Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5E1T1

Protein Details
Accession A5E1T1    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
161-190EEEERKEAKRKAKELKRRRKEKGNDPWTSYBasic
510-530GGKYSWNKKKIFKGHHNAGYGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
165-182RKEAKRKAKELKRRRKEK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 2.5, cyto_mito 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032847  PRPF17  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0071013  C:catalytic step 2 spliceosome  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG lel:LELG_03568  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MCARYRDAHCAYGNIKLDRYHTISPITSLRPIHNFLSFLFFSFPFFFTKSMMSLVGDYASDSDNETNGSVSGHEDSNKIIDDIHSDIGDKVEPIRKKARLSEKDPENGELQVTKKEVEVEVEVEVELLHLLLLLLLKQKSPSPLLQQLPTPLHLKSEFEIEEEERKEAKRKAKELKRRRKEKGNDPWTSYTDDFVVQPKVNTAFDTEHENGLAPNINRSAMKSEVENGDVDDENEHEHERDDNGEGDASYEFKPTSELMRFSEDEVLKHQSLLQVPTKLQDKLRKPTKTWRFPKSGIVQTIPLAHRKGVNKLQFIPHLGHLLLSCGNDNLIKLWRARQKDEKFELARIYRGHRLAVKDICFNSTGDRFLSCGYDKIIRLWDTETGNVIKTIQVSSVPNVVRFRPEHENEFIAGLSNHEIHHFDIESIQLQSPLQIYDHHVGSINDILVTNEGFISTADDKTMRVWKWRVNSPTKAITGASLFSIPSVKKRPNSKHIVLQSMDNTIKVLDGGKYSWNKKKIFKGHHNAGYGIEIDVAPDGKMVMSGDSRGFVFFWDWEMKKVQLKLKLSDRPIKSVAVQPLKTSSIAAAGISGDIYYCS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.4
3 0.36
4 0.37
5 0.38
6 0.43
7 0.38
8 0.34
9 0.36
10 0.34
11 0.36
12 0.38
13 0.35
14 0.34
15 0.34
16 0.36
17 0.36
18 0.39
19 0.38
20 0.36
21 0.34
22 0.3
23 0.34
24 0.3
25 0.26
26 0.25
27 0.22
28 0.23
29 0.24
30 0.24
31 0.2
32 0.22
33 0.21
34 0.19
35 0.21
36 0.19
37 0.19
38 0.19
39 0.16
40 0.15
41 0.15
42 0.14
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.08
57 0.1
58 0.12
59 0.12
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.16
64 0.17
65 0.15
66 0.13
67 0.12
68 0.14
69 0.16
70 0.17
71 0.15
72 0.15
73 0.15
74 0.16
75 0.16
76 0.13
77 0.14
78 0.2
79 0.22
80 0.27
81 0.35
82 0.39
83 0.43
84 0.52
85 0.59
86 0.61
87 0.66
88 0.7
89 0.69
90 0.71
91 0.68
92 0.62
93 0.52
94 0.43
95 0.37
96 0.3
97 0.24
98 0.21
99 0.2
100 0.18
101 0.17
102 0.19
103 0.18
104 0.18
105 0.18
106 0.15
107 0.14
108 0.14
109 0.13
110 0.11
111 0.1
112 0.07
113 0.06
114 0.04
115 0.03
116 0.03
117 0.03
118 0.03
119 0.04
120 0.04
121 0.09
122 0.09
123 0.1
124 0.12
125 0.14
126 0.17
127 0.2
128 0.23
129 0.26
130 0.34
131 0.37
132 0.38
133 0.38
134 0.4
135 0.39
136 0.38
137 0.32
138 0.24
139 0.24
140 0.23
141 0.23
142 0.18
143 0.22
144 0.19
145 0.18
146 0.21
147 0.19
148 0.24
149 0.23
150 0.24
151 0.21
152 0.22
153 0.28
154 0.32
155 0.39
156 0.42
157 0.49
158 0.58
159 0.66
160 0.76
161 0.81
162 0.86
163 0.88
164 0.9
165 0.89
166 0.89
167 0.88
168 0.88
169 0.88
170 0.87
171 0.82
172 0.77
173 0.73
174 0.64
175 0.6
176 0.49
177 0.39
178 0.29
179 0.25
180 0.19
181 0.18
182 0.19
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.17
187 0.17
188 0.16
189 0.16
190 0.14
191 0.15
192 0.22
193 0.21
194 0.19
195 0.18
196 0.18
197 0.15
198 0.15
199 0.18
200 0.1
201 0.11
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.17
207 0.15
208 0.16
209 0.14
210 0.16
211 0.17
212 0.18
213 0.16
214 0.13
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.09
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.08
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.13
243 0.13
244 0.15
245 0.16
246 0.2
247 0.2
248 0.2
249 0.26
250 0.23
251 0.21
252 0.22
253 0.24
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.15
258 0.17
259 0.2
260 0.2
261 0.18
262 0.18
263 0.21
264 0.23
265 0.22
266 0.25
267 0.29
268 0.32
269 0.4
270 0.49
271 0.5
272 0.5
273 0.59
274 0.65
275 0.68
276 0.7
277 0.67
278 0.65
279 0.63
280 0.67
281 0.63
282 0.59
283 0.5
284 0.43
285 0.37
286 0.31
287 0.34
288 0.28
289 0.23
290 0.18
291 0.17
292 0.2
293 0.2
294 0.26
295 0.28
296 0.32
297 0.32
298 0.33
299 0.36
300 0.33
301 0.33
302 0.29
303 0.23
304 0.19
305 0.17
306 0.15
307 0.12
308 0.11
309 0.11
310 0.09
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.07
317 0.08
318 0.1
319 0.1
320 0.17
321 0.23
322 0.26
323 0.31
324 0.4
325 0.44
326 0.51
327 0.54
328 0.55
329 0.51
330 0.5
331 0.5
332 0.41
333 0.39
334 0.31
335 0.31
336 0.28
337 0.27
338 0.27
339 0.25
340 0.27
341 0.29
342 0.32
343 0.3
344 0.29
345 0.29
346 0.28
347 0.26
348 0.24
349 0.21
350 0.18
351 0.17
352 0.13
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.14
357 0.12
358 0.11
359 0.12
360 0.16
361 0.16
362 0.17
363 0.22
364 0.2
365 0.2
366 0.2
367 0.23
368 0.2
369 0.2
370 0.2
371 0.16
372 0.16
373 0.15
374 0.14
375 0.11
376 0.1
377 0.1
378 0.08
379 0.1
380 0.11
381 0.12
382 0.18
383 0.17
384 0.2
385 0.21
386 0.21
387 0.24
388 0.23
389 0.27
390 0.3
391 0.33
392 0.34
393 0.35
394 0.36
395 0.31
396 0.31
397 0.26
398 0.18
399 0.15
400 0.11
401 0.1
402 0.09
403 0.09
404 0.09
405 0.11
406 0.1
407 0.12
408 0.12
409 0.1
410 0.1
411 0.11
412 0.11
413 0.12
414 0.11
415 0.1
416 0.09
417 0.1
418 0.1
419 0.1
420 0.09
421 0.09
422 0.13
423 0.16
424 0.17
425 0.16
426 0.17
427 0.17
428 0.18
429 0.18
430 0.14
431 0.11
432 0.11
433 0.1
434 0.09
435 0.09
436 0.08
437 0.06
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.09
442 0.1
443 0.1
444 0.11
445 0.12
446 0.12
447 0.15
448 0.23
449 0.2
450 0.26
451 0.3
452 0.35
453 0.42
454 0.5
455 0.55
456 0.56
457 0.61
458 0.59
459 0.61
460 0.57
461 0.51
462 0.43
463 0.36
464 0.29
465 0.23
466 0.18
467 0.13
468 0.11
469 0.1
470 0.14
471 0.13
472 0.18
473 0.25
474 0.3
475 0.36
476 0.47
477 0.56
478 0.62
479 0.71
480 0.7
481 0.72
482 0.72
483 0.72
484 0.63
485 0.58
486 0.5
487 0.47
488 0.41
489 0.32
490 0.26
491 0.19
492 0.18
493 0.14
494 0.14
495 0.09
496 0.1
497 0.11
498 0.18
499 0.26
500 0.33
501 0.41
502 0.47
503 0.51
504 0.57
505 0.66
506 0.7
507 0.73
508 0.77
509 0.79
510 0.81
511 0.83
512 0.78
513 0.69
514 0.59
515 0.5
516 0.4
517 0.3
518 0.21
519 0.13
520 0.1
521 0.1
522 0.1
523 0.08
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.09
531 0.11
532 0.12
533 0.13
534 0.14
535 0.14
536 0.13
537 0.12
538 0.13
539 0.11
540 0.15
541 0.22
542 0.22
543 0.24
544 0.28
545 0.31
546 0.35
547 0.41
548 0.44
549 0.44
550 0.48
551 0.54
552 0.6
553 0.64
554 0.66
555 0.69
556 0.66
557 0.64
558 0.61
559 0.56
560 0.5
561 0.49
562 0.51
563 0.51
564 0.49
565 0.44
566 0.46
567 0.46
568 0.42
569 0.36
570 0.26
571 0.2
572 0.19
573 0.17
574 0.13
575 0.11
576 0.11
577 0.1
578 0.09