Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y8CTH8

Protein Details
Accession A0A4Y8CTH8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
120-144DEAPTGRKKGKKRGAKGGRGRKPGIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
125-150GRKKGKKRGAKGGRGRKPGIRGPRKA
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, pero 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039340  Tfc4/TFIIIC-102/Sfc4  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
Pfam View protein in Pfam  
PF13181  TPR_8  
Amino Acid Sequences MTGYSHDISPAHAFTGQGHQYPDPEASQSQDLIWPTHASTPAQGTGGFSLDNARAEFAAASTEQRNQRREQVEGVDDILDMDFGGDSDDSDPDYREFGKGIRKMQNEVRQARHLDSDDSDEAPTGRKKGKKRGAKGGRGRKPGIRGPRKAAEPTGDIKLRLGQANHAFLNGRCEEARDIAAEIVRINAETYEAWTLLSACFKELGEYNSAVKALMVAATWRPKHPGAWYAALNFALNETGDLRSEFLISAQYAAQQILRADSQDLEARRIKASLMLERRNLSHAAKEFEIILKRCPFDTEVIQTLASIYVDRGQVEVAMKLYTKSLDKFKKADAEIDTPFGWTDAYAYVELFGLMEKYTEGIKELRSVARWLVGRGKEDFWDQFVDDDREWDDDHIRRSGCSQFDAKTFPLDTYGPGLPVELRVKLGLYRLFLGHYTEAMRHFSFLKASDYNGQGLIEEFPHLFEEVADALADKGYDKDALDYYLPLAPGVGSEGASLQFKMGKCWLCEKSDQEAELCFQNAVQMEVDNIPARMELAKLYERLNEKDQSFMYVNEIIAIRRTQRQNENPSFGTGSSDPAPSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.27
3 0.27
4 0.26
5 0.28
6 0.28
7 0.28
8 0.3
9 0.31
10 0.23
11 0.23
12 0.21
13 0.22
14 0.23
15 0.22
16 0.21
17 0.22
18 0.22
19 0.21
20 0.22
21 0.2
22 0.19
23 0.23
24 0.24
25 0.21
26 0.23
27 0.25
28 0.25
29 0.24
30 0.23
31 0.19
32 0.18
33 0.18
34 0.16
35 0.11
36 0.13
37 0.14
38 0.16
39 0.15
40 0.14
41 0.13
42 0.14
43 0.14
44 0.1
45 0.11
46 0.1
47 0.12
48 0.14
49 0.21
50 0.28
51 0.35
52 0.39
53 0.4
54 0.49
55 0.5
56 0.51
57 0.49
58 0.47
59 0.43
60 0.4
61 0.37
62 0.28
63 0.24
64 0.22
65 0.16
66 0.1
67 0.07
68 0.06
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.1
78 0.11
79 0.11
80 0.13
81 0.14
82 0.13
83 0.14
84 0.16
85 0.24
86 0.28
87 0.35
88 0.42
89 0.43
90 0.48
91 0.56
92 0.61
93 0.61
94 0.63
95 0.61
96 0.59
97 0.59
98 0.56
99 0.52
100 0.45
101 0.38
102 0.33
103 0.33
104 0.29
105 0.27
106 0.25
107 0.2
108 0.19
109 0.2
110 0.21
111 0.2
112 0.25
113 0.31
114 0.38
115 0.49
116 0.59
117 0.65
118 0.7
119 0.77
120 0.81
121 0.85
122 0.87
123 0.87
124 0.87
125 0.84
126 0.79
127 0.73
128 0.69
129 0.66
130 0.67
131 0.65
132 0.62
133 0.62
134 0.65
135 0.64
136 0.6
137 0.55
138 0.48
139 0.42
140 0.39
141 0.38
142 0.33
143 0.29
144 0.27
145 0.28
146 0.26
147 0.26
148 0.23
149 0.23
150 0.25
151 0.29
152 0.28
153 0.26
154 0.24
155 0.22
156 0.27
157 0.21
158 0.19
159 0.15
160 0.17
161 0.17
162 0.18
163 0.18
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.11
169 0.1
170 0.09
171 0.08
172 0.07
173 0.06
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.08
184 0.1
185 0.09
186 0.08
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.09
200 0.07
201 0.06
202 0.05
203 0.05
204 0.08
205 0.13
206 0.15
207 0.15
208 0.19
209 0.19
210 0.21
211 0.23
212 0.26
213 0.24
214 0.27
215 0.28
216 0.25
217 0.26
218 0.24
219 0.21
220 0.15
221 0.11
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.07
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.11
251 0.12
252 0.14
253 0.17
254 0.18
255 0.18
256 0.18
257 0.16
258 0.17
259 0.18
260 0.21
261 0.25
262 0.27
263 0.29
264 0.3
265 0.31
266 0.29
267 0.29
268 0.22
269 0.2
270 0.19
271 0.19
272 0.18
273 0.18
274 0.16
275 0.17
276 0.2
277 0.17
278 0.18
279 0.18
280 0.19
281 0.18
282 0.19
283 0.18
284 0.16
285 0.18
286 0.17
287 0.16
288 0.17
289 0.17
290 0.15
291 0.14
292 0.12
293 0.09
294 0.06
295 0.05
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.09
303 0.09
304 0.07
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.08
309 0.08
310 0.09
311 0.11
312 0.19
313 0.25
314 0.28
315 0.3
316 0.32
317 0.38
318 0.37
319 0.39
320 0.34
321 0.33
322 0.3
323 0.3
324 0.27
325 0.21
326 0.2
327 0.15
328 0.11
329 0.07
330 0.07
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.05
346 0.05
347 0.07
348 0.07
349 0.08
350 0.11
351 0.13
352 0.14
353 0.15
354 0.17
355 0.16
356 0.19
357 0.19
358 0.18
359 0.23
360 0.24
361 0.25
362 0.26
363 0.26
364 0.23
365 0.25
366 0.24
367 0.18
368 0.18
369 0.16
370 0.15
371 0.17
372 0.18
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.15
377 0.15
378 0.15
379 0.17
380 0.17
381 0.2
382 0.22
383 0.22
384 0.21
385 0.23
386 0.27
387 0.24
388 0.24
389 0.24
390 0.23
391 0.25
392 0.28
393 0.26
394 0.24
395 0.23
396 0.2
397 0.19
398 0.17
399 0.16
400 0.17
401 0.16
402 0.14
403 0.13
404 0.13
405 0.11
406 0.15
407 0.16
408 0.12
409 0.13
410 0.12
411 0.13
412 0.14
413 0.17
414 0.15
415 0.15
416 0.16
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.18
421 0.15
422 0.14
423 0.14
424 0.14
425 0.15
426 0.18
427 0.18
428 0.16
429 0.17
430 0.17
431 0.18
432 0.17
433 0.21
434 0.18
435 0.2
436 0.24
437 0.24
438 0.24
439 0.23
440 0.21
441 0.16
442 0.16
443 0.15
444 0.1
445 0.1
446 0.09
447 0.09
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.08
452 0.09
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.05
461 0.06
462 0.07
463 0.08
464 0.08
465 0.11
466 0.11
467 0.14
468 0.14
469 0.14
470 0.14
471 0.15
472 0.15
473 0.12
474 0.11
475 0.09
476 0.08
477 0.1
478 0.09
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.13
487 0.13
488 0.16
489 0.22
490 0.25
491 0.26
492 0.35
493 0.39
494 0.38
495 0.44
496 0.45
497 0.47
498 0.47
499 0.46
500 0.39
501 0.36
502 0.34
503 0.31
504 0.27
505 0.18
506 0.13
507 0.15
508 0.15
509 0.15
510 0.13
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.16
515 0.14
516 0.13
517 0.12
518 0.11
519 0.12
520 0.11
521 0.11
522 0.1
523 0.14
524 0.17
525 0.19
526 0.2
527 0.26
528 0.3
529 0.34
530 0.38
531 0.4
532 0.37
533 0.41
534 0.4
535 0.4
536 0.37
537 0.32
538 0.31
539 0.27
540 0.26
541 0.23
542 0.24
543 0.18
544 0.2
545 0.22
546 0.21
547 0.27
548 0.34
549 0.39
550 0.49
551 0.58
552 0.66
553 0.72
554 0.76
555 0.69
556 0.66
557 0.6
558 0.5
559 0.46
560 0.36
561 0.31
562 0.26