Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5E6B1

Protein Details
Accession A5E6B1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
71-100DDNVGVQSKKRKKHKKRRRERERSAEDDALBasic
208-235AETRAQRQVERQKSKQKEKKFDMSKLTDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
79-93KKRKKHKKRRRERER
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028083  Spt6_acidic_N_dom  
IPR017072  TF_Spt6  
Gene Ontology GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG lel:LELG_05150  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14632  SPT6_acidic  
Amino Acid Sequences MAAEEPEINDRIDDHSGSGSEGEGVDLRNDSVTDSSEEDEDDEDEEAIQKVREGFIVDDDDDGDEEDEDDDDNVGVQSKKRKKHKKRRRERERSAEDDALDEDDLELLLENSGAKPIRLDGGNKFKRLKRRQAEDDVSEGDAIGGENSEAQSQSHFQRGLQNIFSEDEDSGDDLEGNDDLANNRRLPAGPGEEFDDFIELEDDSDDDAETRAQRQVERQKSKQKEKKFDMSKLTDVDRRSLQELFEVFGNGEEYAWALEAQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.16
3 0.16
4 0.17
5 0.16
6 0.12
7 0.1
8 0.1
9 0.09
10 0.09
11 0.09
12 0.09
13 0.1
14 0.1
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.1
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.14
25 0.13
26 0.13
27 0.12
28 0.11
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.09
34 0.09
35 0.08
36 0.09
37 0.09
38 0.09
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.13
43 0.16
44 0.15
45 0.14
46 0.14
47 0.13
48 0.12
49 0.11
50 0.09
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.07
62 0.08
63 0.1
64 0.2
65 0.27
66 0.36
67 0.47
68 0.58
69 0.68
70 0.78
71 0.87
72 0.89
73 0.93
74 0.96
75 0.97
76 0.97
77 0.96
78 0.95
79 0.92
80 0.87
81 0.82
82 0.72
83 0.61
84 0.5
85 0.4
86 0.3
87 0.21
88 0.15
89 0.08
90 0.06
91 0.05
92 0.04
93 0.04
94 0.03
95 0.03
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.05
100 0.06
101 0.05
102 0.06
103 0.06
104 0.08
105 0.09
106 0.11
107 0.15
108 0.26
109 0.3
110 0.33
111 0.37
112 0.38
113 0.48
114 0.54
115 0.59
116 0.56
117 0.61
118 0.64
119 0.69
120 0.7
121 0.61
122 0.56
123 0.46
124 0.38
125 0.29
126 0.22
127 0.13
128 0.09
129 0.07
130 0.04
131 0.03
132 0.02
133 0.03
134 0.03
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.05
139 0.08
140 0.09
141 0.13
142 0.13
143 0.14
144 0.21
145 0.25
146 0.27
147 0.26
148 0.25
149 0.22
150 0.23
151 0.22
152 0.16
153 0.12
154 0.1
155 0.09
156 0.09
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.06
167 0.1
168 0.13
169 0.12
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.16
174 0.2
175 0.21
176 0.2
177 0.21
178 0.24
179 0.23
180 0.23
181 0.21
182 0.18
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.05
193 0.05
194 0.06
195 0.07
196 0.08
197 0.1
198 0.13
199 0.15
200 0.16
201 0.25
202 0.35
203 0.44
204 0.53
205 0.6
206 0.67
207 0.76
208 0.86
209 0.86
210 0.86
211 0.86
212 0.85
213 0.87
214 0.86
215 0.83
216 0.81
217 0.78
218 0.73
219 0.66
220 0.63
221 0.56
222 0.49
223 0.46
224 0.41
225 0.38
226 0.36
227 0.33
228 0.28
229 0.29
230 0.29
231 0.25
232 0.22
233 0.19
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.11
238 0.1
239 0.09
240 0.08
241 0.08