Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y8D1D8

Protein Details
Accession A0A4Y8D1D8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-25ILRCNALKCRKELKKHAVVTTCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042448  CCNB1IP1  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0000795  C:synaptonemal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0007131  P:reciprocal meiotic recombination  
Pfam View protein in Pfam  
PF14634  zf-RING_5  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16449  RING-HC  
Amino Acid Sequences MEFILRCNALKCRKELKKHAVVTTCSHVFCIECANQSQLSTSLRENRRTTCPACDMHLPNPDDVVVTNLNPSEDYKTSVLSGLNPSVIMECAGRALSFWAYQTTQEIVYQEYLAKSLTDKYSAINSQMDKIIHDANSEISNLRNKMQGMNSDNDALRRKNEELHHDLRERNKKLLQTQELYDKMKRRGMLDQVQTAASNAVDDTIQATTNGNRFTENTGTNNHRPPLYAIQQTGGLNHTGGFHNSTMPPPPQRRRHSSEWDTIGSQGQSNMSQHYNHVQATPSSHRQPLASSHFPPTSIGMNNIQSHMAGTPLPLPHGRATPRRTPLSSIDVNTGQPSGFVGYGLRAGLKVGNPGASLASDFARPSGRSVAQRPGSNLPFSRDSGLGTPSISRGGSNYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.78
3 0.8
4 0.8
5 0.82
6 0.83
7 0.79
8 0.73
9 0.68
10 0.65
11 0.59
12 0.49
13 0.42
14 0.35
15 0.28
16 0.25
17 0.27
18 0.21
19 0.2
20 0.22
21 0.24
22 0.24
23 0.24
24 0.25
25 0.22
26 0.21
27 0.21
28 0.24
29 0.31
30 0.37
31 0.45
32 0.47
33 0.49
34 0.54
35 0.59
36 0.57
37 0.55
38 0.54
39 0.48
40 0.48
41 0.52
42 0.48
43 0.47
44 0.52
45 0.47
46 0.41
47 0.39
48 0.35
49 0.27
50 0.22
51 0.2
52 0.13
53 0.12
54 0.13
55 0.13
56 0.13
57 0.14
58 0.15
59 0.16
60 0.16
61 0.2
62 0.18
63 0.19
64 0.19
65 0.21
66 0.2
67 0.17
68 0.2
69 0.17
70 0.16
71 0.15
72 0.15
73 0.13
74 0.13
75 0.11
76 0.08
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.08
83 0.09
84 0.09
85 0.1
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.15
90 0.14
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.12
104 0.13
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.19
109 0.2
110 0.22
111 0.21
112 0.21
113 0.21
114 0.24
115 0.23
116 0.18
117 0.19
118 0.2
119 0.16
120 0.16
121 0.14
122 0.12
123 0.13
124 0.13
125 0.11
126 0.1
127 0.15
128 0.16
129 0.17
130 0.18
131 0.18
132 0.21
133 0.23
134 0.27
135 0.26
136 0.27
137 0.28
138 0.27
139 0.27
140 0.27
141 0.28
142 0.22
143 0.21
144 0.22
145 0.22
146 0.25
147 0.29
148 0.33
149 0.36
150 0.4
151 0.43
152 0.42
153 0.44
154 0.47
155 0.53
156 0.49
157 0.46
158 0.44
159 0.43
160 0.45
161 0.51
162 0.47
163 0.4
164 0.4
165 0.42
166 0.42
167 0.41
168 0.39
169 0.36
170 0.34
171 0.35
172 0.34
173 0.29
174 0.31
175 0.34
176 0.38
177 0.36
178 0.34
179 0.32
180 0.31
181 0.29
182 0.24
183 0.18
184 0.1
185 0.07
186 0.05
187 0.04
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.1
197 0.11
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.14
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.2
206 0.25
207 0.29
208 0.31
209 0.3
210 0.26
211 0.25
212 0.27
213 0.3
214 0.29
215 0.28
216 0.25
217 0.24
218 0.27
219 0.27
220 0.24
221 0.18
222 0.13
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.08
227 0.09
228 0.1
229 0.09
230 0.11
231 0.12
232 0.13
233 0.14
234 0.17
235 0.24
236 0.31
237 0.4
238 0.47
239 0.54
240 0.61
241 0.65
242 0.71
243 0.73
244 0.71
245 0.69
246 0.64
247 0.59
248 0.51
249 0.45
250 0.38
251 0.29
252 0.23
253 0.16
254 0.13
255 0.12
256 0.12
257 0.14
258 0.14
259 0.14
260 0.15
261 0.18
262 0.2
263 0.19
264 0.19
265 0.18
266 0.17
267 0.22
268 0.27
269 0.29
270 0.3
271 0.31
272 0.31
273 0.3
274 0.31
275 0.33
276 0.35
277 0.35
278 0.34
279 0.37
280 0.36
281 0.36
282 0.35
283 0.3
284 0.25
285 0.21
286 0.21
287 0.2
288 0.24
289 0.25
290 0.25
291 0.23
292 0.19
293 0.18
294 0.15
295 0.13
296 0.08
297 0.08
298 0.11
299 0.11
300 0.14
301 0.14
302 0.16
303 0.18
304 0.23
305 0.28
306 0.33
307 0.39
308 0.45
309 0.52
310 0.56
311 0.55
312 0.54
313 0.53
314 0.53
315 0.51
316 0.44
317 0.41
318 0.37
319 0.36
320 0.32
321 0.28
322 0.2
323 0.15
324 0.14
325 0.11
326 0.09
327 0.09
328 0.08
329 0.08
330 0.1
331 0.1
332 0.1
333 0.08
334 0.08
335 0.11
336 0.12
337 0.15
338 0.15
339 0.16
340 0.16
341 0.16
342 0.16
343 0.14
344 0.13
345 0.11
346 0.11
347 0.11
348 0.11
349 0.12
350 0.16
351 0.16
352 0.19
353 0.24
354 0.28
355 0.33
356 0.38
357 0.46
358 0.48
359 0.51
360 0.53
361 0.55
362 0.54
363 0.53
364 0.51
365 0.47
366 0.45
367 0.43
368 0.42
369 0.34
370 0.33
371 0.29
372 0.29
373 0.24
374 0.21
375 0.2
376 0.18
377 0.2
378 0.17
379 0.15