Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5DTB3

Protein Details
Accession A5DTB3    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-50MSEVKPVKLSKKEQKSKQFRKSKEEREAAKLEKQESKKRKLEQQEEKAEEHydrophilic
86-112SEGDEPVKKKRKTRRGKKGRGTIVNEDBasic
199-244GGNSETRKEKLKQKNEKAHELRQLRRAEEEKKKKEKSKVSEKDLGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-40KLSKKEQKSKQFRKSKEEREAAKLEKQESKKRK
92-105VKKKRKTRRGKKGR
205-238RKEKLKQKNEKAHELRQLRRAEEEKKKKEKSKVS
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG lel:LELG_00599  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSEVKPVKLSKKEQKSKQFRKSKEEREAAKLEKQESKKRKLEQQEEKAEEKATSGLNDTVNTKKEGKEEKEIRGNSSKDKLLDAVSEGDEPVKKKRKTRRGKKGRGTIVNEDGTVTKKAPRFILFVGNLPFDIQQAELIAHFSKCSPDRIRIRSDKGIAFLEFDSDTKDIQSKMELALKLHHTEIRQRRINVELTVGGGGNSETRKEKLKQKNEKAHELRQLRRAEEEKKKKEKSKVSEKDLGGIHPSRAQLMK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.89
3 0.91
4 0.92
5 0.92
6 0.88
7 0.88
8 0.89
9 0.88
10 0.87
11 0.85
12 0.8
13 0.77
14 0.77
15 0.71
16 0.66
17 0.6
18 0.54
19 0.54
20 0.56
21 0.59
22 0.61
23 0.66
24 0.68
25 0.71
26 0.75
27 0.77
28 0.8
29 0.81
30 0.82
31 0.82
32 0.79
33 0.75
34 0.67
35 0.58
36 0.47
37 0.37
38 0.29
39 0.19
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.15
44 0.16
45 0.18
46 0.2
47 0.21
48 0.24
49 0.23
50 0.23
51 0.29
52 0.37
53 0.39
54 0.45
55 0.49
56 0.52
57 0.59
58 0.58
59 0.56
60 0.55
61 0.52
62 0.46
63 0.45
64 0.41
65 0.33
66 0.33
67 0.29
68 0.22
69 0.21
70 0.18
71 0.15
72 0.13
73 0.12
74 0.11
75 0.11
76 0.12
77 0.13
78 0.2
79 0.28
80 0.31
81 0.39
82 0.49
83 0.59
84 0.68
85 0.78
86 0.81
87 0.83
88 0.9
89 0.92
90 0.91
91 0.9
92 0.86
93 0.81
94 0.74
95 0.68
96 0.58
97 0.48
98 0.38
99 0.3
100 0.24
101 0.19
102 0.15
103 0.14
104 0.15
105 0.17
106 0.19
107 0.2
108 0.21
109 0.21
110 0.27
111 0.23
112 0.23
113 0.23
114 0.21
115 0.19
116 0.17
117 0.15
118 0.09
119 0.08
120 0.06
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.04
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.06
130 0.09
131 0.1
132 0.17
133 0.18
134 0.26
135 0.34
136 0.38
137 0.46
138 0.49
139 0.53
140 0.53
141 0.54
142 0.46
143 0.41
144 0.39
145 0.31
146 0.27
147 0.21
148 0.17
149 0.13
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.11
154 0.1
155 0.12
156 0.1
157 0.1
158 0.12
159 0.1
160 0.12
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.2
165 0.22
166 0.23
167 0.23
168 0.23
169 0.2
170 0.28
171 0.37
172 0.42
173 0.46
174 0.45
175 0.47
176 0.48
177 0.51
178 0.42
179 0.35
180 0.26
181 0.21
182 0.2
183 0.18
184 0.13
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.1
190 0.12
191 0.14
192 0.21
193 0.26
194 0.36
195 0.44
196 0.55
197 0.64
198 0.72
199 0.81
200 0.82
201 0.88
202 0.84
203 0.82
204 0.81
205 0.78
206 0.73
207 0.7
208 0.68
209 0.59
210 0.59
211 0.57
212 0.57
213 0.6
214 0.65
215 0.68
216 0.73
217 0.81
218 0.82
219 0.86
220 0.87
221 0.86
222 0.87
223 0.86
224 0.85
225 0.84
226 0.76
227 0.72
228 0.64
229 0.55
230 0.5
231 0.42
232 0.35
233 0.3
234 0.3