Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1JDL6

Protein Details
Accession A0A4Z1JDL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
278-316SGIVKPKPTPRVPKPPKEPKAPKEPKAPKEPKPAKEPKABasic
356-376ATPSSGKKRGRPAKEQTSDTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-370EKPTPSGRGRGRPAKPDSEKKIKVPSGRGRGRPSSGIVKPKPTPRVPKPPKEPKAPKEPKAPKEPKPAKEPKAAKTPKSPKAKAVVEKKTPGKRGRPAKAPAAEVDVAEKPAATPSSGKKRGRPAKE
382-408ASKKRKASDDAGTPSSAGRGRPKKVKA
Subcellular Location(s) mito 15, nucl 7.5, cyto_nucl 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
Amino Acid Sequences MLRSISNSLNPLFGSPRKSTVEDRFEGEKDQEFTMSSPNDITLAEFNQTLARYPALLNKYAKDTKEGVTPLQELDRFRYVEAPAKFKDGSNTFSIEDITKLVDWKLRHGAYRPGFLKKVAKNTDEIVEAATKDAFDYYKTNPTDIGVVINKLKDPLMGIGPATASLILSVRYPDHVTFFSDECFKWLVNDGEHKPTPKYNVAEFEKIHAAAKSLATRLRVNPLQIEKVAFVIIKETEPVLVPREKPTPSGRGRGRPAKPDSEKKIKVPSGRGRGRPSSGIVKPKPTPRVPKPPKEPKAPKEPKAPKEPKPAKEPKAAKTPKSPKAKAVVEKKTPGKRGRPAKAPAAEVDVAEKPAATPSSGKKRGRPAKEQTSDTPASATPASKKRKASDDAGTPSSAGRGRPKKVKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.35
4 0.38
5 0.42
6 0.47
7 0.51
8 0.55
9 0.51
10 0.53
11 0.52
12 0.48
13 0.47
14 0.43
15 0.38
16 0.32
17 0.31
18 0.27
19 0.23
20 0.22
21 0.26
22 0.24
23 0.2
24 0.18
25 0.17
26 0.17
27 0.16
28 0.17
29 0.13
30 0.13
31 0.14
32 0.13
33 0.13
34 0.16
35 0.16
36 0.16
37 0.15
38 0.14
39 0.13
40 0.14
41 0.21
42 0.22
43 0.28
44 0.29
45 0.29
46 0.37
47 0.41
48 0.41
49 0.38
50 0.38
51 0.34
52 0.39
53 0.38
54 0.32
55 0.31
56 0.31
57 0.28
58 0.29
59 0.3
60 0.24
61 0.27
62 0.3
63 0.27
64 0.26
65 0.29
66 0.26
67 0.31
68 0.33
69 0.33
70 0.3
71 0.33
72 0.34
73 0.31
74 0.36
75 0.31
76 0.32
77 0.29
78 0.3
79 0.26
80 0.26
81 0.26
82 0.19
83 0.17
84 0.14
85 0.12
86 0.1
87 0.11
88 0.11
89 0.15
90 0.14
91 0.19
92 0.26
93 0.26
94 0.28
95 0.31
96 0.39
97 0.38
98 0.46
99 0.45
100 0.42
101 0.41
102 0.42
103 0.48
104 0.43
105 0.49
106 0.46
107 0.45
108 0.41
109 0.42
110 0.41
111 0.34
112 0.29
113 0.21
114 0.16
115 0.15
116 0.13
117 0.11
118 0.09
119 0.07
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.1
124 0.13
125 0.21
126 0.21
127 0.22
128 0.21
129 0.22
130 0.21
131 0.19
132 0.19
133 0.12
134 0.14
135 0.15
136 0.15
137 0.14
138 0.13
139 0.13
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.05
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.04
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.09
160 0.09
161 0.11
162 0.11
163 0.13
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.15
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.12
172 0.11
173 0.13
174 0.14
175 0.13
176 0.19
177 0.2
178 0.24
179 0.26
180 0.26
181 0.25
182 0.25
183 0.28
184 0.27
185 0.27
186 0.23
187 0.3
188 0.32
189 0.34
190 0.33
191 0.31
192 0.27
193 0.25
194 0.24
195 0.16
196 0.13
197 0.11
198 0.12
199 0.11
200 0.11
201 0.13
202 0.15
203 0.16
204 0.17
205 0.22
206 0.22
207 0.21
208 0.24
209 0.25
210 0.24
211 0.23
212 0.23
213 0.17
214 0.16
215 0.16
216 0.11
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.1
227 0.12
228 0.13
229 0.17
230 0.21
231 0.21
232 0.25
233 0.28
234 0.33
235 0.34
236 0.42
237 0.44
238 0.47
239 0.54
240 0.6
241 0.6
242 0.6
243 0.61
244 0.61
245 0.64
246 0.65
247 0.66
248 0.67
249 0.66
250 0.61
251 0.65
252 0.6
253 0.58
254 0.59
255 0.6
256 0.6
257 0.64
258 0.66
259 0.63
260 0.63
261 0.61
262 0.53
263 0.48
264 0.46
265 0.43
266 0.47
267 0.43
268 0.45
269 0.47
270 0.52
271 0.57
272 0.56
273 0.61
274 0.6
275 0.69
276 0.72
277 0.77
278 0.81
279 0.84
280 0.84
281 0.86
282 0.87
283 0.82
284 0.84
285 0.83
286 0.79
287 0.79
288 0.81
289 0.78
290 0.79
291 0.8
292 0.77
293 0.79
294 0.82
295 0.77
296 0.78
297 0.8
298 0.75
299 0.77
300 0.75
301 0.7
302 0.72
303 0.72
304 0.66
305 0.68
306 0.71
307 0.7
308 0.74
309 0.7
310 0.65
311 0.68
312 0.71
313 0.69
314 0.7
315 0.7
316 0.67
317 0.72
318 0.75
319 0.74
320 0.75
321 0.74
322 0.73
323 0.73
324 0.76
325 0.77
326 0.77
327 0.75
328 0.75
329 0.72
330 0.65
331 0.58
332 0.53
333 0.45
334 0.36
335 0.34
336 0.26
337 0.22
338 0.19
339 0.17
340 0.11
341 0.14
342 0.15
343 0.12
344 0.15
345 0.23
346 0.35
347 0.44
348 0.48
349 0.51
350 0.62
351 0.71
352 0.75
353 0.76
354 0.75
355 0.77
356 0.81
357 0.8
358 0.74
359 0.72
360 0.66
361 0.56
362 0.48
363 0.37
364 0.32
365 0.28
366 0.27
367 0.26
368 0.34
369 0.42
370 0.46
371 0.53
372 0.56
373 0.63
374 0.66
375 0.64
376 0.64
377 0.65
378 0.65
379 0.62
380 0.56
381 0.47
382 0.41
383 0.39
384 0.33
385 0.27
386 0.31
387 0.37
388 0.45