Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y8DKD8

Protein Details
Accession A0A4Y8DKD8    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-32MNKFGGRKDKDKETSHKRDKSRDNKSAEKSTEBasic
700-724ARTSRTFRRSKTSRSRPQSSSNEKTHydrophilic
785-811ASGGVSRKGSKKGKRRSKEATDIDAKDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-29RKDKDKETSHKRDKSRDNKSAEK
790-802SRKGSKKGKRRSK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR001394  Peptidase_C19_UCH  
IPR028889  USP_dom  
Gene Ontology GO:0004843  F:cysteine-type deubiquitinase activity  
GO:0016579  P:protein deubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF00443  UCH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50235  USP_3  
Amino Acid Sequences MNKFGGRKDKDKETSHKRDKSRDNKSAEKSTEKKSRSVSDIFTSLFVHIRNSKSEKEQDEDQEKISRVRSLLESDGHNDVRDDQILFCLNSIYANGNVEKAHQILLVFHNSLSGVIYPYDPKITMLGAQNSRGVTCWLDSFLASLFTVPTQFQELLNNFYEDPLKQNLIQLIRLWVNLFRSGILIEVNITERILDSLIECGWDDLDKTKEQDPTEAHMKIGDILDWPMLDLRVDYEHGGIREKDDHRTSKERTLPISISTDHEGPGRLRLEECIERSLLSLVKIQRRVEPDDDDEKPVPEHVETTETEPDTDKEPTSEHVENTEAESDTAPPSRIGMIGQSSSHNHLTREVTRDGGSLNRTTSRNSTRKEREVDAFILSKLIRPSSSWSPISCHLNLNIAPLKTVPVLIGDIVWFSKPAPANNQEFVERIKQNHNPMLGFDLKRYHNVEGPDGKEILKKNNTHVDIPKKMKLPPHLVHEYEGSNEIAISDCFELVLRSMICHEGSLKSGHYRSLIRLDVENGGDSDSVQPKDGQHPPAYVDDCWIVHDDMAKGGRVASVDIDAALKHDSRYGMPVTLWYEFVPILANLSPEDLARFSDNTTPPSYTYSSVPSIDVQISKASPDLNNGSGDDEGYFTPPPNDRSNSVVRFSSEIDRSRRSLNLPDDDRRGSVAATDASSVSVEKSDNDSAPATPGEEPVSARTSRTFRRSKTSRSRPQSSSNEKTEKSENRRSYFKDLISRASKESLQRPDTSKESIPAVPALPGLGLDGPSDSSTSGDLAKSAEASGGVSRKGSKKGKRRSKEATDIDAKDKDKNSDHSERVCNIM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.84
3 0.86
4 0.84
5 0.85
6 0.88
7 0.88
8 0.88
9 0.86
10 0.83
11 0.84
12 0.84
13 0.83
14 0.78
15 0.78
16 0.72
17 0.73
18 0.74
19 0.67
20 0.66
21 0.63
22 0.64
23 0.6
24 0.6
25 0.55
26 0.5
27 0.51
28 0.46
29 0.4
30 0.34
31 0.29
32 0.27
33 0.22
34 0.23
35 0.24
36 0.26
37 0.33
38 0.36
39 0.4
40 0.45
41 0.53
42 0.52
43 0.51
44 0.56
45 0.57
46 0.58
47 0.55
48 0.5
49 0.49
50 0.46
51 0.44
52 0.4
53 0.34
54 0.29
55 0.31
56 0.31
57 0.29
58 0.31
59 0.31
60 0.31
61 0.3
62 0.36
63 0.33
64 0.3
65 0.26
66 0.24
67 0.23
68 0.22
69 0.2
70 0.14
71 0.17
72 0.2
73 0.19
74 0.18
75 0.16
76 0.14
77 0.13
78 0.14
79 0.12
80 0.11
81 0.14
82 0.14
83 0.15
84 0.15
85 0.16
86 0.17
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.13
91 0.15
92 0.19
93 0.21
94 0.19
95 0.18
96 0.18
97 0.17
98 0.17
99 0.15
100 0.12
101 0.09
102 0.09
103 0.1
104 0.12
105 0.13
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.14
110 0.14
111 0.17
112 0.21
113 0.27
114 0.28
115 0.29
116 0.31
117 0.3
118 0.3
119 0.26
120 0.22
121 0.16
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.13
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.1
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.1
135 0.09
136 0.1
137 0.12
138 0.13
139 0.13
140 0.19
141 0.21
142 0.24
143 0.25
144 0.25
145 0.22
146 0.22
147 0.23
148 0.17
149 0.19
150 0.18
151 0.19
152 0.18
153 0.21
154 0.25
155 0.25
156 0.26
157 0.23
158 0.24
159 0.23
160 0.23
161 0.21
162 0.19
163 0.19
164 0.2
165 0.19
166 0.14
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.11
171 0.09
172 0.07
173 0.08
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.08
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.09
192 0.12
193 0.14
194 0.16
195 0.2
196 0.25
197 0.25
198 0.3
199 0.29
200 0.32
201 0.36
202 0.34
203 0.3
204 0.26
205 0.25
206 0.22
207 0.2
208 0.15
209 0.09
210 0.09
211 0.1
212 0.09
213 0.09
214 0.08
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.12
224 0.12
225 0.16
226 0.14
227 0.15
228 0.22
229 0.23
230 0.28
231 0.32
232 0.36
233 0.39
234 0.47
235 0.48
236 0.5
237 0.55
238 0.52
239 0.49
240 0.49
241 0.44
242 0.39
243 0.38
244 0.31
245 0.26
246 0.25
247 0.23
248 0.19
249 0.19
250 0.18
251 0.15
252 0.19
253 0.18
254 0.16
255 0.16
256 0.16
257 0.21
258 0.23
259 0.24
260 0.21
261 0.2
262 0.19
263 0.19
264 0.2
265 0.15
266 0.13
267 0.16
268 0.19
269 0.25
270 0.29
271 0.3
272 0.33
273 0.36
274 0.4
275 0.38
276 0.37
277 0.36
278 0.37
279 0.38
280 0.38
281 0.34
282 0.3
283 0.27
284 0.23
285 0.19
286 0.14
287 0.13
288 0.09
289 0.12
290 0.12
291 0.15
292 0.18
293 0.17
294 0.17
295 0.17
296 0.17
297 0.17
298 0.18
299 0.14
300 0.12
301 0.12
302 0.14
303 0.19
304 0.2
305 0.17
306 0.17
307 0.18
308 0.18
309 0.19
310 0.18
311 0.12
312 0.11
313 0.11
314 0.1
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.09
325 0.09
326 0.1
327 0.11
328 0.12
329 0.15
330 0.19
331 0.18
332 0.17
333 0.19
334 0.23
335 0.24
336 0.28
337 0.25
338 0.23
339 0.22
340 0.22
341 0.19
342 0.18
343 0.17
344 0.13
345 0.14
346 0.16
347 0.17
348 0.18
349 0.24
350 0.3
351 0.35
352 0.37
353 0.46
354 0.49
355 0.55
356 0.57
357 0.54
358 0.48
359 0.45
360 0.43
361 0.36
362 0.29
363 0.23
364 0.2
365 0.17
366 0.16
367 0.13
368 0.12
369 0.1
370 0.1
371 0.15
372 0.19
373 0.24
374 0.23
375 0.23
376 0.25
377 0.28
378 0.32
379 0.27
380 0.23
381 0.19
382 0.2
383 0.2
384 0.21
385 0.21
386 0.16
387 0.15
388 0.14
389 0.15
390 0.12
391 0.12
392 0.08
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.08
404 0.09
405 0.1
406 0.15
407 0.2
408 0.23
409 0.24
410 0.25
411 0.22
412 0.22
413 0.23
414 0.24
415 0.2
416 0.2
417 0.24
418 0.27
419 0.3
420 0.33
421 0.33
422 0.26
423 0.25
424 0.27
425 0.26
426 0.22
427 0.19
428 0.2
429 0.2
430 0.23
431 0.25
432 0.23
433 0.21
434 0.22
435 0.25
436 0.24
437 0.25
438 0.23
439 0.21
440 0.2
441 0.21
442 0.21
443 0.24
444 0.26
445 0.25
446 0.28
447 0.35
448 0.37
449 0.37
450 0.42
451 0.43
452 0.45
453 0.48
454 0.49
455 0.43
456 0.44
457 0.45
458 0.46
459 0.46
460 0.42
461 0.45
462 0.45
463 0.43
464 0.42
465 0.39
466 0.33
467 0.25
468 0.23
469 0.15
470 0.1
471 0.09
472 0.08
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.05
477 0.05
478 0.05
479 0.05
480 0.05
481 0.05
482 0.08
483 0.06
484 0.06
485 0.07
486 0.09
487 0.09
488 0.09
489 0.1
490 0.08
491 0.1
492 0.11
493 0.11
494 0.13
495 0.14
496 0.15
497 0.17
498 0.17
499 0.18
500 0.22
501 0.23
502 0.21
503 0.21
504 0.21
505 0.21
506 0.2
507 0.18
508 0.12
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.11
513 0.13
514 0.13
515 0.13
516 0.14
517 0.15
518 0.22
519 0.27
520 0.27
521 0.25
522 0.26
523 0.27
524 0.31
525 0.31
526 0.25
527 0.21
528 0.18
529 0.17
530 0.17
531 0.16
532 0.12
533 0.1
534 0.12
535 0.11
536 0.12
537 0.13
538 0.12
539 0.1
540 0.1
541 0.11
542 0.09
543 0.09
544 0.07
545 0.07
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.06
550 0.07
551 0.08
552 0.08
553 0.07
554 0.09
555 0.1
556 0.1
557 0.14
558 0.14
559 0.14
560 0.13
561 0.16
562 0.16
563 0.16
564 0.16
565 0.13
566 0.13
567 0.12
568 0.12
569 0.1
570 0.08
571 0.09
572 0.08
573 0.09
574 0.08
575 0.09
576 0.09
577 0.08
578 0.09
579 0.08
580 0.08
581 0.1
582 0.1
583 0.11
584 0.18
585 0.2
586 0.22
587 0.24
588 0.24
589 0.23
590 0.26
591 0.26
592 0.21
593 0.21
594 0.22
595 0.22
596 0.22
597 0.22
598 0.19
599 0.19
600 0.19
601 0.18
602 0.15
603 0.15
604 0.14
605 0.13
606 0.13
607 0.13
608 0.12
609 0.15
610 0.17
611 0.17
612 0.18
613 0.18
614 0.18
615 0.17
616 0.17
617 0.13
618 0.11
619 0.09
620 0.1
621 0.1
622 0.09
623 0.13
624 0.16
625 0.19
626 0.24
627 0.27
628 0.27
629 0.32
630 0.4
631 0.4
632 0.4
633 0.38
634 0.33
635 0.32
636 0.33
637 0.34
638 0.31
639 0.34
640 0.36
641 0.38
642 0.39
643 0.4
644 0.4
645 0.37
646 0.4
647 0.41
648 0.45
649 0.47
650 0.5
651 0.52
652 0.51
653 0.48
654 0.41
655 0.35
656 0.25
657 0.2
658 0.18
659 0.14
660 0.13
661 0.13
662 0.11
663 0.11
664 0.12
665 0.11
666 0.09
667 0.09
668 0.08
669 0.09
670 0.14
671 0.17
672 0.17
673 0.19
674 0.2
675 0.19
676 0.21
677 0.19
678 0.16
679 0.14
680 0.15
681 0.15
682 0.15
683 0.15
684 0.16
685 0.2
686 0.18
687 0.19
688 0.23
689 0.27
690 0.33
691 0.42
692 0.47
693 0.47
694 0.57
695 0.63
696 0.69
697 0.74
698 0.78
699 0.79
700 0.81
701 0.85
702 0.8
703 0.83
704 0.83
705 0.81
706 0.79
707 0.77
708 0.75
709 0.68
710 0.67
711 0.66
712 0.65
713 0.64
714 0.66
715 0.66
716 0.63
717 0.7
718 0.71
719 0.7
720 0.68
721 0.64
722 0.63
723 0.57
724 0.61
725 0.6
726 0.57
727 0.51
728 0.48
729 0.46
730 0.43
731 0.49
732 0.49
733 0.47
734 0.5
735 0.52
736 0.54
737 0.54
738 0.52
739 0.47
740 0.4
741 0.4
742 0.36
743 0.33
744 0.3
745 0.26
746 0.22
747 0.19
748 0.17
749 0.12
750 0.1
751 0.1
752 0.08
753 0.08
754 0.08
755 0.08
756 0.09
757 0.1
758 0.1
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.1
763 0.11
764 0.1
765 0.1
766 0.11
767 0.11
768 0.11
769 0.11
770 0.1
771 0.09
772 0.1
773 0.14
774 0.16
775 0.16
776 0.17
777 0.23
778 0.27
779 0.37
780 0.45
781 0.51
782 0.58
783 0.69
784 0.78
785 0.82
786 0.87
787 0.88
788 0.88
789 0.89
790 0.86
791 0.84
792 0.82
793 0.77
794 0.73
795 0.7
796 0.61
797 0.57
798 0.53
799 0.5
800 0.48
801 0.51
802 0.53
803 0.56
804 0.61
805 0.62
806 0.65