 0.54
84 0.58
85 0.53
86 0.6
87 0.66
88 0.63
89 0.61
90 0.64
91 0.66
92 0.68
93 0.76
94 0.76
95 0.78
96 0.82
97 0.82
98 0.82
99 0.81
100 0.81
101 0.82
102 0.85
103 0.85
104 0.86
105 0.89
106 0.88
107 0.84
108 0.8
109 0.78
110 0.72
111 0.71
112 0.63
113 0.55
114 0.47
115 0.43
116 0.39
117 0.38
118 0.42
119 0.41
120 0.45
121 0.52
122 0.52
123 0.57
124 0.59
125 0.6
126 0.63
127 0.66
128 0.7
129 0.69
130 0.74
131 0.7
132 0.71
133 0.71
134 0.67
135 0.65
136 0.58
137 0.52
138 0.44
139 0.43
140 0.4
141 0.38
142 0.38
143 0.36
144 0.42
145 0.44
146 0.46
147 0.48
148 0.49
149 0.46
150 0.45
151 0.46
152 0.46
153 0.44
154 0.43
155 0.41
156 0.38
157 0.34
158 0.27
159 0.22
160 0.13
161 0.13
162 0.16
163 0.18
164 0.24
165 0.31
166 0.41
167 0.5
168 0.57
169 0.6
170 0.63
171 0.72
172 0.75
173 0.79
174 0.75
175 0.71
176 0.72
177 0.74
178 0.7
179 0.66
180 0.68
181 0.69
182 0.72
183 0.75
184 0.77
185 0.79
186 0.88
187 0.9
188 0.9
189 0.87
190 0.87
191 0.85
192 0.8
193 0.74
194 0.64
195 0.62
196 0.6
197 0.54
198 0.52
199 0.5
200 0.49
201 0.51
202 0.52
203 0.52
204 0.53
205 0.55
206 0.56
207 0.57
208 0.56
209 0.58
210 0.57
211 0.5
212 0.44
213 0.41
214 0.34
215 0.32
216 0.31
217 0.24
218 0.26
219 0.3
220 0.26
221 0.27
222 0.26
223 0.24
224 0.26
225 0.31
226 0.33
227 0.34
228 0.37
229 0.41
230 0.46
231 0.49
232 0.48
233 0.49
234 0.45
235 0.4
236 0.36
237 0.31
238 0.25
239 0.19
240 0.15
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.09
258 0.08
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.06
263 0.05
264 0.05
265 0.04
266 0.03
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.06
274 0.07
275 0.07
276 0.11
277 0.13
278 0.17
279 0.24
280 0.31
281 0.37
282 0.44
283 0.52
284 0.54
285 0.61
286 0.62
287 0.62
288 0.59
289 0.54
290 0.53
291 0.49
292 0.45
293 0.45
294 0.42
295 0.39
296 0.4
297 0.4
298 0.38
299 0.36
300 0.33
301 0.26
302 0.27
303 0.22
304 0.18
305 0.17
306 0.13
307 0.1
308 0.1
309 0.13
310 0.1
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.14
316 0.14
317 0.09
318 0.1
319 0.1
320 0.13
321 0.13
322 0.16
323 0.15
324 0.16
325 0.22
326 0.28
327 0.3
328 0.31
329 0.37
330 0.4
331 0.45
332 0.47
333 0.43
334 0.36
335 0.35
336 0.32
337 0.27
338 0.2
339 0.13
340 0.11
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.07
349 0.09
350 0.13
351 0.17
352 0.19
353 0.21
354 0.23
355 0.25
356 0.26
357 0.27
358 0.23
359 0.2
360 0.19
361 0.16
362 0.14
363 0.12
364 0.1
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.04
377 0.04
378 0.03
379 0.04
380 0.04
381 0.03
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.07
390 0.08
391 0.1
392 0.12
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.12
398 0.1
399 0.09
400 0.08
401 0.06
402 0.06
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.07
407 0.07
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.09
416 0.08
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.09
421 0.07
422 0.12
423 0.12
424 0.12
425 0.12
426 0.14
427 0.21
428 0.25
429 0.28
430 0.29
431 0.36
432 0.39
433 0.44
434 0.44
435 0.42
436 0.43
437 0.44
438 0.39
439 0.34
440 0.31
441 0.26
442 0.23
443 0.2
444 0.15
445 0.11
446 0.09
447 0.06
448 0.06
449 0.05
450 0.05
451 0.04
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.05
459 0.04
460 0.05
461 0.07
462 0.11
463 0.12
464 0.13
465 0.13
466 0.15
467 0.17
468 0.17
469 0.22
470 0.24
471 0.25
472 0.27
473 0.3
474 0.28
475 0.31
476 0.35
477 0.36
478 0.38
479 0.4
480 0.44
481 0.49
482 0.51
483 0.58
484 0.63
485 0.64
486 0.6
487 0.59
488 0.57
489 0.55
490 0.6
491 0.57
492 0.48
493 0.42
494 0.42
495 0.43
496 0.38
497 0.33
498 0.3
499 0.25
500 0.24
501 0.25
502 0.24
503 0.22
504 0.23
505 0.23
506 0.17
507 0.14
508 0.13
509 0.11
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.09
514 0.08
515 0.09
516 0.09
517 0.09
518 0.09
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.09
525 0.09
526 0.08
527 0.06
528 0.1
529 0.1
530 0.11
531 0.11
532 0.11
533 0.1
534 0.11
535 0.11
536 0.1
537 0.12
538 0.13
539 0.13
540 0.13
541 0.14
542 0.14
543 0.13
544 0.11
545 0.09
546 0.08
547 0.08
548 0.09
549 0.14
550 0.13
551 0.16
552 0.16
553 0.17
554 0.16
555 0.15
556 0.2
557 0.16
558 0.2
559 0.22
560 0.25
561 0.26
562 0.27
563 0.28
564 0.25
565 0.27
566 0.22
567 0.18
568 0.17
569 0.19
570 0.18
571 0.17
572 0.15
573 0.12
574 0.14
575 0.14
576 0.13
577 0.12
578 0.15
579 0.15
580 0.15
581 0.14
582 0.13
583 0.13
584 0.12
585 0.1
586 0.1
587 0.1
588 0.14
589 0.19
590 0.26
591 0.34
592 0.38
593 0.41
594 0.49
595 0.59
596 0.67
597 0.73
598 0.77
599 0.8
600 0.86
601 0.93
602 0.93
603 0.91
604 0.89
605 0.88
606 0.86
607 0.85
608 0.78
609 0.73
610 0.66
611 0.59
612 0.51
613 0.42
614 0.35
615 0.28
616 0.25
617 0.19
618 0.17
619 0.15
620 0.13
621 0.11
622 0.12
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.09
629 0.09
630 0.07
631 0.08
632 0.07
633 0.1
634 0.11
635 0.11
636 0.13
637 0.15
638 0.17
639 0.16
640 0.21
641 0.22
642 0.23
643 0.25
644 0.24
645 0.23
646 0.22
647 0.21
648 0.16
649 0.13
650 0.12
651 0.11
652 0.1
653 0.09
654 0.09
655 0.11
656 0.13
657 0.14
658 0.13
659 0.14
660 0.17
661 0.18
662 0.22
663 0.29
664 0.36
665 0.37
666 0.44
667 0.43
668 0.41
669 0.4
670 0.38
671 0.31
672 0.27
673 0.27
674 0.22
675 0.22
676 0.2
677 0.24
678 0.23
679 0.23
680 0.19
681 0.17
682 0.16
683 0.15
684 0.15
685 0.11
686 0.08
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.11
694 0.11
695 0.08
696 0.07
697 0.08
698 0.09
699 0.1
700 0.13
701 0.12
702 0.13
703 0.13
704 0.14
705 0.16
706 0.16
707 0.16
708 0.18
709 0.2
710 0.2
711 0.2
712 0.22
713 0.25
714 0.28
715 0.28
716 0.25
717 0.26
718 0.26
719 0.29
720 0.28
721 0.23
722 0.2
723 0.18
724 0.19
725 0.16
726 0.16
727 0.12
728 0.11
729 0.11
730 0.13
731 0.17
732 0.16
733 0.19
734 0.23
735 0.26
736 0.31
737 0.31
738 0.3
739 0.28
740 0.29
741 0.27
742 0.24
743 0.21
744 0.18
745 0.23
746 0.27
747 0.31
748 0.36
749 0.39
750 0.46
751 0.54
752 0.63
753 0.66
754 0.71
755 0.71
756 0.74
757 0.79
758 0.77
759 0.79
760 0.76
761 0.76
762 0.74
763 0.76
764 0.68
765 0.66
766 0.61
767 0.56
768 0.56
769 0.5
770 0.46
771 0.43
772 0.47
773 0.45
774 0.46
775 0.44
776 0.4
777 0.41
778 0.39
779 0.41
780 0.36
781 0.36
782 0.37
783 0.4
784 0.42
785 0.39
786 0.44
787 0.42
788 0.48
789 0.47
790 0.46
791 0.47
792 0.5
793 0.56
794 0.58
795 0.57
796 0.53
797 0.56
798 0.61
799 0.61
800 0.6
801 0.52
802 0.45
803 0.42
804 0.38
805 0.33
806 0.25
807 0.19
808 0.13
809 0.12
810 0.11
811 0.12
812 0.11
813 0.08
814 0.08
815 0.08
816 0.07
817 0.07
818 0.08
819 0.07
820 0.07
821 0.09
822 0.1
823 0.08
824 0.08
825 0.09
826 0.1
827 0.09
828 0.09
829 0.07
830 0.08
831 0.1
832 0.11
833 0.11
834 0.1
835 0.11
836 0.12
837 0.16
838 0.19
839 0.22
840 0.25
841 0.28
842 0.36
843 0.4
844 0.44
845 0.48
846 0.51
847 0.54
848 0.54
849 0.56
850 0.51
851 0.52
852 0.5
853 0.44
854 0.4
855 0.33
856 0.31
857 0.26
858 0.24
859 0.2
860 0.19
861 0.23
862 0.22
863 0.21
864 0.2