Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y8D922

Protein Details
Accession A0A4Y8D922    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
375-402SKWSSGKRGTHFRKKRRWERIRHIVSTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
380-394GKRGTHFRKKRRWER
543-550GKFSKRPK
Subcellular Location(s) cyto_mito 9.333mito_nucl 9.333, mito 9, nucl 8.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHNLVKANAWVALRLPSDNLKVLQVVPNTPISLGKYGTFPSNLIIDRPYNLKYELIDRQKDQKYSDLRIVPASEIHADTIAEENAAANTVPDENVIIGGDGVEFELVGENGEVIMRSNRETIDDSARQTLTQEEIETLKRDGAAAGKDLIAKLMLSHTAIDEKTSFSLAKYKLLKTRKYLRQFTILPMDVAKMDYWMMKEKDASKIMECRDEMLALAGSWANVHFSEDPESEHTDDPLNTSGGGRLLVVDETGGLLVAAMAERMGLLYPEEDQDLPTEFTGASEEAQADKEPTPRHQHDRQYRPYASTNTLTLIHTNSQPNLSLLKYFNFNIDSPAASHPLTRRLLPISWLQLISPESDSLYASPPPSATPEELSKWSSGKRGTHFRKKRRWERIRHIVSTTQHGDFTGLVVASNMDPISIIRRTIHLLRPSATITIYSPTIEPLVALADLYSTSRRTAFIQSPPEELKGLSQAEIAAWQGNEDFPLNPSLILNTSVQSCRKREWQVLPGRTHPLMTSKGGAEGYLFTGTRVVPAEGKVSARGKFSKRPKAAEGEKTSPGATEDIEGSANKKIKLEPGSLEVETNGEQDVNMGI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.23
3 0.23
4 0.27
5 0.29
6 0.29
7 0.25
8 0.25
9 0.27
10 0.3
11 0.27
12 0.26
13 0.25
14 0.27
15 0.26
16 0.24
17 0.25
18 0.22
19 0.22
20 0.22
21 0.2
22 0.2
23 0.21
24 0.24
25 0.23
26 0.2
27 0.19
28 0.23
29 0.22
30 0.21
31 0.23
32 0.21
33 0.22
34 0.25
35 0.25
36 0.23
37 0.24
38 0.24
39 0.22
40 0.27
41 0.34
42 0.4
43 0.43
44 0.44
45 0.52
46 0.57
47 0.59
48 0.55
49 0.54
50 0.52
51 0.52
52 0.57
53 0.51
54 0.46
55 0.46
56 0.45
57 0.37
58 0.32
59 0.29
60 0.23
61 0.19
62 0.18
63 0.15
64 0.14
65 0.13
66 0.14
67 0.12
68 0.09
69 0.09
70 0.08
71 0.08
72 0.08
73 0.07
74 0.05
75 0.06
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.06
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.03
91 0.03
92 0.04
93 0.04
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.08
102 0.09
103 0.11
104 0.13
105 0.13
106 0.16
107 0.19
108 0.22
109 0.27
110 0.29
111 0.29
112 0.32
113 0.32
114 0.29
115 0.27
116 0.25
117 0.19
118 0.17
119 0.16
120 0.13
121 0.15
122 0.17
123 0.18
124 0.17
125 0.15
126 0.14
127 0.14
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.13
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.1
138 0.09
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.07
143 0.08
144 0.08
145 0.11
146 0.11
147 0.12
148 0.12
149 0.12
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.1
154 0.18
155 0.18
156 0.24
157 0.28
158 0.32
159 0.38
160 0.46
161 0.5
162 0.51
163 0.6
164 0.63
165 0.67
166 0.71
167 0.66
168 0.67
169 0.63
170 0.6
171 0.57
172 0.48
173 0.39
174 0.32
175 0.29
176 0.21
177 0.2
178 0.15
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.1
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.19
187 0.21
188 0.27
189 0.29
190 0.29
191 0.25
192 0.3
193 0.31
194 0.33
195 0.3
196 0.26
197 0.23
198 0.22
199 0.19
200 0.14
201 0.13
202 0.08
203 0.08
204 0.06
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.12
214 0.12
215 0.14
216 0.15
217 0.18
218 0.18
219 0.17
220 0.17
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.12
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.08
230 0.09
231 0.07
232 0.05
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.02
242 0.02
243 0.02
244 0.02
245 0.02
246 0.02
247 0.02
248 0.02
249 0.02
250 0.02
251 0.02
252 0.02
253 0.03
254 0.03
255 0.04
256 0.05
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.07
261 0.08
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.12
278 0.13
279 0.17
280 0.24
281 0.28
282 0.35
283 0.4
284 0.48
285 0.54
286 0.62
287 0.66
288 0.66
289 0.63
290 0.6
291 0.57
292 0.51
293 0.44
294 0.36
295 0.29
296 0.22
297 0.23
298 0.19
299 0.16
300 0.14
301 0.13
302 0.15
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.12
313 0.13
314 0.13
315 0.14
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.14
320 0.13
321 0.13
322 0.14
323 0.15
324 0.12
325 0.14
326 0.13
327 0.19
328 0.2
329 0.19
330 0.2
331 0.2
332 0.21
333 0.21
334 0.23
335 0.19
336 0.2
337 0.19
338 0.17
339 0.17
340 0.17
341 0.16
342 0.14
343 0.1
344 0.09
345 0.09
346 0.1
347 0.08
348 0.1
349 0.1
350 0.09
351 0.1
352 0.1
353 0.1
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.14
358 0.16
359 0.18
360 0.2
361 0.21
362 0.19
363 0.19
364 0.2
365 0.21
366 0.23
367 0.26
368 0.3
369 0.39
370 0.47
371 0.57
372 0.66
373 0.72
374 0.78
375 0.84
376 0.88
377 0.89
378 0.9
379 0.89
380 0.9
381 0.91
382 0.88
383 0.81
384 0.73
385 0.68
386 0.6
387 0.56
388 0.48
389 0.38
390 0.3
391 0.27
392 0.24
393 0.18
394 0.17
395 0.11
396 0.08
397 0.07
398 0.06
399 0.07
400 0.06
401 0.07
402 0.06
403 0.04
404 0.05
405 0.05
406 0.09
407 0.09
408 0.11
409 0.1
410 0.12
411 0.16
412 0.21
413 0.28
414 0.29
415 0.31
416 0.32
417 0.33
418 0.33
419 0.3
420 0.26
421 0.2
422 0.15
423 0.15
424 0.14
425 0.12
426 0.11
427 0.11
428 0.11
429 0.1
430 0.09
431 0.07
432 0.07
433 0.06
434 0.06
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.08
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.12
444 0.14
445 0.2
446 0.25
447 0.3
448 0.38
449 0.39
450 0.43
451 0.44
452 0.42
453 0.37
454 0.31
455 0.26
456 0.22
457 0.21
458 0.16
459 0.15
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.09
465 0.08
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.09
470 0.1
471 0.09
472 0.09
473 0.11
474 0.11
475 0.11
476 0.11
477 0.11
478 0.11
479 0.13
480 0.12
481 0.12
482 0.15
483 0.19
484 0.24
485 0.29
486 0.3
487 0.33
488 0.41
489 0.47
490 0.52
491 0.56
492 0.6
493 0.65
494 0.7
495 0.7
496 0.66
497 0.66
498 0.58
499 0.5
500 0.42
501 0.37
502 0.32
503 0.3
504 0.28
505 0.23
506 0.25
507 0.24
508 0.23
509 0.18
510 0.16
511 0.15
512 0.15
513 0.14
514 0.11
515 0.13
516 0.13
517 0.15
518 0.15
519 0.15
520 0.14
521 0.15
522 0.18
523 0.18
524 0.2
525 0.23
526 0.26
527 0.27
528 0.3
529 0.36
530 0.4
531 0.48
532 0.57
533 0.62
534 0.65
535 0.69
536 0.7
537 0.73
538 0.75
539 0.76
540 0.74
541 0.68
542 0.65
543 0.6
544 0.54
545 0.44
546 0.37
547 0.28
548 0.2
549 0.16
550 0.14
551 0.13
552 0.15
553 0.14
554 0.14
555 0.2
556 0.24
557 0.23
558 0.24
559 0.26
560 0.32
561 0.37
562 0.4
563 0.36
564 0.37
565 0.42
566 0.4
567 0.38
568 0.31
569 0.28
570 0.24
571 0.21
572 0.16
573 0.11
574 0.1