Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1IX29

Protein Details
Accession A0A4Z1IX29    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
32-79INDRGDRRDERNRNHDRSRRDRSRSPRDSRDHRRSSYRDRERERDRGGBasic
206-227VDGGNKKASRHKKKIEEEEEEEAcidic
262-285NNVSAVRKEKKTQYRQYMNRVGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
38-99RRDERNRNHDRSRRDRSRSPRDSRDHRRSSYRDRERERDRGGRRDEYRDGRGSDRNRDYRER
106-107KR
212-218KASRHKK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSDLPRRRQRPDSTKMWEESESRGSARDRDEINDRGDRRDERNRNHDRSRRDRSRSPRDSRDHRRSSYRDRERERDRGGRRDEYRDGRGSDRNRDYRERNEERSDKRDGHRRDVPDRTRDDTRQSRGIDEDRNGRKDNARSGEKSNERTRSRSPRRDDERDYKEDRGSEKTRDSEYIDDAPQPVSFSIGASHTNTATAQDHDRMDVDGGNKKASRHKKKIEEEEEEEEDDDIVVEDDGMAAMQAMMGFGGFATTQNKQVAGNNVSAVRKEKKTQYRQYMNRVGGFNRPLSPSRD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.73
3 0.67
4 0.6
5 0.52
6 0.49
7 0.45
8 0.38
9 0.31
10 0.33
11 0.31
12 0.32
13 0.33
14 0.34
15 0.3
16 0.32
17 0.38
18 0.38
19 0.41
20 0.45
21 0.43
22 0.41
23 0.45
24 0.45
25 0.46
26 0.53
27 0.57
28 0.58
29 0.68
30 0.74
31 0.76
32 0.82
33 0.82
34 0.81
35 0.82
36 0.84
37 0.83
38 0.81
39 0.82
40 0.82
41 0.86
42 0.87
43 0.85
44 0.84
45 0.83
46 0.86
47 0.88
48 0.88
49 0.85
50 0.8
51 0.8
52 0.78
53 0.79
54 0.79
55 0.79
56 0.78
57 0.77
58 0.81
59 0.79
60 0.81
61 0.78
62 0.76
63 0.73
64 0.72
65 0.71
66 0.7
67 0.67
68 0.65
69 0.65
70 0.61
71 0.6
72 0.55
73 0.51
74 0.46
75 0.49
76 0.47
77 0.49
78 0.51
79 0.52
80 0.52
81 0.57
82 0.58
83 0.59
84 0.65
85 0.63
86 0.6
87 0.62
88 0.65
89 0.64
90 0.63
91 0.59
92 0.54
93 0.53
94 0.57
95 0.53
96 0.52
97 0.53
98 0.55
99 0.56
100 0.61
101 0.61
102 0.59
103 0.58
104 0.55
105 0.54
106 0.5
107 0.51
108 0.49
109 0.48
110 0.47
111 0.44
112 0.4
113 0.38
114 0.39
115 0.34
116 0.3
117 0.34
118 0.33
119 0.35
120 0.36
121 0.34
122 0.35
123 0.34
124 0.39
125 0.36
126 0.35
127 0.35
128 0.37
129 0.44
130 0.43
131 0.47
132 0.46
133 0.48
134 0.46
135 0.47
136 0.51
137 0.54
138 0.6
139 0.63
140 0.63
141 0.65
142 0.71
143 0.75
144 0.74
145 0.73
146 0.7
147 0.67
148 0.65
149 0.57
150 0.51
151 0.46
152 0.41
153 0.38
154 0.34
155 0.31
156 0.31
157 0.31
158 0.31
159 0.3
160 0.3
161 0.25
162 0.25
163 0.24
164 0.21
165 0.19
166 0.18
167 0.17
168 0.14
169 0.13
170 0.1
171 0.08
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.11
179 0.1
180 0.11
181 0.11
182 0.12
183 0.12
184 0.12
185 0.13
186 0.16
187 0.16
188 0.16
189 0.16
190 0.15
191 0.14
192 0.14
193 0.15
194 0.17
195 0.17
196 0.2
197 0.21
198 0.23
199 0.31
200 0.4
201 0.49
202 0.53
203 0.62
204 0.69
205 0.77
206 0.86
207 0.85
208 0.82
209 0.77
210 0.73
211 0.66
212 0.56
213 0.47
214 0.36
215 0.28
216 0.2
217 0.14
218 0.08
219 0.06
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.02
228 0.02
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.02
236 0.03
237 0.03
238 0.05
239 0.08
240 0.1
241 0.15
242 0.16
243 0.17
244 0.18
245 0.22
246 0.29
247 0.28
248 0.29
249 0.27
250 0.3
251 0.31
252 0.32
253 0.33
254 0.32
255 0.35
256 0.39
257 0.47
258 0.54
259 0.63
260 0.72
261 0.77
262 0.81
263 0.85
264 0.88
265 0.88
266 0.82
267 0.77
268 0.7
269 0.61
270 0.58
271 0.54
272 0.47
273 0.41
274 0.4