Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A4Y8DBU5

Protein Details
Accession A0A4Y8DBU5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-197CPEGPKCKKAHPRWPSDLPKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-260GEGRPRQRWRGGFSYRGRGGGGERGQRGRGH
Subcellular Location(s) mito 16, nucl 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF14608  zf-CCCH_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MAEILQQKPSAFSAQASASAAQQILNHKAPAYKFSFTPFLFNNYRMGISPDRPTCKAYLQGHCPLGTNCPDKHAANPNNSWNFNNMVCKHWLRGLCKKGETCEFLYEFNLRKMPECNFFVKNGYCSNGDECLYLHVDPASKMGNCPHYDKGFCPLGPRCSKKHIRKALCEFYLAGFCPEGPKCKKAHPRWPSDLPKPTIKVERDPEEVAEEQARIRENAEREADRERGFGEGRPRQRWRGGFSYRGRGGGGERGQRGRGH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.21
4 0.19
5 0.17
6 0.17
7 0.17
8 0.14
9 0.15
10 0.18
11 0.22
12 0.25
13 0.24
14 0.24
15 0.28
16 0.28
17 0.32
18 0.32
19 0.28
20 0.26
21 0.3
22 0.36
23 0.33
24 0.37
25 0.32
26 0.33
27 0.34
28 0.34
29 0.33
30 0.27
31 0.28
32 0.23
33 0.27
34 0.24
35 0.25
36 0.32
37 0.35
38 0.39
39 0.4
40 0.41
41 0.38
42 0.37
43 0.43
44 0.42
45 0.43
46 0.44
47 0.49
48 0.49
49 0.47
50 0.46
51 0.37
52 0.35
53 0.33
54 0.32
55 0.25
56 0.26
57 0.29
58 0.28
59 0.33
60 0.39
61 0.39
62 0.4
63 0.44
64 0.49
65 0.51
66 0.52
67 0.47
68 0.38
69 0.35
70 0.31
71 0.35
72 0.28
73 0.25
74 0.27
75 0.28
76 0.27
77 0.29
78 0.32
79 0.3
80 0.38
81 0.42
82 0.42
83 0.45
84 0.45
85 0.44
86 0.43
87 0.41
88 0.35
89 0.32
90 0.28
91 0.25
92 0.25
93 0.25
94 0.22
95 0.2
96 0.2
97 0.16
98 0.17
99 0.19
100 0.2
101 0.22
102 0.23
103 0.26
104 0.24
105 0.25
106 0.27
107 0.25
108 0.24
109 0.2
110 0.2
111 0.17
112 0.16
113 0.17
114 0.15
115 0.15
116 0.13
117 0.12
118 0.11
119 0.11
120 0.1
121 0.09
122 0.08
123 0.08
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.08
128 0.09
129 0.12
130 0.16
131 0.18
132 0.21
133 0.24
134 0.24
135 0.26
136 0.26
137 0.28
138 0.26
139 0.24
140 0.26
141 0.25
142 0.31
143 0.37
144 0.41
145 0.39
146 0.45
147 0.55
148 0.6
149 0.67
150 0.69
151 0.68
152 0.74
153 0.79
154 0.79
155 0.69
156 0.61
157 0.51
158 0.42
159 0.37
160 0.28
161 0.2
162 0.12
163 0.1
164 0.13
165 0.13
166 0.2
167 0.21
168 0.25
169 0.27
170 0.36
171 0.47
172 0.53
173 0.63
174 0.64
175 0.7
176 0.74
177 0.81
178 0.8
179 0.79
180 0.78
181 0.71
182 0.69
183 0.63
184 0.59
185 0.58
186 0.52
187 0.51
188 0.49
189 0.51
190 0.48
191 0.46
192 0.43
193 0.39
194 0.36
195 0.3
196 0.25
197 0.19
198 0.15
199 0.17
200 0.17
201 0.13
202 0.14
203 0.18
204 0.19
205 0.25
206 0.3
207 0.29
208 0.3
209 0.34
210 0.37
211 0.33
212 0.31
213 0.25
214 0.24
215 0.23
216 0.25
217 0.3
218 0.35
219 0.42
220 0.5
221 0.56
222 0.58
223 0.65
224 0.67
225 0.64
226 0.65
227 0.64
228 0.64
229 0.65
230 0.69
231 0.63
232 0.59
233 0.52
234 0.44
235 0.4
236 0.39
237 0.39
238 0.37
239 0.4
240 0.42