Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y8D7E2

Protein Details
Accession A0A4Y8D7E2    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
189-208AAGRSGKKIDRKKARLKIFDBasic
416-437SSPPSKRQQTPKTSPAKQKGKLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
192-206RSGKKIDRKKARLKI
426-450PKTSPAKQKGKLGKLGGKKAPSPSP
464-482AIKVRPKRGMLGKIGGKKK
553-581EERADKKRAILKRELEAKSKAPAKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 12.666, cyto_nucl 12.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MAAWRPLKLSDSAGAQLPPFLISSEFNNDSYLVRLTDLTHTWVESVDRDAIIERIREGNTSIDPSVDDDQLSIFLEKIRLGLAGEKDTNLSLQVGPDTGDNLSPSLLLHVTIRLPGGLKDLEWRYELALQTPKETVEKLLLPSLIALQEKKEKVEELVGLLEEKDVVIQKLVDTLESQGTDLGTIFHQAAGRSGKKIDRKKARLKIFDAEAWKQKSRSDKREDRWELLNNVFSGNDISPNLSKANSFDKEDRKHNWWEHMQGKRVGTLGSRLATNAIDSSRRSTQQEHTQTEDDFQVQSTPPHLSRPKVKPDVSMDDSTDDDDDDLDAPSQHSRVPNSLSISQARAPSPDRTLSPSPPKVKPLVKLGTKRKVPTPTPTSQNADDSTEDDEPIPASLNSTNVIYNNDNDTTDDDAPSSPPSKRQQTPKTSPAKQKGKLGKLGGKKAPSPSPESEPGPEPSFEAEAIKVRPKRGMLGKIGGKKKETASIPEIGSQTSVSPKKKLGMIGGKKAATGDASQIEDSSGEVNRGRGRALTTEETEQLKEKTPPPKETSEERADKKRAILKRELEAKSKAPAKKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.23
3 0.22
4 0.19
5 0.16
6 0.13
7 0.12
8 0.11
9 0.11
10 0.15
11 0.22
12 0.24
13 0.24
14 0.24
15 0.24
16 0.23
17 0.25
18 0.23
19 0.16
20 0.14
21 0.15
22 0.16
23 0.19
24 0.2
25 0.22
26 0.2
27 0.2
28 0.19
29 0.2
30 0.19
31 0.16
32 0.18
33 0.16
34 0.15
35 0.15
36 0.16
37 0.17
38 0.19
39 0.19
40 0.17
41 0.19
42 0.2
43 0.2
44 0.21
45 0.22
46 0.21
47 0.24
48 0.23
49 0.19
50 0.19
51 0.21
52 0.23
53 0.2
54 0.17
55 0.13
56 0.14
57 0.14
58 0.15
59 0.12
60 0.09
61 0.1
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.15
69 0.16
70 0.2
71 0.21
72 0.21
73 0.21
74 0.21
75 0.2
76 0.16
77 0.15
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.1
86 0.1
87 0.1
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.1
97 0.1
98 0.11
99 0.12
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.14
104 0.12
105 0.12
106 0.18
107 0.2
108 0.21
109 0.21
110 0.21
111 0.19
112 0.23
113 0.23
114 0.21
115 0.25
116 0.24
117 0.25
118 0.25
119 0.25
120 0.22
121 0.22
122 0.19
123 0.16
124 0.18
125 0.18
126 0.2
127 0.19
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.15
132 0.14
133 0.13
134 0.13
135 0.21
136 0.22
137 0.23
138 0.23
139 0.21
140 0.21
141 0.24
142 0.22
143 0.16
144 0.16
145 0.15
146 0.14
147 0.13
148 0.11
149 0.08
150 0.07
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.07
156 0.07
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.09
169 0.08
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.09
175 0.09
176 0.12
177 0.17
178 0.18
179 0.19
180 0.21
181 0.25
182 0.33
183 0.42
184 0.48
185 0.54
186 0.62
187 0.71
188 0.77
189 0.81
190 0.79
191 0.75
192 0.71
193 0.63
194 0.58
195 0.53
196 0.47
197 0.45
198 0.43
199 0.41
200 0.36
201 0.35
202 0.42
203 0.46
204 0.51
205 0.54
206 0.59
207 0.64
208 0.74
209 0.76
210 0.69
211 0.65
212 0.6
213 0.54
214 0.46
215 0.42
216 0.31
217 0.26
218 0.23
219 0.17
220 0.14
221 0.11
222 0.1
223 0.08
224 0.09
225 0.09
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.11
231 0.17
232 0.18
233 0.21
234 0.25
235 0.33
236 0.37
237 0.43
238 0.45
239 0.43
240 0.48
241 0.47
242 0.49
243 0.44
244 0.46
245 0.48
246 0.48
247 0.48
248 0.45
249 0.43
250 0.37
251 0.34
252 0.27
253 0.2
254 0.18
255 0.15
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.08
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.12
267 0.14
268 0.16
269 0.18
270 0.2
271 0.25
272 0.33
273 0.4
274 0.39
275 0.4
276 0.4
277 0.38
278 0.36
279 0.31
280 0.22
281 0.14
282 0.12
283 0.1
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.1
289 0.16
290 0.18
291 0.2
292 0.29
293 0.35
294 0.43
295 0.48
296 0.48
297 0.46
298 0.49
299 0.54
300 0.49
301 0.44
302 0.35
303 0.29
304 0.29
305 0.25
306 0.2
307 0.12
308 0.08
309 0.06
310 0.06
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.1
320 0.11
321 0.13
322 0.16
323 0.18
324 0.21
325 0.23
326 0.23
327 0.22
328 0.23
329 0.24
330 0.23
331 0.21
332 0.19
333 0.2
334 0.21
335 0.22
336 0.22
337 0.21
338 0.25
339 0.28
340 0.31
341 0.37
342 0.42
343 0.45
344 0.46
345 0.48
346 0.48
347 0.48
348 0.46
349 0.46
350 0.46
351 0.47
352 0.54
353 0.6
354 0.63
355 0.64
356 0.62
357 0.6
358 0.6
359 0.57
360 0.57
361 0.55
362 0.52
363 0.52
364 0.54
365 0.52
366 0.46
367 0.46
368 0.38
369 0.33
370 0.28
371 0.24
372 0.22
373 0.18
374 0.17
375 0.14
376 0.13
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.14
389 0.13
390 0.14
391 0.17
392 0.17
393 0.16
394 0.16
395 0.18
396 0.19
397 0.18
398 0.17
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.16
403 0.17
404 0.13
405 0.2
406 0.27
407 0.35
408 0.41
409 0.5
410 0.58
411 0.66
412 0.73
413 0.76
414 0.78
415 0.78
416 0.82
417 0.82
418 0.82
419 0.75
420 0.76
421 0.76
422 0.73
423 0.72
424 0.68
425 0.65
426 0.64
427 0.68
428 0.63
429 0.58
430 0.54
431 0.53
432 0.52
433 0.48
434 0.47
435 0.42
436 0.44
437 0.45
438 0.44
439 0.42
440 0.39
441 0.39
442 0.35
443 0.31
444 0.26
445 0.23
446 0.21
447 0.19
448 0.17
449 0.14
450 0.15
451 0.18
452 0.25
453 0.26
454 0.27
455 0.31
456 0.31
457 0.37
458 0.41
459 0.46
460 0.44
461 0.49
462 0.54
463 0.59
464 0.64
465 0.61
466 0.54
467 0.51
468 0.48
469 0.47
470 0.42
471 0.4
472 0.38
473 0.39
474 0.39
475 0.39
476 0.38
477 0.31
478 0.28
479 0.22
480 0.19
481 0.22
482 0.28
483 0.26
484 0.29
485 0.32
486 0.35
487 0.38
488 0.4
489 0.4
490 0.44
491 0.49
492 0.55
493 0.59
494 0.55
495 0.51
496 0.49
497 0.4
498 0.31
499 0.24
500 0.19
501 0.16
502 0.18
503 0.18
504 0.18
505 0.17
506 0.15
507 0.15
508 0.13
509 0.1
510 0.11
511 0.12
512 0.16
513 0.19
514 0.2
515 0.2
516 0.2
517 0.23
518 0.24
519 0.3
520 0.31
521 0.31
522 0.34
523 0.37
524 0.37
525 0.36
526 0.35
527 0.31
528 0.3
529 0.32
530 0.35
531 0.41
532 0.47
533 0.53
534 0.56
535 0.61
536 0.62
537 0.64
538 0.66
539 0.67
540 0.68
541 0.67
542 0.7
543 0.68
544 0.65
545 0.65
546 0.65
547 0.62
548 0.6
549 0.63
550 0.6
551 0.64
552 0.71
553 0.68
554 0.66
555 0.64
556 0.6
557 0.59
558 0.61
559 0.58
560 0.58
561 0.64