Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1KE85

Protein Details
Accession A0A4Z1KE85    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
83-102GPDGKRKRPVAGPRPPQRLFBasic
104-123EAEAKKRHAKHLQGRPDTKTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-113GKRKRPVAGPRPPQRLFSEAEAKKRHAK
Subcellular Location(s) cyto 12, cyto_nucl 11.5, nucl 9, mito 3, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005824  KOW  
IPR041973  KOW_Spt5_1  
IPR041975  KOW_Spt5_2  
IPR041976  KOW_Spt5_3  
IPR041977  KOW_Spt5_4  
IPR041978  KOW_Spt5_5  
IPR014722  Rib_L2_dom2  
IPR039659  SPT5  
IPR024945  Spt5_C_dom  
IPR008991  Translation_prot_SH3-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0032784  P:regulation of DNA-templated transcription elongation  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF12815  CTD  
CDD cd06081  KOW_Spt5_1  
cd06082  KOW_Spt5_2  
cd06083  KOW_Spt5_3  
cd06084  KOW_Spt5_4  
cd06085  KOW_Spt5_5  
Amino Acid Sequences MDGLMNVYPRTKMMLVEIKEMPDLLRVTKSPTVEVGAYVRLRRPVKYAGDLAQVLEVTDTGLELRVRYVPRLDYGLHEDTSVGPDGKRKRPVAGPRPPQRLFSEAEAKKRHAKHLQGRPDTKTWNYFNEEYINGYCEKEVKIQALITKDVNPTLEEVTRFASGAEDGTENLDLNALAASLKASTANASYLPGDVIEVYEGEQKGVVGKAVSVTGDIVTMAVSEGALRGQTIEIPIKGIRKRFREGDHVKVIGGSRFRDEVGMVVKIIEDRVTLLSDQNNNEITVFSKDLREASDSGGSGALGKYELWDLVQLDPSTVACIIKVDRESLVVLDQNGSNRTVIPSQISNKLEKRRNAVATDRNGAEIKMEDTVKEFGGEARSGRILHIHRAYLFLKSSELSENAGIFVARTTSVQSVSAKGGRITENATSPDLSSMNPAMKLNPKNNGQMPPPKSIGRDKSIGQTVTIRKGPYKGLLGIVKDTTDTNARVELHTKSKVISVPKDCLGFKDKISGASVDPNGFRGGPGGGRGGGAPRGRGGFGGATPGPGWDSGAGGRTPMPGGLPERTPAWGRTPHGGAQGGRTPAWKSGPTDGGRTPGWSNDGSRTVYAANDGSRTAYGGGNRTPAWSSGAKTPAYSLSDNYGSKTPAYGGSGVAGDAWGSKTPAYQPNNTNDSWNSGQSNNNNWGTAYDAPTPGGPLSAPTPAAMNAPTPGGYSAPTPAAMNAPTPGAYSAPTPAPGYWGAPTPQAMDAPTPGPGYYAGAPTPGAYAADTPAGNWQDDGPRYVD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.32
3 0.37
4 0.39
5 0.36
6 0.35
7 0.35
8 0.27
9 0.23
10 0.22
11 0.18
12 0.21
13 0.2
14 0.26
15 0.3
16 0.31
17 0.28
18 0.29
19 0.3
20 0.26
21 0.27
22 0.23
23 0.25
24 0.27
25 0.28
26 0.29
27 0.34
28 0.36
29 0.36
30 0.39
31 0.41
32 0.44
33 0.47
34 0.49
35 0.44
36 0.48
37 0.46
38 0.42
39 0.35
40 0.29
41 0.22
42 0.18
43 0.13
44 0.08
45 0.07
46 0.06
47 0.05
48 0.08
49 0.08
50 0.08
51 0.1
52 0.16
53 0.18
54 0.2
55 0.24
56 0.24
57 0.26
58 0.29
59 0.28
60 0.27
61 0.32
62 0.33
63 0.3
64 0.27
65 0.25
66 0.23
67 0.24
68 0.23
69 0.17
70 0.13
71 0.2
72 0.28
73 0.36
74 0.44
75 0.43
76 0.46
77 0.55
78 0.65
79 0.69
80 0.71
81 0.74
82 0.75
83 0.83
84 0.79
85 0.74
86 0.67
87 0.6
88 0.53
89 0.48
90 0.49
91 0.43
92 0.51
93 0.51
94 0.51
95 0.56
96 0.57
97 0.6
98 0.58
99 0.64
100 0.65
101 0.71
102 0.78
103 0.79
104 0.8
105 0.77
106 0.74
107 0.69
108 0.64
109 0.61
110 0.54
111 0.5
112 0.51
113 0.46
114 0.43
115 0.41
116 0.37
117 0.33
118 0.3
119 0.26
120 0.2
121 0.2
122 0.18
123 0.16
124 0.17
125 0.19
126 0.2
127 0.2
128 0.21
129 0.22
130 0.25
131 0.26
132 0.27
133 0.23
134 0.25
135 0.24
136 0.24
137 0.23
138 0.2
139 0.19
140 0.19
141 0.2
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.15
148 0.13
149 0.1
150 0.1
151 0.1
152 0.08
153 0.08
154 0.09
155 0.1
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.06
160 0.06
161 0.06
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.06
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.06
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.03
208 0.03
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.04
215 0.04
216 0.05
217 0.08
218 0.1
219 0.1
220 0.12
221 0.14
222 0.2
223 0.23
224 0.3
225 0.35
226 0.38
227 0.43
228 0.47
229 0.49
230 0.54
231 0.57
232 0.58
233 0.57
234 0.52
235 0.47
236 0.42
237 0.39
238 0.31
239 0.28
240 0.2
241 0.16
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.14
246 0.13
247 0.13
248 0.13
249 0.11
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.1
254 0.08
255 0.05
256 0.06
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.13
262 0.16
263 0.17
264 0.19
265 0.19
266 0.18
267 0.17
268 0.16
269 0.14
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.14
277 0.15
278 0.13
279 0.14
280 0.15
281 0.14
282 0.14
283 0.13
284 0.12
285 0.1
286 0.09
287 0.07
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.05
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.05
306 0.06
307 0.06
308 0.09
309 0.09
310 0.1
311 0.09
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.11
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.09
320 0.1
321 0.1
322 0.11
323 0.1
324 0.09
325 0.11
326 0.1
327 0.1
328 0.11
329 0.13
330 0.15
331 0.22
332 0.23
333 0.26
334 0.31
335 0.39
336 0.44
337 0.44
338 0.47
339 0.46
340 0.48
341 0.47
342 0.48
343 0.46
344 0.43
345 0.43
346 0.38
347 0.33
348 0.3
349 0.26
350 0.2
351 0.14
352 0.11
353 0.1
354 0.09
355 0.08
356 0.09
357 0.11
358 0.1
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.08
365 0.09
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.14
370 0.13
371 0.17
372 0.19
373 0.19
374 0.18
375 0.21
376 0.22
377 0.19
378 0.18
379 0.13
380 0.12
381 0.11
382 0.12
383 0.1
384 0.1
385 0.1
386 0.1
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.07
391 0.06
392 0.05
393 0.04
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.06
398 0.07
399 0.09
400 0.09
401 0.1
402 0.12
403 0.14
404 0.13
405 0.13
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.15
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.12
418 0.1
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.11
423 0.11
424 0.11
425 0.18
426 0.23
427 0.24
428 0.29
429 0.31
430 0.35
431 0.38
432 0.4
433 0.38
434 0.42
435 0.42
436 0.4
437 0.4
438 0.37
439 0.36
440 0.4
441 0.4
442 0.35
443 0.34
444 0.31
445 0.33
446 0.36
447 0.33
448 0.27
449 0.28
450 0.27
451 0.29
452 0.31
453 0.26
454 0.23
455 0.25
456 0.26
457 0.23
458 0.23
459 0.19
460 0.2
461 0.22
462 0.22
463 0.22
464 0.2
465 0.17
466 0.15
467 0.14
468 0.11
469 0.12
470 0.12
471 0.11
472 0.13
473 0.14
474 0.14
475 0.17
476 0.18
477 0.21
478 0.22
479 0.22
480 0.2
481 0.22
482 0.25
483 0.27
484 0.31
485 0.3
486 0.31
487 0.33
488 0.35
489 0.33
490 0.32
491 0.32
492 0.27
493 0.23
494 0.27
495 0.25
496 0.24
497 0.25
498 0.23
499 0.19
500 0.23
501 0.24
502 0.18
503 0.18
504 0.17
505 0.16
506 0.15
507 0.14
508 0.1
509 0.09
510 0.08
511 0.09
512 0.09
513 0.08
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.13
518 0.13
519 0.13
520 0.13
521 0.14
522 0.14
523 0.14
524 0.14
525 0.1
526 0.09
527 0.13
528 0.12
529 0.12
530 0.11
531 0.12
532 0.11
533 0.1
534 0.1
535 0.06
536 0.07
537 0.07
538 0.09
539 0.08
540 0.08
541 0.09
542 0.09
543 0.09
544 0.09
545 0.08
546 0.09
547 0.12
548 0.13
549 0.14
550 0.14
551 0.15
552 0.17
553 0.19
554 0.18
555 0.21
556 0.24
557 0.25
558 0.29
559 0.31
560 0.31
561 0.33
562 0.35
563 0.3
564 0.29
565 0.31
566 0.29
567 0.26
568 0.25
569 0.23
570 0.22
571 0.25
572 0.24
573 0.22
574 0.25
575 0.32
576 0.32
577 0.35
578 0.33
579 0.33
580 0.31
581 0.31
582 0.26
583 0.21
584 0.22
585 0.19
586 0.2
587 0.21
588 0.25
589 0.24
590 0.23
591 0.22
592 0.2
593 0.18
594 0.18
595 0.16
596 0.13
597 0.12
598 0.12
599 0.12
600 0.12
601 0.12
602 0.12
603 0.12
604 0.13
605 0.16
606 0.17
607 0.19
608 0.19
609 0.2
610 0.2
611 0.19
612 0.21
613 0.19
614 0.2
615 0.23
616 0.28
617 0.27
618 0.26
619 0.26
620 0.26
621 0.28
622 0.27
623 0.22
624 0.22
625 0.27
626 0.27
627 0.28
628 0.26
629 0.23
630 0.23
631 0.22
632 0.19
633 0.16
634 0.18
635 0.16
636 0.14
637 0.14
638 0.14
639 0.13
640 0.11
641 0.09
642 0.06
643 0.06
644 0.08
645 0.07
646 0.08
647 0.08
648 0.1
649 0.16
650 0.25
651 0.28
652 0.34
653 0.39
654 0.47
655 0.51
656 0.5
657 0.48
658 0.4
659 0.42
660 0.38
661 0.36
662 0.3
663 0.28
664 0.33
665 0.34
666 0.4
667 0.4
668 0.39
669 0.36
670 0.34
671 0.32
672 0.3
673 0.28
674 0.26
675 0.22
676 0.21
677 0.22
678 0.22
679 0.23
680 0.18
681 0.16
682 0.11
683 0.1
684 0.12
685 0.13
686 0.13
687 0.12
688 0.13
689 0.14
690 0.15
691 0.14
692 0.13
693 0.12
694 0.12
695 0.12
696 0.12
697 0.12
698 0.11
699 0.11
700 0.12
701 0.13
702 0.13
703 0.14
704 0.13
705 0.13
706 0.16
707 0.16
708 0.16
709 0.14
710 0.14
711 0.13
712 0.14
713 0.14
714 0.12
715 0.12
716 0.12
717 0.14
718 0.15
719 0.17
720 0.17
721 0.16
722 0.19
723 0.19
724 0.2
725 0.19
726 0.21
727 0.2
728 0.21
729 0.22
730 0.22
731 0.22
732 0.21
733 0.21
734 0.18
735 0.2
736 0.18
737 0.19
738 0.18
739 0.16
740 0.16
741 0.15
742 0.17
743 0.16
744 0.18
745 0.16
746 0.16
747 0.16
748 0.16
749 0.16
750 0.13
751 0.12
752 0.1
753 0.1
754 0.11
755 0.14
756 0.14
757 0.13
758 0.2
759 0.21
760 0.21
761 0.2
762 0.21
763 0.25
764 0.27