Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1JBU4

Protein Details
Accession A0A4Z1JBU4    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
101-126AVETAPEKKERKKRQHDPNAPKRPLTBasic
253-276SPTPAPKTPKAKGRKSKGKTDVAEHydrophilic
286-313IVPPQKEASPARKRKRSGKKADEPVVATHydrophilic
320-341PATVETPKSAPKSRKKKAKTDAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
107-120EKKERKKRQHDPNA
257-271APKTPKAKGRKSKGK
292-305EASPARKRKRSGKK
327-338KSAPKSRKKKAK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11.5, cyto 11.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MPRPKKTEEKPKEVPAGDGATLQIDVASFVRTRDTFIGGLATLQEAISSVSSAYIKHTNAVLGEHGTGYTIDTALSKLGDNPLLETLGALQRAASPIIAKAVETAPEKKERKKRQHDPNAPKRPLTPFFLYMQTARPIIAKDLGDVPKGEVSSEGTKRWTDMAPKDKALWQDAYKDNLRLYNARMHAYRRGNLTAKEMGDDAAAAYADENNIGADASADAQLVGEATAGVTATVEEEEDAEGEPEAEAEVEKSPTPAPKTPKAKGRKSKGKTDVAEEIPAPSSASIVPPQKEASPARKRKRSGKKADEPVVATTEQEEAPATVETPKSAPKSRKKKAKTDA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.58
3 0.52
4 0.43
5 0.35
6 0.27
7 0.19
8 0.18
9 0.15
10 0.11
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.09
15 0.08
16 0.09
17 0.15
18 0.15
19 0.18
20 0.19
21 0.22
22 0.2
23 0.2
24 0.22
25 0.16
26 0.17
27 0.13
28 0.12
29 0.08
30 0.08
31 0.07
32 0.05
33 0.06
34 0.06
35 0.06
36 0.06
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.12
41 0.16
42 0.17
43 0.18
44 0.19
45 0.18
46 0.18
47 0.19
48 0.17
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.11
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.08
65 0.1
66 0.13
67 0.12
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.13
72 0.12
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.09
79 0.11
80 0.11
81 0.09
82 0.07
83 0.07
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.13
90 0.16
91 0.18
92 0.2
93 0.29
94 0.33
95 0.4
96 0.5
97 0.57
98 0.65
99 0.73
100 0.8
101 0.82
102 0.9
103 0.92
104 0.93
105 0.93
106 0.93
107 0.84
108 0.75
109 0.67
110 0.62
111 0.55
112 0.49
113 0.42
114 0.34
115 0.34
116 0.35
117 0.33
118 0.27
119 0.26
120 0.22
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.13
125 0.13
126 0.15
127 0.12
128 0.12
129 0.17
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.09
138 0.1
139 0.15
140 0.17
141 0.17
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.19
146 0.18
147 0.17
148 0.23
149 0.3
150 0.31
151 0.31
152 0.32
153 0.33
154 0.33
155 0.3
156 0.26
157 0.19
158 0.23
159 0.24
160 0.27
161 0.25
162 0.25
163 0.23
164 0.22
165 0.23
166 0.18
167 0.18
168 0.2
169 0.21
170 0.22
171 0.23
172 0.23
173 0.3
174 0.32
175 0.33
176 0.29
177 0.32
178 0.32
179 0.32
180 0.34
181 0.29
182 0.26
183 0.24
184 0.21
185 0.16
186 0.14
187 0.12
188 0.08
189 0.05
190 0.05
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.03
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.04
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.03
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.06
237 0.07
238 0.07
239 0.09
240 0.1
241 0.15
242 0.2
243 0.25
244 0.3
245 0.39
246 0.47
247 0.52
248 0.6
249 0.65
250 0.71
251 0.75
252 0.8
253 0.81
254 0.79
255 0.83
256 0.83
257 0.83
258 0.75
259 0.71
260 0.67
261 0.59
262 0.55
263 0.45
264 0.37
265 0.29
266 0.26
267 0.21
268 0.13
269 0.11
270 0.09
271 0.11
272 0.15
273 0.2
274 0.21
275 0.23
276 0.25
277 0.25
278 0.31
279 0.34
280 0.39
281 0.45
282 0.54
283 0.63
284 0.7
285 0.76
286 0.8
287 0.86
288 0.86
289 0.87
290 0.87
291 0.87
292 0.89
293 0.9
294 0.85
295 0.76
296 0.68
297 0.6
298 0.49
299 0.38
300 0.29
301 0.23
302 0.17
303 0.15
304 0.13
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.11
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.16
313 0.22
314 0.27
315 0.35
316 0.44
317 0.51
318 0.62
319 0.71
320 0.8
321 0.82