Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5E3H5

Protein Details
Accession A5E3H5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
99-118GVAPRAKMNQQRARRFRSAQHydrophilic
1030-1049RASFLPPKPRSNNGRNGYRFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
396-405RKEEGRKRRK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 6, cyto 6, cyto_mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG lel:LELG_04162  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSRKYPKIISPVVEEDQNEIGGAKYEDPNPNGEIDNLYLDMNGIVHPCSHPEHKKAPETEDEMFLDIFTYTDRVLMMARPRKVLMIAVDGVAPRAKMNQQRARRFRSAQDAKIKDEAIAKEIADKEFRGELIDNAVKVKKLWDSNAITPGTPFMDRLAEALRYLVAYKLANDPGWANLQVIISDATVPGEGEHKLMSFIRSQRSDPQYDPNTKHCIYGLDADLIFLGLATHEPHFRVLREDVFANQEKRMTISDHVAMNKDQADLIEERDRKKPFLWLHVNVLREYLAVELHNPNMSFPFDLERAIDDWVFICFFAGNDFLPHLPSLDVRDNGIDTLVNCWKRCVPRLRDYVTSDGKLNLDSVEVLMADLAIKEDEIFRNRFRIEQRKEEGRKRRKLAEEQDKALKSVYLSQVSKGKEKAPMEANVNMPLMDTSGNVVDGFAPLSNKDIVHNRDAITLAGMANQDAAAALKKLIDSKKKSMIEQERSSGVAGALGASGDSPSESSEAVATPSAANTDLEDTINGKETKKRSYQQDESIEDEDRLRLHEPGYQKRYYEVKFHCTSDEEIEETRRNVVRSYIEGISWVALYYYQGCPSWTWFYPYHYAPFAADMTNLRDLFPEGVKFELGKPFRPYEQLMSVLPAASKHALPDAFHGLMTDPKSEVIDFYPEDFEIDMNGKKMSWQGIPLLPFIEEERLLKAVQAKYSELSEYELSRNVNKEAELFISNQNKNYALFKEEFYDKQNTEVSFEFARSGLSGVVIKFRGFQPNGYLRFPLDQGEMPDVDKREYLQAEYHFPAKRKGKSMLLNGFIAPTPALTVNDVNEILYKLNSQDLRGMGGNYRNDFKAVSDYVNRGPAGKEVYKSYGMRIGGYRSYLHAIKNGQPNIQENRPHAQGYSNQGYSNTGGYGNQRYSQQQQHQHNYSQPYGQNQRQGGYNNSNYNNNYNGGYNNHNNYSNHNHNNYNSGYNNSYNNGYNNSSNNNYNSGYNNNSNNNNYNSGYNNNHHNSYSNNNHSSRGGANSRASFLPPKPRSNNGRNGYRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.62
3 0.66
4 0.66
5 0.61
6 0.58
7 0.58
8 0.54
9 0.48
10 0.43
11 0.38
12 0.33
13 0.29
14 0.22
15 0.16
16 0.14
17 0.13
18 0.14
19 0.14
20 0.16
21 0.22
22 0.28
23 0.29
24 0.32
25 0.31
26 0.32
27 0.3
28 0.27
29 0.23
30 0.19
31 0.19
32 0.17
33 0.16
34 0.13
35 0.13
36 0.12
37 0.1
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.12
44 0.17
45 0.26
46 0.32
47 0.39
48 0.48
49 0.54
50 0.63
51 0.64
52 0.64
53 0.63
54 0.62
55 0.57
56 0.52
57 0.45
58 0.38
59 0.34
60 0.28
61 0.21
62 0.15
63 0.12
64 0.09
65 0.09
66 0.07
67 0.08
68 0.08
69 0.08
70 0.09
71 0.14
72 0.23
73 0.29
74 0.32
75 0.34
76 0.35
77 0.36
78 0.36
79 0.35
80 0.28
81 0.25
82 0.23
83 0.21
84 0.22
85 0.2
86 0.21
87 0.18
88 0.15
89 0.1
90 0.13
91 0.19
92 0.26
93 0.37
94 0.45
95 0.54
96 0.65
97 0.74
98 0.79
99 0.81
100 0.77
101 0.73
102 0.75
103 0.74
104 0.71
105 0.73
106 0.68
107 0.64
108 0.64
109 0.57
110 0.48
111 0.46
112 0.39
113 0.31
114 0.28
115 0.24
116 0.25
117 0.28
118 0.27
119 0.23
120 0.22
121 0.22
122 0.22
123 0.22
124 0.2
125 0.18
126 0.17
127 0.22
128 0.24
129 0.22
130 0.23
131 0.25
132 0.22
133 0.22
134 0.24
135 0.23
136 0.25
137 0.28
138 0.33
139 0.38
140 0.42
141 0.48
142 0.46
143 0.4
144 0.36
145 0.34
146 0.28
147 0.22
148 0.18
149 0.12
150 0.13
151 0.13
152 0.15
153 0.16
154 0.14
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.11
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.12
164 0.17
165 0.19
166 0.18
167 0.19
168 0.19
169 0.18
170 0.21
171 0.2
172 0.15
173 0.15
174 0.15
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.1
179 0.09
180 0.09
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.08
190 0.1
191 0.11
192 0.13
193 0.16
194 0.21
195 0.28
196 0.3
197 0.33
198 0.4
199 0.45
200 0.48
201 0.45
202 0.5
203 0.5
204 0.55
205 0.57
206 0.53
207 0.55
208 0.51
209 0.49
210 0.41
211 0.35
212 0.29
213 0.3
214 0.26
215 0.21
216 0.21
217 0.19
218 0.18
219 0.16
220 0.13
221 0.08
222 0.06
223 0.03
224 0.04
225 0.05
226 0.07
227 0.08
228 0.09
229 0.13
230 0.15
231 0.15
232 0.19
233 0.21
234 0.22
235 0.23
236 0.23
237 0.21
238 0.26
239 0.31
240 0.28
241 0.26
242 0.26
243 0.24
244 0.25
245 0.25
246 0.21
247 0.18
248 0.2
249 0.22
250 0.24
251 0.25
252 0.25
253 0.24
254 0.23
255 0.22
256 0.18
257 0.15
258 0.12
259 0.14
260 0.12
261 0.16
262 0.22
263 0.24
264 0.26
265 0.33
266 0.35
267 0.34
268 0.34
269 0.39
270 0.35
271 0.42
272 0.48
273 0.44
274 0.51
275 0.53
276 0.53
277 0.45
278 0.41
279 0.31
280 0.22
281 0.19
282 0.11
283 0.08
284 0.07
285 0.09
286 0.1
287 0.11
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.13
292 0.14
293 0.12
294 0.11
295 0.14
296 0.12
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.07
308 0.06
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.07
313 0.06
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.13
323 0.16
324 0.16
325 0.16
326 0.17
327 0.16
328 0.16
329 0.15
330 0.11
331 0.07
332 0.11
333 0.16
334 0.19
335 0.18
336 0.2
337 0.25
338 0.28
339 0.36
340 0.41
341 0.43
342 0.5
343 0.58
344 0.6
345 0.61
346 0.61
347 0.61
348 0.55
349 0.48
350 0.4
351 0.33
352 0.29
353 0.23
354 0.2
355 0.13
356 0.09
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.03
369 0.03
370 0.05
371 0.08
372 0.12
373 0.15
374 0.15
375 0.19
376 0.2
377 0.24
378 0.3
379 0.38
380 0.4
381 0.47
382 0.52
383 0.58
384 0.65
385 0.7
386 0.74
387 0.73
388 0.77
389 0.73
390 0.75
391 0.72
392 0.74
393 0.75
394 0.75
395 0.71
396 0.65
397 0.68
398 0.6
399 0.53
400 0.44
401 0.34
402 0.23
403 0.23
404 0.23
405 0.21
406 0.21
407 0.23
408 0.28
409 0.29
410 0.32
411 0.28
412 0.27
413 0.27
414 0.28
415 0.3
416 0.29
417 0.31
418 0.31
419 0.32
420 0.31
421 0.27
422 0.26
423 0.21
424 0.17
425 0.14
426 0.11
427 0.08
428 0.06
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.05
439 0.05
440 0.07
441 0.07
442 0.07
443 0.09
444 0.15
445 0.17
446 0.19
447 0.21
448 0.2
449 0.21
450 0.21
451 0.19
452 0.13
453 0.11
454 0.09
455 0.08
456 0.08
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.05
461 0.04
462 0.05
463 0.03
464 0.04
465 0.04
466 0.04
467 0.05
468 0.09
469 0.14
470 0.22
471 0.26
472 0.31
473 0.4
474 0.41
475 0.42
476 0.47
477 0.51
478 0.51
479 0.49
480 0.46
481 0.38
482 0.37
483 0.36
484 0.27
485 0.18
486 0.1
487 0.07
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.03
492 0.03
493 0.03
494 0.02
495 0.02
496 0.03
497 0.03
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.05
502 0.05
503 0.06
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.06
516 0.07
517 0.07
518 0.11
519 0.11
520 0.11
521 0.15
522 0.18
523 0.23
524 0.28
525 0.33
526 0.38
527 0.46
528 0.5
529 0.54
530 0.58
531 0.55
532 0.52
533 0.49
534 0.41
535 0.33
536 0.28
537 0.2
538 0.13
539 0.12
540 0.1
541 0.09
542 0.09
543 0.12
544 0.17
545 0.25
546 0.31
547 0.3
548 0.3
549 0.32
550 0.38
551 0.36
552 0.39
553 0.34
554 0.35
555 0.36
556 0.37
557 0.35
558 0.31
559 0.31
560 0.24
561 0.22
562 0.16
563 0.14
564 0.16
565 0.17
566 0.15
567 0.17
568 0.16
569 0.16
570 0.15
571 0.17
572 0.16
573 0.17
574 0.2
575 0.17
576 0.15
577 0.16
578 0.15
579 0.13
580 0.11
581 0.09
582 0.05
583 0.04
584 0.05
585 0.06
586 0.07
587 0.08
588 0.08
589 0.09
590 0.09
591 0.13
592 0.17
593 0.15
594 0.19
595 0.19
596 0.22
597 0.25
598 0.26
599 0.25
600 0.22
601 0.22
602 0.17
603 0.18
604 0.15
605 0.12
606 0.11
607 0.1
608 0.12
609 0.15
610 0.15
611 0.14
612 0.13
613 0.14
614 0.15
615 0.14
616 0.13
617 0.09
618 0.1
619 0.1
620 0.1
621 0.11
622 0.17
623 0.17
624 0.2
625 0.23
626 0.24
627 0.25
628 0.28
629 0.28
630 0.25
631 0.26
632 0.25
633 0.21
634 0.21
635 0.2
636 0.17
637 0.15
638 0.11
639 0.1
640 0.09
641 0.09
642 0.08
643 0.1
644 0.11
645 0.11
646 0.14
647 0.16
648 0.16
649 0.15
650 0.15
651 0.13
652 0.16
653 0.17
654 0.14
655 0.1
656 0.1
657 0.11
658 0.11
659 0.11
660 0.09
661 0.11
662 0.1
663 0.12
664 0.12
665 0.12
666 0.12
667 0.11
668 0.1
669 0.08
670 0.1
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.09
675 0.09
676 0.11
677 0.13
678 0.12
679 0.12
680 0.15
681 0.18
682 0.19
683 0.19
684 0.18
685 0.15
686 0.14
687 0.14
688 0.13
689 0.1
690 0.1
691 0.11
692 0.11
693 0.11
694 0.12
695 0.17
696 0.18
697 0.2
698 0.21
699 0.2
700 0.2
701 0.21
702 0.21
703 0.15
704 0.15
705 0.14
706 0.14
707 0.15
708 0.16
709 0.16
710 0.18
711 0.2
712 0.18
713 0.18
714 0.16
715 0.16
716 0.15
717 0.16
718 0.15
719 0.15
720 0.2
721 0.28
722 0.29
723 0.29
724 0.29
725 0.28
726 0.27
727 0.29
728 0.24
729 0.19
730 0.2
731 0.19
732 0.21
733 0.23
734 0.24
735 0.25
736 0.29
737 0.25
738 0.27
739 0.3
740 0.27
741 0.26
742 0.26
743 0.24
744 0.19
745 0.2
746 0.17
747 0.13
748 0.13
749 0.1
750 0.1
751 0.07
752 0.07
753 0.09
754 0.08
755 0.12
756 0.13
757 0.12
758 0.14
759 0.16
760 0.23
761 0.22
762 0.23
763 0.27
764 0.35
765 0.39
766 0.38
767 0.37
768 0.3
769 0.31
770 0.31
771 0.25
772 0.19
773 0.17
774 0.17
775 0.19
776 0.18
777 0.17
778 0.2
779 0.19
780 0.18
781 0.17
782 0.16
783 0.18
784 0.18
785 0.19
786 0.2
787 0.21
788 0.26
789 0.27
790 0.32
791 0.3
792 0.31
793 0.38
794 0.42
795 0.45
796 0.46
797 0.49
798 0.51
799 0.55
800 0.63
801 0.62
802 0.57
803 0.52
804 0.47
805 0.43
806 0.34
807 0.27
808 0.18
809 0.1
810 0.09
811 0.09
812 0.09
813 0.1
814 0.11
815 0.11
816 0.14
817 0.14
818 0.12
819 0.12
820 0.12
821 0.11
822 0.11
823 0.11
824 0.09
825 0.15
826 0.15
827 0.15
828 0.18
829 0.18
830 0.21
831 0.21
832 0.22
833 0.2
834 0.25
835 0.28
836 0.26
837 0.29
838 0.26
839 0.25
840 0.25
841 0.22
842 0.22
843 0.2
844 0.22
845 0.23
846 0.26
847 0.28
848 0.32
849 0.3
850 0.26
851 0.25
852 0.24
853 0.27
854 0.26
855 0.26
856 0.25
857 0.29
858 0.34
859 0.33
860 0.32
861 0.31
862 0.29
863 0.29
864 0.27
865 0.27
866 0.24
867 0.26
868 0.24
869 0.21
870 0.25
871 0.25
872 0.24
873 0.25
874 0.26
875 0.31
876 0.4
877 0.4
878 0.38
879 0.39
880 0.44
881 0.46
882 0.49
883 0.47
884 0.42
885 0.45
886 0.45
887 0.43
888 0.37
889 0.34
890 0.33
891 0.36
892 0.4
893 0.35
894 0.33
895 0.33
896 0.34
897 0.31
898 0.27
899 0.2
900 0.13
901 0.13
902 0.17
903 0.22
904 0.23
905 0.24
906 0.26
907 0.29
908 0.35
909 0.43
910 0.48
911 0.51
912 0.59
913 0.66
914 0.69
915 0.69
916 0.69
917 0.66
918 0.6
919 0.56
920 0.49
921 0.48
922 0.51
923 0.52
924 0.53
925 0.49
926 0.48
927 0.46
928 0.47
929 0.45
930 0.45
931 0.47
932 0.47
933 0.48
934 0.52
935 0.5
936 0.5
937 0.46
938 0.39
939 0.33
940 0.27
941 0.27
942 0.25
943 0.3
944 0.33
945 0.35
946 0.37
947 0.41
948 0.4
949 0.44
950 0.5
951 0.52
952 0.54
953 0.53
954 0.54
955 0.51
956 0.56
957 0.52
958 0.48
959 0.41
960 0.37
961 0.36
962 0.35
963 0.36
964 0.33
965 0.33
966 0.3
967 0.31
968 0.31
969 0.3
970 0.31
971 0.32
972 0.35
973 0.36
974 0.38
975 0.37
976 0.37
977 0.35
978 0.34
979 0.34
980 0.33
981 0.35
982 0.37
983 0.41
984 0.43
985 0.47
986 0.5
987 0.52
988 0.51
989 0.49
990 0.45
991 0.41
992 0.38
993 0.39
994 0.4
995 0.38
996 0.44
997 0.44
998 0.45
999 0.43
1000 0.41
1001 0.4
1002 0.42
1003 0.48
1004 0.48
1005 0.51
1006 0.49
1007 0.51
1008 0.5
1009 0.49
1010 0.43
1011 0.41
1012 0.36
1013 0.35
1014 0.4
1015 0.39
1016 0.42
1017 0.39
1018 0.4
1019 0.38
1020 0.4
1021 0.45
1022 0.46
1023 0.53
1024 0.56
1025 0.65
1026 0.71
1027 0.74
1028 0.79
1029 0.76