Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y8DF18

Protein Details
Accession A0A4Y8DF18    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-79IHDRGDRRDDRNRNHDRSRRERSRSPRDSRDHRRSSYRDRERERDRGGBasic
207-228VDGGNKKASRHKKKIEEEEEEEAcidic
263-286NNVSAVRKEKKTQYRQYMNRVGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-107RRDDRNRNHDRSRRERSRSPRDSRDHRRSSYRDRERERDRGGRRDEYRDGRGSDRNRDIRERNDERSDKR
149-154RARSRS
213-219KASRHKK
Subcellular Location(s) nucl 25, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDLPRRRQRPDSTKMWEESESRGSARDRDEIHDRGDRRDDRNRNHDRSRRERSRSPRDSRDHRRSSYRDRERERDRGGRRDEYRDGRGSDRNRDIRERNDERSDKRDGHRRDVPDRTRDDTRQSRGIDEDRIARKDNERSSGEKSNERARSRSPRRDNERDYKEDRGGDKIRNSEYIDDAPQPVSFSIGASHTNTATAQDHDRMDVDGGNKKASRHKKKIEEEEEEEEDDDIVVEDDGMAAMQAMMGFGGFATTQNKQVAGNNVSAVRKEKKTQYRQYMNRVGGFNRPLSPSRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.73
3 0.67
4 0.6
5 0.52
6 0.49
7 0.45
8 0.38
9 0.31
10 0.33
11 0.31
12 0.32
13 0.33
14 0.34
15 0.31
16 0.34
17 0.4
18 0.39
19 0.42
20 0.44
21 0.42
22 0.42
23 0.49
24 0.49
25 0.49
26 0.57
27 0.61
28 0.63
29 0.72
30 0.77
31 0.76
32 0.81
33 0.81
34 0.81
35 0.82
36 0.84
37 0.83
38 0.82
39 0.82
40 0.82
41 0.86
42 0.87
43 0.85
44 0.84
45 0.84
46 0.86
47 0.88
48 0.88
49 0.85
50 0.8
51 0.8
52 0.78
53 0.79
54 0.79
55 0.79
56 0.78
57 0.77
58 0.81
59 0.79
60 0.81
61 0.78
62 0.76
63 0.73
64 0.72
65 0.71
66 0.7
67 0.67
68 0.65
69 0.65
70 0.61
71 0.6
72 0.55
73 0.51
74 0.46
75 0.49
76 0.47
77 0.48
78 0.5
79 0.51
80 0.5
81 0.54
82 0.55
83 0.54
84 0.6
85 0.58
86 0.55
87 0.57
88 0.59
89 0.56
90 0.56
91 0.54
92 0.49
93 0.49
94 0.53
95 0.48
96 0.51
97 0.54
98 0.55
99 0.56
100 0.61
101 0.61
102 0.59
103 0.58
104 0.55
105 0.54
106 0.5
107 0.51
108 0.49
109 0.48
110 0.47
111 0.44
112 0.4
113 0.38
114 0.38
115 0.32
116 0.26
117 0.29
118 0.26
119 0.27
120 0.28
121 0.26
122 0.27
123 0.32
124 0.33
125 0.32
126 0.3
127 0.32
128 0.35
129 0.41
130 0.4
131 0.37
132 0.36
133 0.39
134 0.44
135 0.42
136 0.39
137 0.38
138 0.46
139 0.52
140 0.6
141 0.61
142 0.63
143 0.71
144 0.78
145 0.8
146 0.79
147 0.76
148 0.72
149 0.67
150 0.61
151 0.55
152 0.49
153 0.43
154 0.4
155 0.36
156 0.34
157 0.34
158 0.33
159 0.31
160 0.31
161 0.31
162 0.25
163 0.24
164 0.22
165 0.21
166 0.18
167 0.17
168 0.15
169 0.14
170 0.13
171 0.11
172 0.1
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.08
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.13
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.17
191 0.15
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.17
196 0.17
197 0.2
198 0.21
199 0.23
200 0.31
201 0.4
202 0.49
203 0.53
204 0.62
205 0.69
206 0.77
207 0.86
208 0.85
209 0.82
210 0.77
211 0.73
212 0.66
213 0.56
214 0.47
215 0.36
216 0.28
217 0.2
218 0.14
219 0.08
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.02
229 0.02
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.02
237 0.03
238 0.03
239 0.05
240 0.08
241 0.1
242 0.15
243 0.16
244 0.17
245 0.18
246 0.22
247 0.29
248 0.28
249 0.29
250 0.27
251 0.3
252 0.31
253 0.32
254 0.33
255 0.32
256 0.35
257 0.39
258 0.47
259 0.54
260 0.63
261 0.72
262 0.77
263 0.81
264 0.85
265 0.88
266 0.88
267 0.82
268 0.77
269 0.7
270 0.61
271 0.58
272 0.54
273 0.47
274 0.41
275 0.4