FuNGI

A0A4Y8D3T6

Protein Details

Accession

A0A4Y8D3T6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
459-480	EHKRMIKQKKAEKRGSKTQQNG	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
461-475	KRMIKQKKAEKRGSK
546-571	HGGRGRGRGRGDRGRGDWGRGRGRGG

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, cyto_nucl 16, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR038664 Gar1/Naf1_Cbf5-bd_sf IPR007504 H/ACA_rnp_Gar1/Naf1 IPR040309 Naf1 IPR009000 Transl_B-barrel_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0005732 C:sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex GO:0003723 F:RNA binding GO:0000493 P:box H/ACA snoRNP assembly GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0042254 P:ribosome biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04410 Gar1

Amino Acid Sequences

MSNPDSISSIPPQEEKLHRKGESERSAPSSSTFSNIPGLGRLGNAPKSENPTPSAENNLAENHLKELATPKDNLPESSHDQAQEDFKMADAEPLLQESATSMTNDATSEHLPESKKQILQETGVNIEQVKGQNNSDAKQAALEEVIVAKQDTDNDAMDIATSQPTTDTHVEQGKEMKSEESLGTQPSTSDIQAQESLANQPDLTHALEAMLGGLLQPATATVTADAATNNASAAPATEEEHPEWEVDSSPYESSSDSSSDSSSEDDSEEEDGENAYKLLSPEEQARILMTEGDGGSDDEGAAHGEKRAGGHLRTKNEVPEEVIPKPDVTITPEMPITKLGDVEGVVDNIILIKAFTSGEYQVLREESVLCLQDRSVIGVVSETLGRVEQPLYCVRFTNAAAIAEAGISVGTTVYYSEQHSTYVFTQALKAYKGTDASNLYDEEVGDEEMEFSDDEKEAEHKRMIKQKKAEKRGSKTQQNGGHSRGGHASQKTYTPGNNSAVLNYDEAEDGPYKTLTRPIGFTGGATGSEAPQEGSHYNRSSQRGDHGGRGRGRGRGDRGRGDWGRGRGRGGGHNDRNTNSRNNSSQSSHALPASTPSPGAFNSQSASLPPKPNFPPPPPSNIYGNPNQPQQYQPQPSPQYPSQQPPVWPMYPQGYQQPYQQPYQQPQQPQQPFAQAQNPWAGMPPPPPLPAGAFINPAFFAQQNGANQNGANQWTHPGQQNGNGGSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.46
3	0.5
4	0.55
5	0.54
6	0.57
7	0.62
8	0.65
9	0.64
10	0.61
11	0.58
12	0.55
13	0.56
14	0.52
15	0.46
16	0.4
17	0.32
18	0.31
19	0.26
20	0.22
21	0.24
22	0.24
23	0.22
24	0.19
25	0.2
26	0.18
27	0.18
28	0.2
29	0.21
30	0.25
31	0.25
32	0.27
33	0.3
34	0.37
35	0.41
36	0.4
37	0.38
38	0.39
39	0.41
40	0.4
41	0.43
42	0.37
43	0.34
44	0.33
45	0.32
46	0.3
47	0.28
48	0.26
49	0.21
50	0.21
51	0.2
52	0.18
53	0.23
54	0.27
55	0.28
56	0.3
57	0.29
58	0.35
59	0.37
60	0.38
61	0.35
62	0.35
63	0.38
64	0.41
65	0.42
66	0.35
67	0.35
68	0.35
69	0.35
70	0.3
71	0.25
72	0.2
73	0.18
74	0.19
75	0.17
76	0.17
77	0.14
78	0.14
79	0.12
80	0.14
81	0.13
82	0.11
83	0.11
84	0.09
85	0.1
86	0.09
87	0.1
88	0.09
89	0.09
90	0.1
91	0.1
92	0.1
93	0.12
94	0.12
95	0.13
96	0.14
97	0.18
98	0.19
99	0.22
100	0.29
101	0.32
102	0.33
103	0.33
104	0.38
105	0.37
106	0.38
107	0.39
108	0.34
109	0.32
110	0.3
111	0.28
112	0.21
113	0.19
114	0.2
115	0.18
116	0.2
117	0.19
118	0.19
119	0.25
120	0.27
121	0.27
122	0.27
123	0.26
124	0.22
125	0.21
126	0.2
127	0.15
128	0.13
129	0.12
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.07
134	0.07
135	0.06
136	0.07
137	0.08
138	0.1
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.11
144	0.1
145	0.09
146	0.08
147	0.08
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.08
152	0.13
153	0.15
154	0.15
155	0.18
156	0.24
157	0.24
158	0.25
159	0.3
160	0.27
161	0.26
162	0.26
163	0.22
164	0.18
165	0.2
166	0.19
167	0.16
168	0.16
169	0.16
170	0.16
171	0.15
172	0.14
173	0.14
174	0.15
175	0.12
176	0.15
177	0.13
178	0.16
179	0.16
180	0.17
181	0.15
182	0.15
183	0.17
184	0.14
185	0.14
186	0.11
187	0.1
188	0.11
189	0.12
190	0.12
191	0.1
192	0.08
193	0.08
194	0.08
195	0.08
196	0.07
197	0.05
198	0.03
199	0.03
200	0.04
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.04
206	0.04
207	0.05
208	0.04
209	0.05
210	0.06
211	0.06
212	0.06
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.05
218	0.05
219	0.04
220	0.05
221	0.06
222	0.06
223	0.08
224	0.1
225	0.12
226	0.13
227	0.14
228	0.14
229	0.13
230	0.12
231	0.11
232	0.11
233	0.09
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.1
238	0.1
239	0.1
240	0.1
241	0.11
242	0.1
243	0.1
244	0.11
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.11
249	0.1
250	0.1
251	0.09
252	0.08
253	0.09
254	0.09
255	0.09
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.07
260	0.07
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.06
265	0.07
266	0.07
267	0.08
268	0.12
269	0.14
270	0.14
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.12
275	0.11
276	0.07
277	0.07
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.05
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.04
289	0.05
290	0.05
291	0.05
292	0.06
293	0.07
294	0.1
295	0.12
296	0.13
297	0.21
298	0.26
299	0.29
300	0.31
301	0.32
302	0.31
303	0.3
304	0.29
305	0.23
306	0.23
307	0.24
308	0.21
309	0.22
310	0.19
311	0.18
312	0.17
313	0.16
314	0.11
315	0.11
316	0.14
317	0.13
318	0.14
319	0.15
320	0.15
321	0.14
322	0.15
323	0.12
324	0.09
325	0.09
326	0.08
327	0.07
328	0.07
329	0.08
330	0.08
331	0.06
332	0.06
333	0.06
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.03
338	0.02
339	0.02
340	0.03
341	0.03
342	0.04
343	0.05
344	0.06
345	0.08
346	0.09
347	0.09
348	0.09
349	0.09
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.08
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.08
359	0.1
360	0.1
361	0.11
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.08
366	0.08
367	0.06
368	0.06
369	0.04
370	0.04
371	0.04
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.07
377	0.11
378	0.13
379	0.14
380	0.14
381	0.14
382	0.16
383	0.16
384	0.17
385	0.15
386	0.13
387	0.13
388	0.12
389	0.11
390	0.08
391	0.08
392	0.05
393	0.03
394	0.02
395	0.02
396	0.02
397	0.02
398	0.02
399	0.03
400	0.04
401	0.05
402	0.06
403	0.08
404	0.09
405	0.09
406	0.1
407	0.12
408	0.12
409	0.14
410	0.13
411	0.12
412	0.13
413	0.15
414	0.16
415	0.15
416	0.14
417	0.12
418	0.13
419	0.15
420	0.14
421	0.15
422	0.15
423	0.16
424	0.17
425	0.16
426	0.15
427	0.14
428	0.13
429	0.1
430	0.09
431	0.08
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.06
437	0.05
438	0.05
439	0.06
440	0.06
441	0.06
442	0.06
443	0.1
444	0.11
445	0.14
446	0.16
447	0.2
448	0.25
449	0.35
450	0.41
451	0.46
452	0.53
453	0.6
454	0.67
455	0.73
456	0.77
457	0.77
458	0.78
459	0.81
460	0.82
461	0.81
462	0.77
463	0.75
464	0.71
465	0.68
466	0.64
467	0.56
468	0.51
469	0.42
470	0.38
471	0.33
472	0.29
473	0.28
474	0.25
475	0.24
476	0.21
477	0.23
478	0.24
479	0.24
480	0.23
481	0.23
482	0.26
483	0.26
484	0.28
485	0.26
486	0.24
487	0.25
488	0.24
489	0.19
490	0.15
491	0.13
492	0.1
493	0.1
494	0.11
495	0.09
496	0.09
497	0.1
498	0.1
499	0.1
500	0.11
501	0.16
502	0.17
503	0.18
504	0.19
505	0.2
506	0.22
507	0.22
508	0.21
509	0.18
510	0.15
511	0.14
512	0.13
513	0.11
514	0.08
515	0.08
516	0.09
517	0.07
518	0.06
519	0.09
520	0.09
521	0.12
522	0.18
523	0.19
524	0.23
525	0.28
526	0.32
527	0.33
528	0.34
529	0.36
530	0.39
531	0.4
532	0.44
533	0.44
534	0.47
535	0.47
536	0.52
537	0.49
538	0.45
539	0.47
540	0.45
541	0.47
542	0.49
543	0.52
544	0.52
545	0.51
546	0.56
547	0.54
548	0.52
549	0.5
550	0.49
551	0.5
552	0.45
553	0.44
554	0.38
555	0.4
556	0.41
557	0.43
558	0.46
559	0.47
560	0.52
561	0.54
562	0.53
563	0.54
564	0.51
565	0.5
566	0.45
567	0.43
568	0.41
569	0.43
570	0.45
571	0.44
572	0.44
573	0.42
574	0.41
575	0.37
576	0.33
577	0.29
578	0.25
579	0.25
580	0.22
581	0.17
582	0.13
583	0.12
584	0.13
585	0.13
586	0.17
587	0.15
588	0.15
589	0.16
590	0.17
591	0.17
592	0.17
593	0.23
594	0.24
595	0.31
596	0.31
597	0.37
598	0.4
599	0.49
600	0.55
601	0.54
602	0.58
603	0.54
604	0.62
605	0.58
606	0.58
607	0.54
608	0.52
609	0.52
610	0.49
611	0.53
612	0.49
613	0.51
614	0.5
615	0.46
616	0.44
617	0.45
618	0.48
619	0.47
620	0.46
621	0.5
622	0.54
623	0.54
624	0.59
625	0.56
626	0.55
627	0.54
628	0.57
629	0.55
630	0.54
631	0.53
632	0.52
633	0.55
634	0.47
635	0.42
636	0.39
637	0.37
638	0.35
639	0.35
640	0.37
641	0.35
642	0.36
643	0.42
644	0.48
645	0.46
646	0.46
647	0.51
648	0.5
649	0.52
650	0.59
651	0.58
652	0.57
653	0.61
654	0.68
655	0.67
656	0.64
657	0.6
658	0.59
659	0.56
660	0.53
661	0.52
662	0.43
663	0.41
664	0.43
665	0.4
666	0.32
667	0.31
668	0.27
669	0.23
670	0.25
671	0.26
672	0.24
673	0.24
674	0.25
675	0.24
676	0.26
677	0.27
678	0.29
679	0.26
680	0.27
681	0.26
682	0.27
683	0.26
684	0.24
685	0.22
686	0.16
687	0.16
688	0.14
689	0.19
690	0.22
691	0.24
692	0.25
693	0.24
694	0.24
695	0.25
696	0.27
697	0.24
698	0.21
699	0.19
700	0.22
701	0.24
702	0.29
703	0.31
704	0.33
705	0.33
706	0.39
707	0.45

A0A4Y8D3T6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer