FuNGI

A0A4Z1L306

Protein Details

Accession

A0A4Z1L306

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
133-155	TTGRARFKPKNIRRDQADRDRLE	Hydrophilic
417-440	ISPQQSKVRPSRKKDKIPVIQTEE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-24	ERGATSRGRPRGRGRGRGR
134-144	TGRARFKPKNI
174-185	RRSQRGRGHVGR
409-431	KKHPKREPISPQQSKVRPSRKKD

Subcellular Location(s)

nucl 15, mito 8, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPKAERGATSRGRPRGRGRGRGRGIAIEEIETPELRGVLDDSSQPSQSPAPNAPVAPMAPMTQSTATIIPKTEPSDDAFDPNTSPAITPAETPAGTPAPTTATTSARLPSRTESAIARGRGGASTRARGEATTGRARFKPKNIRRDQADRDRLEQEERDRIAANQAQAEKEARRSQRGRGHVGRGRGDAMGQNRGAGRGAPISSATGIFSVAPAAMDRKGGMDGFAIANTRVGGGGGAGGGFGGGGGGGRGGGGGGGYGGSGSGNGGGVNVLSAENMATFNPEYPDDDGQTRKVNIEMINLVDDDDEMVGSGRGGNAGFKSRSLAPIRIKREEHKERSNMMVSDPELAEIAKKQADEVEDNQSGEDVEMTMDGAITTDEPRAKGEPGLESPTMSKFPEFKAPSSPEDKKHPKREPISPQQSKVRPSRKKDKIPVIQTEEDKFEYERYLEDVDILAEELRLLRGTVDKTAKDKGKGKAGDVDGDVGMGGEQEEDEAQPEANHADGRIYLFQFPPVLPRLFNPQVENSDDVVVTQSSEQIDLTDDKEKGLKKESEEVIIKTEPNLAQENEALVSEQGYIGKLVVRKSGKVELDWGGTSMAVGRGVPAAFLSQIVLAEDPKGEAPEGVATGLGKVMGKFIVTPDWEKIF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.69
2	0.73
3	0.75
4	0.77
5	0.79
6	0.78
7	0.8
8	0.8
9	0.8
10	0.73
11	0.67
12	0.61
13	0.55
14	0.47
15	0.38
16	0.33
17	0.28
18	0.27
19	0.21
20	0.18
21	0.14
22	0.13
23	0.11
24	0.11
25	0.1
26	0.1
27	0.11
28	0.13
29	0.17
30	0.2
31	0.2
32	0.2
33	0.21
34	0.23
35	0.25
36	0.28
37	0.27
38	0.29
39	0.32
40	0.32
41	0.31
42	0.29
43	0.26
44	0.22
45	0.2
46	0.15
47	0.14
48	0.14
49	0.16
50	0.14
51	0.15
52	0.15
53	0.17
54	0.18
55	0.19
56	0.19
57	0.18
58	0.21
59	0.24
60	0.24
61	0.22
62	0.24
63	0.28
64	0.28
65	0.3
66	0.28
67	0.26
68	0.24
69	0.24
70	0.21
71	0.16
72	0.15
73	0.13
74	0.15
75	0.14
76	0.14
77	0.16
78	0.19
79	0.18
80	0.18
81	0.19
82	0.18
83	0.17
84	0.16
85	0.14
86	0.14
87	0.15
88	0.18
89	0.17
90	0.17
91	0.19
92	0.21
93	0.25
94	0.25
95	0.26
96	0.26
97	0.27
98	0.29
99	0.28
100	0.29
101	0.26
102	0.29
103	0.34
104	0.33
105	0.3
106	0.26
107	0.26
108	0.25
109	0.25
110	0.26
111	0.23
112	0.27
113	0.27
114	0.29
115	0.28
116	0.26
117	0.29
118	0.27
119	0.29
120	0.33
121	0.34
122	0.35
123	0.39
124	0.45
125	0.47
126	0.52
127	0.57
128	0.57
129	0.66
130	0.71
131	0.76
132	0.77
133	0.8
134	0.8
135	0.8
136	0.8
137	0.72
138	0.68
139	0.62
140	0.57
141	0.51
142	0.46
143	0.39
144	0.38
145	0.36
146	0.33
147	0.31
148	0.29
149	0.32
150	0.3
151	0.27
152	0.24
153	0.25
154	0.23
155	0.24
156	0.27
157	0.22
158	0.25
159	0.31
160	0.3
161	0.37
162	0.39
163	0.46
164	0.52
165	0.56
166	0.59
167	0.58
168	0.64
169	0.59
170	0.62
171	0.57
172	0.5
173	0.46
174	0.37
175	0.31
176	0.26
177	0.25
178	0.23
179	0.2
180	0.2
181	0.18
182	0.19
183	0.18
184	0.14
185	0.13
186	0.11
187	0.11
188	0.1
189	0.1
190	0.11
191	0.11
192	0.11
193	0.1
194	0.07
195	0.07
196	0.06
197	0.06
198	0.05
199	0.05
200	0.05
201	0.05
202	0.06
203	0.06
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.08
208	0.08
209	0.08
210	0.07
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.07
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.05
220	0.05
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.02
228	0.02
229	0.02
230	0.02
231	0.02
232	0.01
233	0.01
234	0.02
235	0.02
236	0.02
237	0.02
238	0.02
239	0.02
240	0.02
241	0.02
242	0.02
243	0.02
244	0.02
245	0.02
246	0.02
247	0.02
248	0.02
249	0.02
250	0.02
251	0.02
252	0.03
253	0.03
254	0.03
255	0.03
256	0.03
257	0.03
258	0.03
259	0.03
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.04
265	0.04
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.07
270	0.07
271	0.09
272	0.11
273	0.12
274	0.12
275	0.14
276	0.15
277	0.16
278	0.18
279	0.17
280	0.15
281	0.14
282	0.16
283	0.14
284	0.15
285	0.14
286	0.12
287	0.12
288	0.11
289	0.11
290	0.08
291	0.07
292	0.05
293	0.04
294	0.04
295	0.03
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.04
303	0.04
304	0.05
305	0.08
306	0.09
307	0.09
308	0.11
309	0.11
310	0.16
311	0.18
312	0.23
313	0.27
314	0.35
315	0.4
316	0.43
317	0.45
318	0.44
319	0.52
320	0.56
321	0.56
322	0.55
323	0.55
324	0.51
325	0.53
326	0.51
327	0.41
328	0.32
329	0.27
330	0.2
331	0.18
332	0.16
333	0.12
334	0.09
335	0.09
336	0.08
337	0.07
338	0.08
339	0.07
340	0.07
341	0.07
342	0.08
343	0.1
344	0.13
345	0.14
346	0.19
347	0.19
348	0.19
349	0.19
350	0.17
351	0.16
352	0.13
353	0.11
354	0.04
355	0.03
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.06
366	0.07
367	0.08
368	0.1
369	0.11
370	0.12
371	0.12
372	0.13
373	0.14
374	0.15
375	0.19
376	0.18
377	0.17
378	0.17
379	0.18
380	0.18
381	0.16
382	0.15
383	0.12
384	0.14
385	0.23
386	0.24
387	0.23
388	0.3
389	0.33
390	0.35
391	0.41
392	0.44
393	0.38
394	0.46
395	0.56
396	0.58
397	0.65
398	0.69
399	0.7
400	0.72
401	0.77
402	0.77
403	0.78
404	0.79
405	0.74
406	0.71
407	0.71
408	0.7
409	0.66
410	0.66
411	0.66
412	0.63
413	0.66
414	0.73
415	0.74
416	0.8
417	0.83
418	0.84
419	0.82
420	0.81
421	0.81
422	0.77
423	0.71
424	0.64
425	0.56
426	0.48
427	0.4
428	0.34
429	0.26
430	0.2
431	0.16
432	0.14
433	0.13
434	0.12
435	0.13
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.06
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.08
451	0.1
452	0.16
453	0.2
454	0.22
455	0.24
456	0.32
457	0.36
458	0.39
459	0.45
460	0.44
461	0.49
462	0.49
463	0.48
464	0.49
465	0.46
466	0.42
467	0.35
468	0.32
469	0.22
470	0.2
471	0.18
472	0.1
473	0.08
474	0.05
475	0.05
476	0.03
477	0.03
478	0.03
479	0.04
480	0.04
481	0.05
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.07
486	0.07
487	0.08
488	0.08
489	0.07
490	0.07
491	0.08
492	0.11
493	0.13
494	0.14
495	0.16
496	0.16
497	0.17
498	0.18
499	0.17
500	0.19
501	0.2
502	0.2
503	0.18
504	0.2
505	0.28
506	0.31
507	0.33
508	0.32
509	0.32
510	0.35
511	0.37
512	0.39
513	0.31
514	0.27
515	0.24
516	0.21
517	0.18
518	0.15
519	0.12
520	0.1
521	0.1
522	0.09
523	0.1
524	0.1
525	0.08
526	0.11
527	0.12
528	0.14
529	0.18
530	0.18
531	0.18
532	0.23
533	0.26
534	0.27
535	0.33
536	0.35
537	0.33
538	0.42
539	0.43
540	0.46
541	0.46
542	0.44
543	0.41
544	0.39
545	0.35
546	0.27
547	0.31
548	0.24
549	0.23
550	0.26
551	0.22
552	0.22
553	0.23
554	0.23
555	0.18
556	0.17
557	0.15
558	0.11
559	0.1
560	0.09
561	0.09
562	0.08
563	0.08
564	0.08
565	0.08
566	0.11
567	0.13
568	0.15
569	0.22
570	0.24
571	0.26
572	0.31
573	0.38
574	0.37
575	0.36
576	0.39
577	0.34
578	0.35
579	0.33
580	0.29
581	0.21
582	0.18
583	0.17
584	0.14
585	0.12
586	0.09
587	0.08
588	0.08
589	0.1
590	0.1
591	0.1
592	0.09
593	0.09
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.08
598	0.08
599	0.09
600	0.09
601	0.09
602	0.1
603	0.1
604	0.11
605	0.11
606	0.12
607	0.11
608	0.1
609	0.11
610	0.13
611	0.13
612	0.12
613	0.11
614	0.1
615	0.1
616	0.1
617	0.1
618	0.09
619	0.08
620	0.1
621	0.1
622	0.1
623	0.1
624	0.12
625	0.17
626	0.2
627	0.23

A0A4Z1L306

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer