FuNGI

A0A4Z1K2B6

Protein Details

Accession

A0A4Z1K2B6

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-54	FTRKVKAADPLRPRKKPIRRPNPSSTPAG	Hydrophilic
509-528	TPSGRPKHTDPLKKSKNLKR	Basic
536-561	ESSGNESSRKKHKKKHVGSSQPTGTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-46	KVKAADPLRPRKKPIRRP
435-449	KKKLGKGVRKALTKR
483-551	KKKDEEAKAKLKAEAKPSGTSSKGNTTPSGRPKHTDPLKKSKNLKRAGSPNLSESSGNESSRKKHKKKH

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPSGMSNGRTPTPTPNSGGAPQFTRKVKAADPLRPRKKPIRRPNPSSTPAGANSNGLIPARPNGPTSLNNVSGPRAPGPRGPIPVNGNVAPRQTYGGWTHPPKGEVTDYPLFTTRRALRDGIRYHAMRFSGKKEVDPTDQNEFTRPISLHRRDPRQPPPGKAFKDEDVVMEDAVDSKERERQEILKAEKEAQKAADRAQIAPTGNNANAAAAKKAQAFRNEKTTQVHRLDKTAEQKKESDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYESALSEVNVMFFTEGSAFKMIPVEKWYKFTSKNKFNTLTIDEAEALLSKKTKESRWAMKTQERNEAQRATQENIRGMNKLYTVKTESASFKGSSRNETRDIDELDFDADDLFQDDDELATVEPDRDEDTKDAQERIKQDQRGANLFGEADEETVEKDFIKEEQELEAKKKLGKGVRKALTKREKNFIYDSDSSNPYASSDSEDDTSDEEKQKEIDKKKDEEAKAKLKAEAKPSGTSSKGNTTPSGRPKHTDPLKKSKNLKRAGSPNLSESSGNESSRKKHKKKHVGSSQPTGTSTPIPGQPQRKSSIVKMSVNPNELSRINSSTPNPQTATSDGEATGGEMSDGAGSKKKKITLRMGGSPTTSRPGSPIPGKSSGSRAGSPSQGAEATSPSGSGPITPKDIAGLPSTGVSISQILAYFRGRVGDGEGQTTKKEFMEMIKKYTKYGPDKLLRPKV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.41
3	0.43
4	0.42
5	0.42
6	0.43
7	0.46
8	0.48
9	0.42
10	0.39
11	0.4
12	0.43
13	0.43
14	0.43
15	0.41
16	0.42
17	0.42
18	0.46
19	0.5
20	0.52
21	0.6
22	0.66
23	0.74
24	0.75
25	0.8
26	0.81
27	0.84
28	0.85
29	0.86
30	0.86
31	0.86
32	0.89
33	0.92
34	0.91
35	0.85
36	0.8
37	0.72
38	0.66
39	0.58
40	0.54
41	0.44
42	0.35
43	0.31
44	0.26
45	0.24
46	0.19
47	0.17
48	0.13
49	0.16
50	0.17
51	0.18
52	0.18
53	0.19
54	0.24
55	0.25
56	0.3
57	0.33
58	0.34
59	0.34
60	0.34
61	0.34
62	0.33
63	0.33
64	0.32
65	0.3
66	0.29
67	0.3
68	0.36
69	0.4
70	0.42
71	0.41
72	0.43
73	0.43
74	0.46
75	0.46
76	0.42
77	0.4
78	0.37
79	0.37
80	0.32
81	0.28
82	0.26
83	0.22
84	0.24
85	0.24
86	0.27
87	0.33
88	0.35
89	0.4
90	0.4
91	0.41
92	0.38
93	0.38
94	0.36
95	0.29
96	0.33
97	0.33
98	0.31
99	0.32
100	0.36
101	0.33
102	0.3
103	0.36
104	0.34
105	0.32
106	0.35
107	0.35
108	0.36
109	0.44
110	0.47
111	0.44
112	0.46
113	0.43
114	0.41
115	0.42
116	0.39
117	0.35
118	0.35
119	0.34
120	0.36
121	0.36
122	0.38
123	0.39
124	0.42
125	0.43
126	0.45
127	0.44
128	0.43
129	0.45
130	0.43
131	0.4
132	0.37
133	0.32
134	0.31
135	0.27
136	0.26
137	0.33
138	0.38
139	0.45
140	0.51
141	0.59
142	0.62
143	0.71
144	0.74
145	0.74
146	0.75
147	0.72
148	0.73
149	0.74
150	0.7
151	0.67
152	0.61
153	0.53
154	0.51
155	0.45
156	0.36
157	0.3
158	0.27
159	0.21
160	0.17
161	0.14
162	0.11
163	0.11
164	0.11
165	0.08
166	0.08
167	0.14
168	0.15
169	0.17
170	0.19
171	0.22
172	0.28
173	0.36
174	0.4
175	0.4
176	0.41
177	0.45
178	0.47
179	0.45
180	0.39
181	0.34
182	0.34
183	0.3
184	0.31
185	0.29
186	0.26
187	0.25
188	0.25
189	0.26
190	0.22
191	0.21
192	0.21
193	0.19
194	0.18
195	0.18
196	0.15
197	0.12
198	0.14
199	0.14
200	0.13
201	0.11
202	0.13
203	0.16
204	0.2
205	0.23
206	0.3
207	0.35
208	0.36
209	0.45
210	0.45
211	0.44
212	0.45
213	0.46
214	0.46
215	0.47
216	0.51
217	0.43
218	0.45
219	0.45
220	0.45
221	0.5
222	0.5
223	0.47
224	0.43
225	0.43
226	0.45
227	0.49
228	0.45
229	0.41
230	0.35
231	0.33
232	0.33
233	0.33
234	0.29
235	0.24
236	0.24
237	0.19
238	0.17
239	0.15
240	0.13
241	0.12
242	0.13
243	0.16
244	0.19
245	0.19
246	0.18
247	0.19
248	0.19
249	0.18
250	0.18
251	0.14
252	0.11
253	0.11
254	0.12
255	0.11
256	0.12
257	0.12
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.08
262	0.07
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.06
267	0.06
268	0.06
269	0.07
270	0.08
271	0.08
272	0.08
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.15
277	0.19
278	0.19
279	0.23
280	0.25
281	0.27
282	0.34
283	0.41
284	0.47
285	0.51
286	0.56
287	0.59
288	0.6
289	0.56
290	0.54
291	0.48
292	0.4
293	0.31
294	0.27
295	0.2
296	0.17
297	0.16
298	0.12
299	0.09
300	0.07
301	0.08
302	0.07
303	0.1
304	0.14
305	0.16
306	0.23
307	0.29
308	0.38
309	0.43
310	0.49
311	0.52
312	0.55
313	0.61
314	0.57
315	0.59
316	0.52
317	0.49
318	0.47
319	0.44
320	0.37
321	0.35
322	0.34
323	0.27
324	0.27
325	0.25
326	0.23
327	0.25
328	0.25
329	0.2
330	0.19
331	0.17
332	0.17
333	0.18
334	0.17
335	0.15
336	0.17
337	0.18
338	0.18
339	0.19
340	0.19
341	0.18
342	0.2
343	0.18
344	0.17
345	0.22
346	0.22
347	0.25
348	0.27
349	0.28
350	0.3
351	0.31
352	0.31
353	0.29
354	0.3
355	0.25
356	0.21
357	0.17
358	0.14
359	0.12
360	0.1
361	0.07
362	0.04
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.03
370	0.04
371	0.04
372	0.03
373	0.03
374	0.04
375	0.04
376	0.04
377	0.05
378	0.07
379	0.07
380	0.08
381	0.1
382	0.12
383	0.16
384	0.17
385	0.19
386	0.19
387	0.21
388	0.23
389	0.3
390	0.34
391	0.32
392	0.35
393	0.36
394	0.38
395	0.37
396	0.36
397	0.28
398	0.22
399	0.21
400	0.16
401	0.14
402	0.11
403	0.08
404	0.06
405	0.06
406	0.06
407	0.06
408	0.06
409	0.05
410	0.05
411	0.05
412	0.06
413	0.08
414	0.09
415	0.09
416	0.12
417	0.16
418	0.17
419	0.19
420	0.22
421	0.21
422	0.22
423	0.24
424	0.26
425	0.29
426	0.35
427	0.4
428	0.47
429	0.53
430	0.59
431	0.59
432	0.65
433	0.69
434	0.69
435	0.65
436	0.64
437	0.59
438	0.55
439	0.55
440	0.47
441	0.44
442	0.38
443	0.37
444	0.33
445	0.32
446	0.29
447	0.26
448	0.24
449	0.17
450	0.16
451	0.13
452	0.12
453	0.12
454	0.12
455	0.13
456	0.14
457	0.13
458	0.14
459	0.15
460	0.15
461	0.17
462	0.16
463	0.16
464	0.17
465	0.23
466	0.3
467	0.35
468	0.41
469	0.44
470	0.48
471	0.54
472	0.62
473	0.59
474	0.59
475	0.59
476	0.59
477	0.59
478	0.57
479	0.54
480	0.51
481	0.51
482	0.49
483	0.48
484	0.42
485	0.39
486	0.4
487	0.4
488	0.36
489	0.34
490	0.31
491	0.31
492	0.32
493	0.31
494	0.31
495	0.32
496	0.38
497	0.45
498	0.5
499	0.45
500	0.44
501	0.47
502	0.54
503	0.58
504	0.6
505	0.59
506	0.63
507	0.69
508	0.74
509	0.8
510	0.79
511	0.79
512	0.78
513	0.75
514	0.73
515	0.73
516	0.73
517	0.7
518	0.63
519	0.57
520	0.51
521	0.47
522	0.38
523	0.31
524	0.3
525	0.26
526	0.26
527	0.26
528	0.27
529	0.32
530	0.42
531	0.52
532	0.53
533	0.59
534	0.69
535	0.77
536	0.84
537	0.89
538	0.89
539	0.89
540	0.87
541	0.86
542	0.8
543	0.71
544	0.62
545	0.52
546	0.43
547	0.33
548	0.28
549	0.22
550	0.21
551	0.24
552	0.3
553	0.37
554	0.4
555	0.44
556	0.46
557	0.48
558	0.48
559	0.48
560	0.51
561	0.5
562	0.5
563	0.49
564	0.54
565	0.54
566	0.54
567	0.5
568	0.4
569	0.38
570	0.34
571	0.32
572	0.26
573	0.25
574	0.24
575	0.28
576	0.3
577	0.35
578	0.37
579	0.39
580	0.37
581	0.34
582	0.35
583	0.32
584	0.35
585	0.26
586	0.24
587	0.2
588	0.19
589	0.18
590	0.15
591	0.13
592	0.08
593	0.07
594	0.05
595	0.05
596	0.06
597	0.06
598	0.07
599	0.13
600	0.15
601	0.2
602	0.25
603	0.31
604	0.36
605	0.44
606	0.53
607	0.57
608	0.63
609	0.67
610	0.67
611	0.62
612	0.6
613	0.54
614	0.46
615	0.41
616	0.34
617	0.25
618	0.24
619	0.26
620	0.3
621	0.35
622	0.39
623	0.39
624	0.44
625	0.47
626	0.45
627	0.47
628	0.46
629	0.44
630	0.4
631	0.37
632	0.35
633	0.36
634	0.35
635	0.3
636	0.26
637	0.22
638	0.2
639	0.18
640	0.16
641	0.15
642	0.14
643	0.13
644	0.11
645	0.12
646	0.11
647	0.13
648	0.15
649	0.16
650	0.21
651	0.21
652	0.21
653	0.22
654	0.25
655	0.24
656	0.22
657	0.19
658	0.15
659	0.16
660	0.16
661	0.14
662	0.11
663	0.11
664	0.09
665	0.08
666	0.09
667	0.1
668	0.1
669	0.13
670	0.14
671	0.14
672	0.14
673	0.16
674	0.15
675	0.14
676	0.19
677	0.24
678	0.24
679	0.28
680	0.31
681	0.3
682	0.32
683	0.33
684	0.29
685	0.22
686	0.23
687	0.18
688	0.24
689	0.33
690	0.35
691	0.41
692	0.48
693	0.48
694	0.5
695	0.55
696	0.56
697	0.54
698	0.58
699	0.6
700	0.61
701	0.69

A0A4Z1K2B6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer