Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A4Z1JN88

Protein Details
Accession A0A4Z1JN88    Localization Confidence High Confidence Score 18.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-68NVATGSPTKSRKRAPPKKKAKSAMEPMTGGHydrophilic
137-162EDIKEEESKKKRSPRKKNVADVSKEVBasic
490-519KKAVIKKVAKKVEKGSKKRKRNFEDSGEEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
47-59KSRKRAPPKKKAK
145-154KKKRSPRKKN
481-510KKQPGFRAGKKAVIKKVAKKVEKGSKKRKR
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_mito 11.5, mito 7.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPTRAATKAAEAAAALNSAAATLSSPPTTPADGKQILENVATGSPTKSRKRAPPKKKAKSAMEPMTGGWDVLPHGMGQKGDLLEDDFGNTGAEVTPTTPKRAARARVTKNTGKTSIKDEDEEKPLDLGDSLIPNLLEDIKEEESKKKRSPRKKNVADVSKEVDGSPAKPVKAKNKNYGIVFGETPFPDHVSPTAQEAETVNSLLTALHGEVKPPDTVPAPSETVTGCGEVPDVLDATMRTLLSAATTAGNANKSMAGLKAEYGLRTSGKGAGSVSWEAVHASSREDVEGAIRSGGLAKVKAGYIKAILQVVFDKNTKLLETLLREVHTDDPVLFVGKVLETKEQKEAEIKSLRENMLSLDYVHSLDKPAAMRVLMDLPGIGVKTAACVALFCLGRPSFAVDTHVWRHCMWLGWVPEKASRDQTFSHCEVRIPDHLKYSLHQLFLRHGKTCGRCRAATTEGSVDWESTVCPIEHLVNRTGDKKQPGFRAGKKAVIKKVAKKVEKGSKKRKRNFEDSGEEAEVEEDKGEDDTDIEVEAESESRVSEQTD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.12
3 0.08
4 0.07
5 0.06
6 0.06
7 0.05
8 0.05
9 0.07
10 0.1
11 0.11
12 0.11
13 0.14
14 0.16
15 0.2
16 0.22
17 0.23
18 0.29
19 0.32
20 0.32
21 0.34
22 0.34
23 0.32
24 0.3
25 0.27
26 0.2
27 0.17
28 0.17
29 0.14
30 0.13
31 0.18
32 0.26
33 0.33
34 0.39
35 0.46
36 0.56
37 0.67
38 0.76
39 0.81
40 0.84
41 0.88
42 0.92
43 0.94
44 0.93
45 0.91
46 0.91
47 0.9
48 0.87
49 0.81
50 0.71
51 0.6
52 0.56
53 0.46
54 0.35
55 0.25
56 0.16
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.07
61 0.09
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.14
66 0.13
67 0.13
68 0.13
69 0.13
70 0.13
71 0.13
72 0.13
73 0.1
74 0.1
75 0.09
76 0.09
77 0.07
78 0.06
79 0.07
80 0.06
81 0.08
82 0.16
83 0.17
84 0.21
85 0.25
86 0.26
87 0.32
88 0.4
89 0.47
90 0.49
91 0.59
92 0.64
93 0.7
94 0.76
95 0.76
96 0.75
97 0.73
98 0.7
99 0.63
100 0.56
101 0.53
102 0.52
103 0.47
104 0.43
105 0.4
106 0.38
107 0.4
108 0.39
109 0.32
110 0.26
111 0.23
112 0.21
113 0.17
114 0.13
115 0.1
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.09
123 0.07
124 0.07
125 0.11
126 0.12
127 0.16
128 0.18
129 0.25
130 0.32
131 0.39
132 0.45
133 0.51
134 0.59
135 0.68
136 0.78
137 0.81
138 0.85
139 0.88
140 0.9
141 0.9
142 0.9
143 0.83
144 0.76
145 0.69
146 0.59
147 0.49
148 0.39
149 0.32
150 0.24
151 0.2
152 0.23
153 0.22
154 0.21
155 0.24
156 0.29
157 0.37
158 0.46
159 0.52
160 0.55
161 0.6
162 0.65
163 0.62
164 0.61
165 0.53
166 0.45
167 0.39
168 0.3
169 0.25
170 0.19
171 0.2
172 0.16
173 0.15
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.13
179 0.14
180 0.15
181 0.13
182 0.14
183 0.14
184 0.15
185 0.13
186 0.13
187 0.1
188 0.07
189 0.08
190 0.07
191 0.06
192 0.05
193 0.04
194 0.08
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.13
202 0.1
203 0.11
204 0.12
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.15
209 0.13
210 0.14
211 0.13
212 0.13
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.05
219 0.05
220 0.04
221 0.05
222 0.04
223 0.05
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.06
231 0.05
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.07
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.11
254 0.11
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.1
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.1
292 0.11
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.12
297 0.13
298 0.14
299 0.13
300 0.12
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.1
305 0.1
306 0.11
307 0.14
308 0.17
309 0.18
310 0.18
311 0.18
312 0.19
313 0.19
314 0.16
315 0.14
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.14
327 0.14
328 0.17
329 0.22
330 0.22
331 0.22
332 0.26
333 0.26
334 0.28
335 0.32
336 0.31
337 0.3
338 0.34
339 0.34
340 0.29
341 0.28
342 0.22
343 0.19
344 0.19
345 0.15
346 0.11
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.09
352 0.09
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.11
360 0.12
361 0.1
362 0.09
363 0.08
364 0.07
365 0.08
366 0.08
367 0.06
368 0.05
369 0.04
370 0.05
371 0.06
372 0.06
373 0.05
374 0.05
375 0.06
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.16
380 0.16
381 0.16
382 0.16
383 0.2
384 0.16
385 0.16
386 0.21
387 0.17
388 0.22
389 0.28
390 0.3
391 0.28
392 0.26
393 0.28
394 0.25
395 0.26
396 0.22
397 0.23
398 0.25
399 0.26
400 0.28
401 0.27
402 0.29
403 0.3
404 0.31
405 0.32
406 0.29
407 0.29
408 0.31
409 0.34
410 0.37
411 0.38
412 0.41
413 0.33
414 0.33
415 0.33
416 0.34
417 0.38
418 0.36
419 0.34
420 0.34
421 0.36
422 0.35
423 0.33
424 0.38
425 0.34
426 0.33
427 0.32
428 0.29
429 0.34
430 0.41
431 0.43
432 0.36
433 0.34
434 0.39
435 0.45
436 0.52
437 0.55
438 0.53
439 0.5
440 0.52
441 0.56
442 0.53
443 0.47
444 0.42
445 0.36
446 0.3
447 0.33
448 0.29
449 0.23
450 0.19
451 0.17
452 0.13
453 0.11
454 0.13
455 0.09
456 0.09
457 0.1
458 0.15
459 0.2
460 0.23
461 0.26
462 0.29
463 0.32
464 0.35
465 0.38
466 0.39
467 0.43
468 0.46
469 0.5
470 0.52
471 0.58
472 0.63
473 0.66
474 0.7
475 0.66
476 0.68
477 0.68
478 0.69
479 0.68
480 0.69
481 0.7
482 0.69
483 0.75
484 0.77
485 0.75
486 0.73
487 0.75
488 0.76
489 0.79
490 0.81
491 0.82
492 0.82
493 0.88
494 0.91
495 0.92
496 0.9
497 0.89
498 0.88
499 0.86
500 0.83
501 0.77
502 0.75
503 0.65
504 0.55
505 0.46
506 0.37
507 0.28
508 0.2
509 0.15
510 0.09
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.08
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.08