Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A5E4L7

Protein Details
Accession A5E4L7    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
96-120YDRAQYLKQNRIRKKQQDAKLREQQHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045146  SF3A1  
IPR022030  SF3A1_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG lel:LELG_04556  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF12230  PRP21_like_P  
PF01805  Surp  
Amino Acid Sequences MMSSKQQHYTSPLMDKSEFWISLNTKPNQGNSAQFEFLKPQHSLHGLFQTYVKQYDIVRAMISDPNHPLNKQVANDLDEIEHDKNNGQFNILTRGYDRAQYLKQNRIRKKQQDAKLREQQVKFALIDWQDFAIVEYIQFTKSEKNQELQTEGDQELKNLRLPLNRTDLIKRSLTNKRREIKLEKINQSNGTDHEQDLVESVRKQTSTSPPNKETSPSPTPPPFKGMKIKAAGTTRLKRATTKAASTTTLNNDDKIATNLGAKLIKCPITGKMIPEGEFDTHLRNLLRDPSYKQQQENYIKKNFSFESNITTDQVYENIKRLMKKRTSTLHD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.39
4 0.39
5 0.34
6 0.28
7 0.31
8 0.29
9 0.36
10 0.44
11 0.41
12 0.42
13 0.44
14 0.46
15 0.42
16 0.43
17 0.41
18 0.39
19 0.42
20 0.38
21 0.35
22 0.34
23 0.36
24 0.35
25 0.33
26 0.28
27 0.24
28 0.26
29 0.29
30 0.3
31 0.29
32 0.35
33 0.31
34 0.3
35 0.31
36 0.31
37 0.3
38 0.29
39 0.25
40 0.19
41 0.19
42 0.25
43 0.26
44 0.22
45 0.2
46 0.19
47 0.21
48 0.22
49 0.23
50 0.19
51 0.2
52 0.26
53 0.28
54 0.27
55 0.28
56 0.29
57 0.33
58 0.3
59 0.31
60 0.28
61 0.29
62 0.29
63 0.27
64 0.22
65 0.18
66 0.21
67 0.19
68 0.16
69 0.14
70 0.15
71 0.18
72 0.21
73 0.21
74 0.18
75 0.18
76 0.19
77 0.26
78 0.24
79 0.22
80 0.18
81 0.22
82 0.21
83 0.23
84 0.22
85 0.19
86 0.22
87 0.31
88 0.35
89 0.41
90 0.48
91 0.54
92 0.62
93 0.68
94 0.75
95 0.75
96 0.8
97 0.8
98 0.82
99 0.83
100 0.82
101 0.81
102 0.8
103 0.78
104 0.75
105 0.66
106 0.61
107 0.53
108 0.48
109 0.38
110 0.29
111 0.26
112 0.19
113 0.19
114 0.16
115 0.13
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.07
120 0.06
121 0.05
122 0.06
123 0.06
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.1
128 0.14
129 0.21
130 0.21
131 0.23
132 0.26
133 0.27
134 0.28
135 0.26
136 0.23
137 0.19
138 0.18
139 0.2
140 0.17
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.16
145 0.15
146 0.16
147 0.14
148 0.17
149 0.2
150 0.25
151 0.25
152 0.26
153 0.27
154 0.29
155 0.29
156 0.28
157 0.25
158 0.26
159 0.34
160 0.4
161 0.46
162 0.51
163 0.54
164 0.57
165 0.62
166 0.61
167 0.61
168 0.62
169 0.63
170 0.61
171 0.59
172 0.58
173 0.54
174 0.5
175 0.42
176 0.35
177 0.3
178 0.25
179 0.21
180 0.19
181 0.16
182 0.14
183 0.14
184 0.13
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.12
191 0.16
192 0.24
193 0.32
194 0.39
195 0.45
196 0.47
197 0.5
198 0.5
199 0.47
200 0.41
201 0.4
202 0.39
203 0.34
204 0.37
205 0.41
206 0.44
207 0.43
208 0.45
209 0.4
210 0.38
211 0.45
212 0.43
213 0.43
214 0.42
215 0.43
216 0.43
217 0.43
218 0.45
219 0.44
220 0.46
221 0.44
222 0.47
223 0.46
224 0.43
225 0.45
226 0.48
227 0.44
228 0.43
229 0.41
230 0.38
231 0.39
232 0.39
233 0.39
234 0.34
235 0.37
236 0.33
237 0.29
238 0.28
239 0.27
240 0.26
241 0.24
242 0.2
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.17
247 0.19
248 0.17
249 0.18
250 0.21
251 0.23
252 0.22
253 0.23
254 0.23
255 0.27
256 0.29
257 0.29
258 0.32
259 0.33
260 0.33
261 0.33
262 0.32
263 0.26
264 0.27
265 0.25
266 0.21
267 0.19
268 0.21
269 0.2
270 0.18
271 0.2
272 0.25
273 0.28
274 0.28
275 0.33
276 0.4
277 0.49
278 0.54
279 0.55
280 0.53
281 0.59
282 0.66
283 0.7
284 0.68
285 0.66
286 0.64
287 0.61
288 0.61
289 0.52
290 0.47
291 0.44
292 0.38
293 0.37
294 0.38
295 0.39
296 0.34
297 0.33
298 0.29
299 0.23
300 0.25
301 0.23
302 0.21
303 0.23
304 0.28
305 0.31
306 0.37
307 0.42
308 0.49
309 0.53
310 0.58
311 0.62