Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DSM8

Protein Details
Accession A5DSM8    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-29VEDTSKQKLKRHKFSSEPASTSHydrophilic
98-119GPICDNCHKRGHKRANCKVVICHydrophilic
147-169HYVLECKSKTRKRQYCRTCDTFQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 3, mito 2, golg 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0043229  C:intracellular organelle  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG lel:LELG_00364  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSVDDLYVEDTSKQKLKRHKFSSEPASTSPVSSSKTTTLGSTSESTSVSAEAVTSKEEAYHPTTVSLKIEEVTDDPDELIDLRGEGRYFGVSDPKKEGPICDNCHKRGHKRANCKVVICHKCGKVGDHYETHCPTTLICLRCGEKGHYVLECKSKTRKRQYCRTCDTFQHGDENCPTIWRSYITNPQSRAMDEQGESSVLPVICCYNCGSKVHYGDECPEPRSSRVPNLGSAFSGNNLPKRLRPLYFLGLKRDSGYDEYDPLRSRHDYGTYDSYEAHKRPSRGFYSSNGGNLSRTSGMNLGGHSINQAPSHHSSGYYSNSNNNNRNFRPNGPSSVRRNPDSLPTRPRTSGGVENRNFGGNYARDYNSTDDRRSGSLFLNGSHSFKGTNLLPKGPTRSGTIKGKKDILLLLLLLLLGTISKPTRSGLIEGSKNKSKKNKVVFPRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.46
3 0.56
4 0.64
5 0.71
6 0.75
7 0.77
8 0.81
9 0.85
10 0.82
11 0.76
12 0.68
13 0.65
14 0.56
15 0.48
16 0.41
17 0.34
18 0.3
19 0.27
20 0.27
21 0.25
22 0.27
23 0.27
24 0.25
25 0.24
26 0.21
27 0.23
28 0.22
29 0.21
30 0.2
31 0.19
32 0.19
33 0.17
34 0.16
35 0.13
36 0.1
37 0.09
38 0.09
39 0.09
40 0.09
41 0.1
42 0.09
43 0.11
44 0.12
45 0.16
46 0.19
47 0.21
48 0.2
49 0.22
50 0.25
51 0.24
52 0.25
53 0.23
54 0.19
55 0.17
56 0.17
57 0.15
58 0.14
59 0.16
60 0.15
61 0.14
62 0.13
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.07
68 0.06
69 0.07
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.2
78 0.2
79 0.23
80 0.29
81 0.3
82 0.33
83 0.32
84 0.34
85 0.32
86 0.39
87 0.43
88 0.47
89 0.53
90 0.53
91 0.61
92 0.66
93 0.66
94 0.68
95 0.73
96 0.72
97 0.76
98 0.82
99 0.83
100 0.81
101 0.75
102 0.71
103 0.71
104 0.68
105 0.62
106 0.59
107 0.51
108 0.51
109 0.5
110 0.45
111 0.42
112 0.42
113 0.42
114 0.39
115 0.4
116 0.42
117 0.42
118 0.41
119 0.33
120 0.27
121 0.22
122 0.24
123 0.29
124 0.24
125 0.23
126 0.25
127 0.26
128 0.29
129 0.31
130 0.27
131 0.25
132 0.26
133 0.26
134 0.25
135 0.26
136 0.27
137 0.32
138 0.31
139 0.3
140 0.38
141 0.43
142 0.51
143 0.6
144 0.66
145 0.67
146 0.76
147 0.82
148 0.83
149 0.84
150 0.81
151 0.74
152 0.69
153 0.67
154 0.61
155 0.52
156 0.49
157 0.41
158 0.37
159 0.33
160 0.32
161 0.24
162 0.21
163 0.2
164 0.13
165 0.13
166 0.12
167 0.13
168 0.15
169 0.24
170 0.29
171 0.33
172 0.35
173 0.36
174 0.36
175 0.34
176 0.32
177 0.25
178 0.22
179 0.17
180 0.16
181 0.14
182 0.13
183 0.12
184 0.1
185 0.11
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.15
197 0.18
198 0.21
199 0.23
200 0.22
201 0.2
202 0.21
203 0.26
204 0.25
205 0.22
206 0.22
207 0.2
208 0.21
209 0.25
210 0.24
211 0.23
212 0.27
213 0.27
214 0.28
215 0.29
216 0.28
217 0.24
218 0.23
219 0.19
220 0.13
221 0.16
222 0.14
223 0.14
224 0.16
225 0.17
226 0.17
227 0.23
228 0.27
229 0.24
230 0.26
231 0.28
232 0.32
233 0.38
234 0.39
235 0.39
236 0.37
237 0.36
238 0.33
239 0.29
240 0.25
241 0.19
242 0.2
243 0.15
244 0.16
245 0.17
246 0.19
247 0.2
248 0.19
249 0.2
250 0.18
251 0.2
252 0.2
253 0.22
254 0.21
255 0.24
256 0.29
257 0.26
258 0.26
259 0.24
260 0.25
261 0.26
262 0.25
263 0.28
264 0.26
265 0.28
266 0.31
267 0.37
268 0.38
269 0.38
270 0.39
271 0.36
272 0.38
273 0.37
274 0.35
275 0.3
276 0.26
277 0.23
278 0.2
279 0.2
280 0.15
281 0.13
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.12
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.14
296 0.18
297 0.21
298 0.2
299 0.19
300 0.2
301 0.22
302 0.25
303 0.25
304 0.23
305 0.27
306 0.34
307 0.41
308 0.46
309 0.49
310 0.53
311 0.52
312 0.59
313 0.56
314 0.53
315 0.53
316 0.5
317 0.52
318 0.5
319 0.56
320 0.56
321 0.61
322 0.62
323 0.56
324 0.55
325 0.49
326 0.52
327 0.51
328 0.5
329 0.5
330 0.51
331 0.54
332 0.52
333 0.52
334 0.45
335 0.43
336 0.45
337 0.45
338 0.49
339 0.45
340 0.47
341 0.46
342 0.45
343 0.4
344 0.32
345 0.29
346 0.2
347 0.23
348 0.25
349 0.25
350 0.24
351 0.27
352 0.31
353 0.33
354 0.36
355 0.34
356 0.33
357 0.34
358 0.36
359 0.35
360 0.33
361 0.26
362 0.28
363 0.26
364 0.24
365 0.28
366 0.27
367 0.27
368 0.26
369 0.24
370 0.18
371 0.18
372 0.22
373 0.19
374 0.27
375 0.28
376 0.31
377 0.34
378 0.38
379 0.44
380 0.42
381 0.41
382 0.38
383 0.4
384 0.43
385 0.51
386 0.56
387 0.57
388 0.59
389 0.62
390 0.58
391 0.56
392 0.5
393 0.42
394 0.34
395 0.26
396 0.21
397 0.16
398 0.13
399 0.1
400 0.08
401 0.05
402 0.04
403 0.04
404 0.07
405 0.08
406 0.09
407 0.1
408 0.12
409 0.16
410 0.19
411 0.22
412 0.26
413 0.34
414 0.41
415 0.46
416 0.53
417 0.57
418 0.59
419 0.64
420 0.67
421 0.68
422 0.7
423 0.75
424 0.77