Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y8D3P4

Protein Details
Accession A0A4Y8D3P4    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-46QIHFAPLSTRSQKRKRRDSDSDGNDEYHydrophilic
140-170SEEESAKSRRERERRRKEEKKTGRSNLKIQHBasic
368-397FLAHQRRQDRLHKRRKEKRWEERDEVRRAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-163KSRRERERRRKEEKKTGR
374-387RQDRLHKRRKEKRW
474-486RRGMEKREEERRR
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 11, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MPLFTLPISDTSQTSATTPQIHFAPLSTRSQKRKRRDSDSDGNDEYNNDYIANTNTNSGKGKEIDDGEPSYPSAENTNPLSLTPSEVMQYRLAGLGLDKKLPSKVGVKNWPHRGLPSRYSVISDDRESSVKSRDDEDEDSEEESAKSRRERERRRKEEKKTGRSNLKIQHLSVLVAIMMRNLEEGDMERAGRAWSLLLRMQIAGKGIEIRKTGFWGIGAELLMRGVTNKQRKEWWEEDTGGGSGDDGNGNNDGEPKEGEEDGKGEDKGGEGKRYGTAEGLLKVKDYYERLILQYPYKRQFHGSVTALDFWPAMLGCEIYGIQFEHKDGLRKIAKQAEKDEDGDISDSDISGEEDLDNDEEGDPGDKAFLAHQRRQDRLHKRRKEKRWEERDEVRRAALVATEMVAQRMDELMMTPPYSDSKVLLRLRGMVALYIGNLCVPEKWEGDEEWLGKMRGGAMEADRRFLGRQREAEVRRGMEKREEERRRARVLFGKIGVEWDDGDEGMDLDMTLEGYEGDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.21
4 0.25
5 0.25
6 0.26
7 0.26
8 0.26
9 0.25
10 0.23
11 0.26
12 0.23
13 0.31
14 0.36
15 0.43
16 0.52
17 0.63
18 0.71
19 0.76
20 0.83
21 0.85
22 0.86
23 0.88
24 0.87
25 0.88
26 0.86
27 0.83
28 0.75
29 0.67
30 0.57
31 0.48
32 0.4
33 0.31
34 0.23
35 0.15
36 0.12
37 0.13
38 0.14
39 0.16
40 0.15
41 0.18
42 0.19
43 0.22
44 0.24
45 0.24
46 0.26
47 0.25
48 0.27
49 0.27
50 0.3
51 0.29
52 0.3
53 0.31
54 0.28
55 0.27
56 0.25
57 0.21
58 0.18
59 0.17
60 0.16
61 0.14
62 0.17
63 0.19
64 0.21
65 0.2
66 0.2
67 0.23
68 0.19
69 0.21
70 0.18
71 0.16
72 0.15
73 0.16
74 0.19
75 0.16
76 0.16
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.11
81 0.11
82 0.16
83 0.16
84 0.19
85 0.18
86 0.2
87 0.21
88 0.22
89 0.24
90 0.25
91 0.3
92 0.37
93 0.47
94 0.54
95 0.62
96 0.7
97 0.72
98 0.65
99 0.63
100 0.62
101 0.59
102 0.54
103 0.52
104 0.46
105 0.41
106 0.43
107 0.4
108 0.36
109 0.33
110 0.3
111 0.26
112 0.25
113 0.26
114 0.25
115 0.25
116 0.26
117 0.25
118 0.24
119 0.25
120 0.26
121 0.3
122 0.31
123 0.32
124 0.3
125 0.28
126 0.27
127 0.24
128 0.21
129 0.17
130 0.17
131 0.15
132 0.15
133 0.18
134 0.25
135 0.34
136 0.45
137 0.56
138 0.65
139 0.75
140 0.82
141 0.89
142 0.92
143 0.92
144 0.92
145 0.92
146 0.91
147 0.9
148 0.89
149 0.88
150 0.83
151 0.81
152 0.76
153 0.75
154 0.66
155 0.56
156 0.51
157 0.42
158 0.37
159 0.29
160 0.22
161 0.13
162 0.1
163 0.1
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.05
181 0.06
182 0.08
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.09
191 0.08
192 0.11
193 0.12
194 0.15
195 0.15
196 0.15
197 0.15
198 0.17
199 0.17
200 0.13
201 0.12
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.06
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.13
214 0.2
215 0.22
216 0.25
217 0.3
218 0.33
219 0.4
220 0.41
221 0.38
222 0.35
223 0.35
224 0.33
225 0.29
226 0.27
227 0.19
228 0.15
229 0.1
230 0.06
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.06
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.1
250 0.09
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.13
258 0.14
259 0.16
260 0.17
261 0.17
262 0.11
263 0.12
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.12
268 0.12
269 0.11
270 0.12
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.13
275 0.14
276 0.15
277 0.19
278 0.2
279 0.22
280 0.26
281 0.31
282 0.35
283 0.35
284 0.34
285 0.34
286 0.36
287 0.34
288 0.36
289 0.31
290 0.28
291 0.28
292 0.28
293 0.25
294 0.22
295 0.18
296 0.11
297 0.1
298 0.07
299 0.06
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.05
304 0.05
305 0.04
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.09
312 0.11
313 0.15
314 0.15
315 0.23
316 0.27
317 0.28
318 0.33
319 0.38
320 0.41
321 0.4
322 0.45
323 0.42
324 0.41
325 0.4
326 0.36
327 0.28
328 0.25
329 0.22
330 0.17
331 0.12
332 0.09
333 0.07
334 0.07
335 0.06
336 0.06
337 0.05
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.06
350 0.05
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.08
355 0.15
356 0.21
357 0.25
358 0.34
359 0.39
360 0.43
361 0.5
362 0.57
363 0.61
364 0.66
365 0.72
366 0.75
367 0.8
368 0.87
369 0.91
370 0.92
371 0.92
372 0.92
373 0.92
374 0.91
375 0.88
376 0.88
377 0.86
378 0.81
379 0.72
380 0.61
381 0.51
382 0.43
383 0.35
384 0.25
385 0.17
386 0.1
387 0.09
388 0.11
389 0.1
390 0.1
391 0.1
392 0.09
393 0.08
394 0.08
395 0.08
396 0.05
397 0.06
398 0.09
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.11
403 0.13
404 0.15
405 0.14
406 0.13
407 0.15
408 0.24
409 0.26
410 0.28
411 0.27
412 0.29
413 0.29
414 0.3
415 0.26
416 0.18
417 0.16
418 0.14
419 0.13
420 0.1
421 0.09
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.07
426 0.09
427 0.12
428 0.12
429 0.15
430 0.17
431 0.17
432 0.22
433 0.25
434 0.24
435 0.24
436 0.27
437 0.24
438 0.22
439 0.22
440 0.19
441 0.16
442 0.16
443 0.15
444 0.16
445 0.25
446 0.25
447 0.27
448 0.25
449 0.26
450 0.27
451 0.3
452 0.35
453 0.33
454 0.37
455 0.4
456 0.5
457 0.51
458 0.57
459 0.58
460 0.52
461 0.52
462 0.52
463 0.5
464 0.49
465 0.54
466 0.54
467 0.59
468 0.64
469 0.66
470 0.72
471 0.76
472 0.76
473 0.7
474 0.7
475 0.67
476 0.66
477 0.65
478 0.58
479 0.53
480 0.45
481 0.45
482 0.4
483 0.32
484 0.25
485 0.19
486 0.16
487 0.14
488 0.14
489 0.11
490 0.09
491 0.08
492 0.08
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.05
498 0.05