Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DXK9

Protein Details
Accession A5DXK9    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
644-665EGKRKFDERKQRGGRNQKYNTRBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.333, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR022712  Beta_Casp  
IPR027075  CPSF2  
IPR025069  Cpsf2_C  
IPR035639  CPSF2_MBL  
IPR001279  Metallo-B-lactamas  
IPR036866  RibonucZ/Hydroxyglut_hydro  
Gene Ontology GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
KEGG lel:LELG_02096  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10996  Beta-Casp  
PF13299  CPSF100_C  
PF16661  Lactamase_B_6  
CDD cd16293  CPSF2-like_MBL-fold  
Amino Acid Sequences MFTFSLLSPEENDRSFKASLLTFDNEHRILADPSWSGSDALVVKFMEQYLPSIDAIIISHSTTEFISGYILLCIYFPKIMLTIPVYSTLPVNQLGRISTVEYYRSQGVLGPVLSSLIELDEIDNWFDKFKTVKYLQNITLCDGKLTMTPYNSGHSLGGTFWLIVKRIDRVIYAPSWNHSRDSLLNNAGFINTQTGMPHVGLLRPTAFVTGADLGSNLSHKKRCEKFLQLVDATLNNGGAAIIPTSISGRFLELFHLVDQHLKGAPIPVYFFSYSGTKILSYASGLMDWMSSSFNKAWNIENLRDDQLPFNPSKVDLLLDPSELMQMRGPKIIFCSGIDLTNGDLSSKVFLYLCNDEKTTVILTEKPSLLLALQKDSGNSMASISKELYNNWVKLAKSRTGKATDGVAVPLETVLKLDQWMVEEEVTGEDLINFRNEITAKRKEKLIAKVRDQKIQNLLNTDNIEGEDSSDDDDDDDDDDDDNNNNNNNNNSYEGVTGLKRDERKAGEIFDQQVKKGQKSVISNNDKAYNINNNNINNNNNLKNPRNNHDLTNTSSVAVTAPTVEEVDELIQHEAFIMDYIKQSMAKHLPIDIKVTHKLKPRQAMFPYFQSSIAARTNFDDYGQIIDHKDFVKKDEISHSKIIMEGKRKFDERKQRGGRNQKYNTRVDNDEKRDKTNAKSNKLTPQEQVNQQLLHKYLDTLSKPLKRVLLEMQPSAKTQIQIRCGLAFVDLSGSVDMRSLGIIVQALKPYNLILLPDLRTSDENGESGLSQVEHFFQQQQTEQAMEHSKRQLFNSSRYLSLASIRDGLATAYSRGAGGAGGVGGVGGGSNSNKMNVLVPLPDKPIKIGNDSESDSIGLSNFEVNLDDELVSTLKWKKVGDNYKVAKIYGELEINNQSPFMESQNSATGQTVTESTDDMADVPPTKKQKKLFADYVNSSTQFSLKPVDPNSTLRNSQNSIINRIQDPKLRAMISNASPKLAIGNVRLPDLKNKLLALTVNNQPLKVEFKSEGTLVVNGQIAIRKISYSGVGMGDAGDGDESGGDIVIDGNIGPLYYRIKEVIREMLAYV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.27
4 0.25
5 0.23
6 0.25
7 0.27
8 0.29
9 0.27
10 0.3
11 0.35
12 0.32
13 0.3
14 0.27
15 0.25
16 0.24
17 0.22
18 0.23
19 0.17
20 0.19
21 0.21
22 0.21
23 0.18
24 0.16
25 0.19
26 0.18
27 0.18
28 0.19
29 0.16
30 0.16
31 0.17
32 0.17
33 0.15
34 0.13
35 0.14
36 0.15
37 0.17
38 0.16
39 0.16
40 0.15
41 0.13
42 0.13
43 0.13
44 0.11
45 0.09
46 0.1
47 0.09
48 0.11
49 0.1
50 0.11
51 0.09
52 0.08
53 0.09
54 0.09
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.1
66 0.11
67 0.14
68 0.16
69 0.16
70 0.17
71 0.19
72 0.18
73 0.18
74 0.19
75 0.17
76 0.17
77 0.18
78 0.18
79 0.17
80 0.18
81 0.19
82 0.19
83 0.19
84 0.18
85 0.18
86 0.19
87 0.2
88 0.2
89 0.22
90 0.22
91 0.21
92 0.19
93 0.2
94 0.2
95 0.2
96 0.19
97 0.16
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.11
102 0.09
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.08
108 0.09
109 0.1
110 0.11
111 0.11
112 0.12
113 0.12
114 0.14
115 0.14
116 0.16
117 0.24
118 0.27
119 0.34
120 0.4
121 0.47
122 0.5
123 0.54
124 0.54
125 0.47
126 0.48
127 0.41
128 0.35
129 0.28
130 0.23
131 0.19
132 0.21
133 0.22
134 0.18
135 0.2
136 0.21
137 0.24
138 0.24
139 0.23
140 0.19
141 0.16
142 0.16
143 0.13
144 0.14
145 0.11
146 0.1
147 0.11
148 0.13
149 0.13
150 0.14
151 0.16
152 0.17
153 0.2
154 0.21
155 0.19
156 0.19
157 0.23
158 0.24
159 0.27
160 0.25
161 0.26
162 0.31
163 0.31
164 0.31
165 0.28
166 0.28
167 0.28
168 0.31
169 0.33
170 0.32
171 0.31
172 0.3
173 0.29
174 0.26
175 0.21
176 0.18
177 0.14
178 0.1
179 0.1
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.11
184 0.13
185 0.11
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.14
192 0.13
193 0.12
194 0.1
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.12
203 0.13
204 0.16
205 0.2
206 0.23
207 0.33
208 0.39
209 0.46
210 0.51
211 0.57
212 0.61
213 0.64
214 0.69
215 0.59
216 0.54
217 0.49
218 0.41
219 0.34
220 0.25
221 0.17
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.04
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.08
234 0.07
235 0.09
236 0.1
237 0.1
238 0.12
239 0.13
240 0.14
241 0.13
242 0.14
243 0.13
244 0.15
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.12
249 0.12
250 0.14
251 0.15
252 0.13
253 0.15
254 0.14
255 0.17
256 0.17
257 0.17
258 0.16
259 0.15
260 0.16
261 0.15
262 0.15
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.06
278 0.09
279 0.1
280 0.14
281 0.16
282 0.18
283 0.2
284 0.26
285 0.31
286 0.31
287 0.32
288 0.31
289 0.32
290 0.32
291 0.3
292 0.25
293 0.23
294 0.23
295 0.21
296 0.19
297 0.17
298 0.16
299 0.16
300 0.15
301 0.12
302 0.1
303 0.14
304 0.14
305 0.13
306 0.13
307 0.12
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.11
312 0.13
313 0.14
314 0.17
315 0.17
316 0.16
317 0.18
318 0.2
319 0.19
320 0.15
321 0.19
322 0.16
323 0.17
324 0.17
325 0.14
326 0.13
327 0.13
328 0.13
329 0.08
330 0.08
331 0.07
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.07
336 0.07
337 0.12
338 0.16
339 0.19
340 0.2
341 0.2
342 0.2
343 0.2
344 0.21
345 0.17
346 0.14
347 0.12
348 0.12
349 0.14
350 0.18
351 0.17
352 0.16
353 0.15
354 0.15
355 0.14
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.13
360 0.13
361 0.13
362 0.14
363 0.14
364 0.12
365 0.11
366 0.09
367 0.09
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.13
372 0.13
373 0.14
374 0.19
375 0.22
376 0.22
377 0.23
378 0.25
379 0.23
380 0.27
381 0.31
382 0.31
383 0.31
384 0.33
385 0.37
386 0.37
387 0.38
388 0.34
389 0.32
390 0.27
391 0.23
392 0.21
393 0.16
394 0.11
395 0.1
396 0.09
397 0.07
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.04
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.07
406 0.08
407 0.08
408 0.08
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.07
413 0.06
414 0.05
415 0.04
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.05
420 0.05
421 0.07
422 0.08
423 0.11
424 0.17
425 0.26
426 0.29
427 0.31
428 0.33
429 0.36
430 0.42
431 0.49
432 0.52
433 0.5
434 0.56
435 0.64
436 0.64
437 0.67
438 0.61
439 0.55
440 0.53
441 0.5
442 0.42
443 0.36
444 0.34
445 0.3
446 0.3
447 0.26
448 0.19
449 0.14
450 0.13
451 0.1
452 0.1
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.06
458 0.05
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.06
466 0.06
467 0.07
468 0.08
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.12
474 0.13
475 0.13
476 0.14
477 0.14
478 0.13
479 0.13
480 0.12
481 0.13
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.13
486 0.14
487 0.15
488 0.19
489 0.19
490 0.22
491 0.23
492 0.24
493 0.24
494 0.24
495 0.26
496 0.27
497 0.26
498 0.22
499 0.27
500 0.27
501 0.24
502 0.25
503 0.24
504 0.23
505 0.27
506 0.34
507 0.38
508 0.42
509 0.43
510 0.42
511 0.43
512 0.39
513 0.35
514 0.3
515 0.28
516 0.24
517 0.26
518 0.28
519 0.26
520 0.28
521 0.3
522 0.28
523 0.23
524 0.25
525 0.23
526 0.23
527 0.26
528 0.28
529 0.32
530 0.35
531 0.36
532 0.39
533 0.39
534 0.37
535 0.37
536 0.36
537 0.33
538 0.34
539 0.29
540 0.23
541 0.21
542 0.19
543 0.15
544 0.13
545 0.09
546 0.04
547 0.04
548 0.04
549 0.04
550 0.04
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.04
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.05
560 0.05
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.05
566 0.06
567 0.06
568 0.08
569 0.08
570 0.12
571 0.14
572 0.15
573 0.15
574 0.18
575 0.21
576 0.2
577 0.23
578 0.2
579 0.21
580 0.25
581 0.27
582 0.28
583 0.34
584 0.4
585 0.42
586 0.49
587 0.49
588 0.5
589 0.52
590 0.53
591 0.48
592 0.45
593 0.44
594 0.37
595 0.33
596 0.27
597 0.23
598 0.2
599 0.21
600 0.17
601 0.13
602 0.14
603 0.16
604 0.15
605 0.15
606 0.12
607 0.1
608 0.11
609 0.11
610 0.1
611 0.09
612 0.09
613 0.11
614 0.11
615 0.14
616 0.12
617 0.14
618 0.2
619 0.2
620 0.22
621 0.29
622 0.33
623 0.34
624 0.36
625 0.34
626 0.28
627 0.29
628 0.32
629 0.27
630 0.31
631 0.31
632 0.34
633 0.37
634 0.39
635 0.41
636 0.45
637 0.52
638 0.51
639 0.57
640 0.6
641 0.65
642 0.72
643 0.8
644 0.81
645 0.8
646 0.81
647 0.78
648 0.76
649 0.73
650 0.68
651 0.61
652 0.56
653 0.53
654 0.54
655 0.54
656 0.57
657 0.53
658 0.52
659 0.53
660 0.52
661 0.49
662 0.49
663 0.5
664 0.48
665 0.52
666 0.53
667 0.56
668 0.59
669 0.57
670 0.5
671 0.49
672 0.48
673 0.46
674 0.48
675 0.42
676 0.37
677 0.35
678 0.35
679 0.29
680 0.24
681 0.2
682 0.15
683 0.14
684 0.18
685 0.19
686 0.2
687 0.26
688 0.3
689 0.31
690 0.33
691 0.35
692 0.3
693 0.32
694 0.33
695 0.34
696 0.32
697 0.32
698 0.33
699 0.31
700 0.31
701 0.31
702 0.28
703 0.21
704 0.24
705 0.27
706 0.28
707 0.3
708 0.31
709 0.28
710 0.26
711 0.25
712 0.2
713 0.14
714 0.1
715 0.08
716 0.06
717 0.07
718 0.06
719 0.06
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.05
724 0.05
725 0.04
726 0.04
727 0.05
728 0.05
729 0.07
730 0.08
731 0.1
732 0.1
733 0.1
734 0.1
735 0.1
736 0.1
737 0.09
738 0.08
739 0.08
740 0.11
741 0.13
742 0.13
743 0.14
744 0.14
745 0.15
746 0.16
747 0.18
748 0.15
749 0.14
750 0.13
751 0.13
752 0.12
753 0.11
754 0.1
755 0.07
756 0.06
757 0.07
758 0.08
759 0.09
760 0.09
761 0.12
762 0.12
763 0.14
764 0.16
765 0.18
766 0.18
767 0.17
768 0.17
769 0.17
770 0.23
771 0.22
772 0.26
773 0.29
774 0.32
775 0.33
776 0.35
777 0.41
778 0.38
779 0.43
780 0.47
781 0.43
782 0.41
783 0.39
784 0.39
785 0.3
786 0.31
787 0.26
788 0.19
789 0.19
790 0.17
791 0.17
792 0.15
793 0.15
794 0.11
795 0.11
796 0.1
797 0.09
798 0.09
799 0.08
800 0.08
801 0.08
802 0.06
803 0.05
804 0.04
805 0.04
806 0.03
807 0.03
808 0.03
809 0.02
810 0.02
811 0.02
812 0.02
813 0.03
814 0.03
815 0.06
816 0.06
817 0.07
818 0.08
819 0.09
820 0.1
821 0.11
822 0.12
823 0.14
824 0.16
825 0.18
826 0.23
827 0.25
828 0.24
829 0.24
830 0.29
831 0.28
832 0.3
833 0.3
834 0.28
835 0.3
836 0.32
837 0.31
838 0.25
839 0.23
840 0.19
841 0.16
842 0.13
843 0.09
844 0.07
845 0.07
846 0.07
847 0.06
848 0.07
849 0.08
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.08
854 0.09
855 0.09
856 0.08
857 0.11
858 0.15
859 0.16
860 0.19
861 0.2
862 0.25
863 0.35
864 0.45
865 0.48
866 0.54
867 0.56
868 0.6
869 0.61
870 0.55
871 0.46
872 0.37
873 0.33
874 0.26
875 0.24
876 0.17
877 0.19
878 0.23
879 0.23
880 0.22
881 0.2
882 0.16
883 0.15
884 0.16
885 0.15
886 0.15
887 0.14
888 0.17
889 0.22
890 0.23
891 0.22
892 0.22
893 0.19
894 0.16
895 0.16
896 0.15
897 0.11
898 0.11
899 0.11
900 0.1
901 0.1
902 0.09
903 0.09
904 0.09
905 0.1
906 0.13
907 0.13
908 0.19
909 0.28
910 0.33
911 0.39
912 0.44
913 0.52
914 0.59
915 0.67
916 0.7
917 0.69
918 0.73
919 0.71
920 0.69
921 0.63
922 0.55
923 0.47
924 0.38
925 0.32
926 0.24
927 0.21
928 0.22
929 0.2
930 0.25
931 0.27
932 0.32
933 0.33
934 0.37
935 0.42
936 0.43
937 0.44
938 0.41
939 0.45
940 0.42
941 0.42
942 0.45
943 0.43
944 0.44
945 0.44
946 0.44
947 0.41
948 0.44
949 0.45
950 0.44
951 0.45
952 0.43
953 0.45
954 0.42
955 0.4
956 0.39
957 0.41
958 0.41
959 0.46
960 0.41
961 0.36
962 0.35
963 0.34
964 0.31
965 0.27
966 0.24
967 0.18
968 0.24
969 0.24
970 0.28
971 0.3
972 0.3
973 0.35
974 0.38
975 0.37
976 0.33
977 0.33
978 0.31
979 0.31
980 0.32
981 0.28
982 0.28
983 0.31
984 0.37
985 0.37
986 0.36
987 0.34
988 0.34
989 0.36
990 0.31
991 0.29
992 0.23
993 0.25
994 0.28
995 0.27
996 0.28
997 0.24
998 0.24
999 0.19
1000 0.2
1001 0.17
1002 0.15
1003 0.16
1004 0.17
1005 0.15
1006 0.16
1007 0.16
1008 0.14
1009 0.14
1010 0.16
1011 0.16
1012 0.14
1013 0.16
1014 0.14
1015 0.14
1016 0.14
1017 0.13
1018 0.12
1019 0.1
1020 0.08
1021 0.06
1022 0.05
1023 0.05
1024 0.04
1025 0.04
1026 0.04
1027 0.04
1028 0.04
1029 0.04
1030 0.04
1031 0.04
1032 0.04
1033 0.04
1034 0.05
1035 0.05
1036 0.05
1037 0.05
1038 0.07
1039 0.11
1040 0.13
1041 0.15
1042 0.18
1043 0.2
1044 0.24
1045 0.28
1046 0.34
1047 0.32