Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DXW9

Protein Details
Accession A5DXW9    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
154-173AIVNKRNKGRDKRKAVPLEDHydrophilic
229-253LDALSKKTRGKKKKTSKIVKKGGVPBasic
272-298QQKVKDQKVGKNKNRKKSKTTAKDGVEHydrophilic
314-344ESDSLAKQLKNKRRKKKKETQAKSENNETKEHydrophilic
352-384SSGTLEPNRLRRRRSRKDRVETKQQQQQQQQSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
159-167RNKGRDKRK
200-206AGKKRNK
234-251KKTRGKKKKTSKIVKKGG
278-294QKVGKNKNRKKSKTTAK
321-333QLKNKRRKKKKET
360-368RLRRRRSRK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG lel:LELG_02206  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MASIAPSRNVGPKPMHRGPSSKKTQLINAKKSGPKVDNPELGIISGNFKLVVRLLPPALSESDFLTQLEGLYPQKENKIVRHYYVKGSYPQKPFELPVYSRAYVSFKNVADMNEFTGLVRDKSFHDEKDSTIPIIEKSLFQKMIDGRQINTSGAIVNKRNKGRDKRKAVPLEDDDIYQRFLQFLNHEIPEFDLIKVKEPAGKKRNKLKATTKVAATATDSPSSSSSSSLDALSKKTRGKKKKTSKIVKKGGVPDSGQSKGNKNVNTKDNVEQQKVKDQKVGKNKNRKKSKTTAKDGVENKKPALLQTAGEKQTESDSLAKQLKNKRRKKKKETQAKSENNETKEKEQKSTESSGTLEPNRLRRRRSRKDRVETKQQQQQQQQSNSHSDDPRPLRRAENAPKKPIKILSSKAEKQSEDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.58
4 0.66
5 0.69
6 0.72
7 0.72
8 0.7
9 0.68
10 0.65
11 0.7
12 0.72
13 0.74
14 0.71
15 0.69
16 0.71
17 0.69
18 0.7
19 0.7
20 0.64
21 0.61
22 0.61
23 0.62
24 0.59
25 0.56
26 0.54
27 0.46
28 0.41
29 0.35
30 0.26
31 0.21
32 0.16
33 0.14
34 0.12
35 0.11
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.12
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.16
44 0.17
45 0.18
46 0.17
47 0.17
48 0.15
49 0.16
50 0.16
51 0.16
52 0.14
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.15
60 0.16
61 0.2
62 0.25
63 0.28
64 0.32
65 0.4
66 0.41
67 0.44
68 0.5
69 0.5
70 0.51
71 0.53
72 0.5
73 0.49
74 0.52
75 0.55
76 0.53
77 0.53
78 0.49
79 0.46
80 0.44
81 0.42
82 0.42
83 0.35
84 0.35
85 0.39
86 0.37
87 0.35
88 0.35
89 0.33
90 0.27
91 0.3
92 0.29
93 0.22
94 0.24
95 0.26
96 0.25
97 0.25
98 0.24
99 0.21
100 0.17
101 0.17
102 0.14
103 0.16
104 0.16
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.13
109 0.2
110 0.23
111 0.21
112 0.27
113 0.27
114 0.29
115 0.34
116 0.33
117 0.27
118 0.25
119 0.24
120 0.18
121 0.19
122 0.18
123 0.14
124 0.15
125 0.2
126 0.2
127 0.19
128 0.23
129 0.22
130 0.28
131 0.32
132 0.3
133 0.26
134 0.29
135 0.3
136 0.26
137 0.24
138 0.18
139 0.13
140 0.14
141 0.17
142 0.18
143 0.23
144 0.3
145 0.34
146 0.4
147 0.47
148 0.56
149 0.63
150 0.69
151 0.72
152 0.74
153 0.8
154 0.81
155 0.75
156 0.71
157 0.63
158 0.57
159 0.48
160 0.4
161 0.32
162 0.25
163 0.24
164 0.16
165 0.13
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.09
170 0.11
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.13
175 0.13
176 0.15
177 0.15
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.18
185 0.2
186 0.29
187 0.34
188 0.41
189 0.45
190 0.54
191 0.63
192 0.63
193 0.68
194 0.67
195 0.68
196 0.7
197 0.66
198 0.57
199 0.51
200 0.47
201 0.4
202 0.33
203 0.26
204 0.2
205 0.18
206 0.17
207 0.14
208 0.15
209 0.16
210 0.14
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.12
217 0.12
218 0.14
219 0.16
220 0.2
221 0.23
222 0.31
223 0.4
224 0.48
225 0.57
226 0.65
227 0.74
228 0.8
229 0.86
230 0.89
231 0.91
232 0.91
233 0.91
234 0.85
235 0.8
236 0.77
237 0.7
238 0.62
239 0.52
240 0.44
241 0.38
242 0.35
243 0.32
244 0.27
245 0.26
246 0.29
247 0.34
248 0.36
249 0.37
250 0.42
251 0.44
252 0.47
253 0.47
254 0.44
255 0.48
256 0.49
257 0.48
258 0.46
259 0.42
260 0.47
261 0.49
262 0.46
263 0.43
264 0.43
265 0.46
266 0.53
267 0.63
268 0.62
269 0.69
270 0.76
271 0.8
272 0.85
273 0.84
274 0.81
275 0.81
276 0.83
277 0.82
278 0.83
279 0.81
280 0.74
281 0.76
282 0.75
283 0.73
284 0.7
285 0.62
286 0.53
287 0.47
288 0.44
289 0.36
290 0.34
291 0.26
292 0.19
293 0.23
294 0.31
295 0.29
296 0.29
297 0.28
298 0.24
299 0.25
300 0.24
301 0.2
302 0.16
303 0.15
304 0.22
305 0.28
306 0.29
307 0.34
308 0.43
309 0.51
310 0.57
311 0.67
312 0.71
313 0.77
314 0.87
315 0.91
316 0.92
317 0.93
318 0.94
319 0.93
320 0.93
321 0.93
322 0.91
323 0.86
324 0.86
325 0.82
326 0.74
327 0.71
328 0.64
329 0.61
330 0.6
331 0.57
332 0.52
333 0.5
334 0.5
335 0.49
336 0.51
337 0.45
338 0.38
339 0.37
340 0.35
341 0.37
342 0.34
343 0.35
344 0.34
345 0.42
346 0.5
347 0.54
348 0.58
349 0.63
350 0.72
351 0.77
352 0.84
353 0.85
354 0.86
355 0.91
356 0.95
357 0.93
358 0.93
359 0.92
360 0.89
361 0.87
362 0.84
363 0.82
364 0.8
365 0.8
366 0.79
367 0.77
368 0.75
369 0.71
370 0.7
371 0.65
372 0.63
373 0.57
374 0.5
375 0.52
376 0.54
377 0.58
378 0.56
379 0.54
380 0.52
381 0.56
382 0.63
383 0.64
384 0.67
385 0.67
386 0.73
387 0.78
388 0.76
389 0.75
390 0.71
391 0.67
392 0.64
393 0.63
394 0.62
395 0.65
396 0.69
397 0.71
398 0.7