Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Y8DC47

Protein Details
Accession A0A4Y8DC47    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-43LEFSKYQRTSKTRRVRSIPVTGTHydrophilic
534-555GWPMPSFRKKAHRKQPENVGLVHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto 8.5, cyto_mito 6.5, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021122  RNA_ligase_dom_REL/Rnl2  
Pfam View protein in Pfam  
PF09414  RNA_ligase  
Amino Acid Sequences MVPKKDTLYPKISGKPKNLLLEFSKYQRTSKTRRVRSIPVTGTVKLHGTHGDIRITADDTIYLQTRNSDALTPALDSLKFLDFMQPARMEILVLKKQFYSRFMKLNPKVKINDEHPLIIAGEWIGPKIQKDVAVSALPDRYFVIISVSINNEWQPDEPYSDIENESIHIVNISRGGFFHETIELKNSEPAFAKMQALADAVEKECPFAKTFGLIGLGEGIVWKPSAPLCHDAKYWLKLKGPISMGIVEAGDAARMPQRSSFIAPVFATPASSPAAAKRATPKRKISNATSQQNAVGTHIFSASPSSVAASRASNKPVGNPLLLEGLSLKEFPSLPASNSVMTSKIFNQTVNTMMPPEGSGWIEYPVASTSIPLRINKIVGGSSGESRVDENGTSSPSLPRQVSDVSSEFQGSRPGSLMAGKADERKSRSPGTVRKDTRRSIAWKNVNPISPENARLLETLKSAPVTPEMFQRARSEIMSLFQTSSPEKLPTMPKKKDEHTSEVSKSIESVISSPVALRETACESSNDGDQEEGGWPMPSFRKKAHRKQPENVGLVPLITATEEVKAIESEHAQLSPVPSKVGGDNRGSSETTKPACAPLILKKIEGSEVTAARNFANEVIWEKRLEQGWQYLLEKGERTERQNAEKFLNWLWEDVEVEEEVEIEELELNVILLKKEIFKIGRDWYFEHLAFEEQSENWGVGAAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.66
3 0.67
4 0.7
5 0.64
6 0.61
7 0.57
8 0.57
9 0.55
10 0.52
11 0.54
12 0.46
13 0.48
14 0.52
15 0.56
16 0.57
17 0.63
18 0.69
19 0.7
20 0.78
21 0.82
22 0.83
23 0.82
24 0.83
25 0.76
26 0.74
27 0.68
28 0.6
29 0.54
30 0.46
31 0.41
32 0.31
33 0.29
34 0.22
35 0.22
36 0.26
37 0.27
38 0.27
39 0.25
40 0.26
41 0.26
42 0.26
43 0.22
44 0.17
45 0.14
46 0.13
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.12
51 0.14
52 0.15
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.15
57 0.17
58 0.17
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.19
69 0.18
70 0.2
71 0.26
72 0.24
73 0.23
74 0.23
75 0.23
76 0.17
77 0.18
78 0.25
79 0.25
80 0.26
81 0.26
82 0.27
83 0.32
84 0.35
85 0.38
86 0.38
87 0.36
88 0.44
89 0.48
90 0.58
91 0.62
92 0.67
93 0.67
94 0.66
95 0.65
96 0.62
97 0.64
98 0.57
99 0.57
100 0.51
101 0.46
102 0.39
103 0.37
104 0.32
105 0.23
106 0.19
107 0.11
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.1
114 0.13
115 0.14
116 0.15
117 0.17
118 0.18
119 0.21
120 0.21
121 0.21
122 0.21
123 0.23
124 0.2
125 0.18
126 0.17
127 0.15
128 0.14
129 0.13
130 0.13
131 0.11
132 0.12
133 0.14
134 0.16
135 0.15
136 0.16
137 0.16
138 0.14
139 0.14
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.16
144 0.16
145 0.18
146 0.18
147 0.19
148 0.19
149 0.16
150 0.15
151 0.13
152 0.14
153 0.11
154 0.1
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.09
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.16
166 0.17
167 0.17
168 0.18
169 0.22
170 0.18
171 0.17
172 0.21
173 0.19
174 0.18
175 0.18
176 0.2
177 0.2
178 0.2
179 0.2
180 0.17
181 0.17
182 0.16
183 0.15
184 0.13
185 0.11
186 0.11
187 0.11
188 0.12
189 0.12
190 0.12
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.14
195 0.14
196 0.12
197 0.13
198 0.13
199 0.13
200 0.11
201 0.1
202 0.1
203 0.09
204 0.07
205 0.07
206 0.06
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.09
213 0.11
214 0.17
215 0.2
216 0.23
217 0.23
218 0.27
219 0.3
220 0.33
221 0.34
222 0.32
223 0.32
224 0.35
225 0.36
226 0.38
227 0.35
228 0.32
229 0.29
230 0.26
231 0.24
232 0.19
233 0.17
234 0.11
235 0.09
236 0.07
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.09
244 0.11
245 0.13
246 0.16
247 0.19
248 0.16
249 0.19
250 0.19
251 0.18
252 0.17
253 0.15
254 0.14
255 0.1
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.13
262 0.12
263 0.14
264 0.22
265 0.31
266 0.39
267 0.46
268 0.53
269 0.58
270 0.65
271 0.7
272 0.66
273 0.67
274 0.68
275 0.66
276 0.59
277 0.51
278 0.44
279 0.4
280 0.34
281 0.24
282 0.16
283 0.11
284 0.09
285 0.09
286 0.08
287 0.07
288 0.08
289 0.07
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.09
296 0.09
297 0.13
298 0.15
299 0.17
300 0.2
301 0.19
302 0.2
303 0.23
304 0.23
305 0.2
306 0.18
307 0.17
308 0.15
309 0.14
310 0.13
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.06
317 0.06
318 0.07
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.15
323 0.16
324 0.15
325 0.16
326 0.16
327 0.12
328 0.11
329 0.12
330 0.1
331 0.13
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.13
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.1
340 0.09
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.07
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.11
358 0.13
359 0.13
360 0.15
361 0.15
362 0.16
363 0.16
364 0.16
365 0.11
366 0.1
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.1
371 0.1
372 0.09
373 0.09
374 0.1
375 0.08
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.09
382 0.1
383 0.11
384 0.14
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.15
389 0.15
390 0.17
391 0.17
392 0.15
393 0.15
394 0.16
395 0.14
396 0.13
397 0.16
398 0.13
399 0.12
400 0.12
401 0.12
402 0.11
403 0.12
404 0.13
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.15
409 0.18
410 0.21
411 0.25
412 0.27
413 0.31
414 0.32
415 0.36
416 0.39
417 0.43
418 0.47
419 0.53
420 0.56
421 0.6
422 0.65
423 0.62
424 0.59
425 0.57
426 0.55
427 0.53
428 0.57
429 0.57
430 0.53
431 0.57
432 0.57
433 0.54
434 0.5
435 0.44
436 0.39
437 0.32
438 0.3
439 0.26
440 0.23
441 0.21
442 0.19
443 0.18
444 0.15
445 0.14
446 0.13
447 0.12
448 0.12
449 0.11
450 0.12
451 0.13
452 0.13
453 0.13
454 0.17
455 0.22
456 0.22
457 0.24
458 0.25
459 0.25
460 0.24
461 0.24
462 0.21
463 0.16
464 0.17
465 0.17
466 0.15
467 0.14
468 0.13
469 0.15
470 0.14
471 0.15
472 0.15
473 0.15
474 0.14
475 0.18
476 0.27
477 0.35
478 0.44
479 0.49
480 0.54
481 0.59
482 0.63
483 0.68
484 0.65
485 0.62
486 0.59
487 0.6
488 0.55
489 0.53
490 0.48
491 0.39
492 0.33
493 0.26
494 0.21
495 0.14
496 0.13
497 0.1
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.1
506 0.13
507 0.15
508 0.16
509 0.15
510 0.16
511 0.17
512 0.2
513 0.18
514 0.14
515 0.12
516 0.12
517 0.12
518 0.11
519 0.1
520 0.08
521 0.08
522 0.07
523 0.11
524 0.17
525 0.2
526 0.22
527 0.28
528 0.38
529 0.48
530 0.59
531 0.67
532 0.72
533 0.76
534 0.81
535 0.87
536 0.85
537 0.79
538 0.69
539 0.61
540 0.49
541 0.41
542 0.32
543 0.21
544 0.12
545 0.08
546 0.07
547 0.05
548 0.06
549 0.06
550 0.07
551 0.07
552 0.08
553 0.09
554 0.1
555 0.1
556 0.12
557 0.13
558 0.13
559 0.12
560 0.13
561 0.16
562 0.18
563 0.18
564 0.16
565 0.15
566 0.17
567 0.21
568 0.26
569 0.27
570 0.27
571 0.29
572 0.32
573 0.34
574 0.34
575 0.32
576 0.29
577 0.31
578 0.29
579 0.29
580 0.26
581 0.26
582 0.26
583 0.26
584 0.26
585 0.27
586 0.34
587 0.33
588 0.33
589 0.32
590 0.32
591 0.33
592 0.3
593 0.25
594 0.21
595 0.22
596 0.24
597 0.24
598 0.24
599 0.21
600 0.21
601 0.18
602 0.14
603 0.13
604 0.12
605 0.15
606 0.18
607 0.2
608 0.2
609 0.2
610 0.24
611 0.25
612 0.26
613 0.25
614 0.27
615 0.28
616 0.31
617 0.32
618 0.3
619 0.3
620 0.31
621 0.29
622 0.25
623 0.31
624 0.32
625 0.35
626 0.42
627 0.45
628 0.52
629 0.58
630 0.59
631 0.55
632 0.54
633 0.52
634 0.45
635 0.47
636 0.38
637 0.32
638 0.29
639 0.26
640 0.23
641 0.2
642 0.2
643 0.12
644 0.12
645 0.11
646 0.1
647 0.08
648 0.07
649 0.07
650 0.05
651 0.06
652 0.05
653 0.06
654 0.05
655 0.05
656 0.07
657 0.08
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.13
662 0.15
663 0.22
664 0.23
665 0.24
666 0.3
667 0.38
668 0.43
669 0.44
670 0.44
671 0.43
672 0.47
673 0.45
674 0.41
675 0.34
676 0.31
677 0.27
678 0.26
679 0.23
680 0.16
681 0.18
682 0.17
683 0.15
684 0.12