FuNGI

A5DSB1

Protein Details

Accession

A5DSB1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
3-26	QIIQNGSAKRRRTRQPVPFQPGFL	Hydrophilic
248-271	HDIKTKQADLRQRRNESKKRLTSF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 10, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027417 P-loop_NTPase IPR003395 RecF/RecN/SMC_N IPR027131 SMC5
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0030915 C:Smc5-Smc6 complex GO:0005524 F:ATP binding GO:0016887 F:ATP hydrolysis activity GO:0000724 P:double-strand break repair via homologous recombination
KEGG	lel:LELG_00247 -
Pfam	View protein in Pfam PF02463 SMC_N

Amino Acid Sequences

MDQIIQNGSAKRRRTRQPVPFQPGFLRSIKVWNFTTYSYTEFVLSPTLNMIIGPNGSGKSTLVAAICIGLAGKIDLIKRKNLKSIIKTGQERAKIEITMENFSGLPPIRIKRDFSAKESVWYLDDKKCTESAIKNLRKKFNIQLDNLCHFLPQERVAEFAGLSPEKLLLETERTLKDGHLLSLHEDLIEKDNKSQEYEIKIDQLKSRLEVLHGEREKLEEEARKLEAYDAKSREVENHRMLLPYAKWHDIKTKQADLRQRRNESKKRLTSFDKNFVPLKQNLEEIKEQMELQQTKTVEHTQKLGEIKSKIDASKEEMRNAKDEITGLKLSLESYKTRTEQKRRDLELAKVELAELQGKLDNSERIDQNEITLLNAQFAERKAVLRDRQEKVEELNLQVRDLGGELSDLNMKLDRMRKKLDGSDKLELLMLASNHSYRLRDESFRAHLDLRKVAELQGKYYEAPVISCNVTDKALAPALEKIIDNNTLFAFTVTSNEGYAALTHYSQKRKSNTPLRQLTEVRIPTSELTGDKLSSLGFDGYLIDYIKGPSAVLSMLCKVSKLHMIPVTRRELSESQLKRLTDSSSNFPFKKFIVGDTLFTIIKSRYGSRQVSYSTEKILNSKYFAVSGLSERDKQVINSQIEQLQLDISSKKNDYTEMKTQMQVLDSEIRDIKSQMSEIKNQLHNLQEAINSVLRLEGKVKLATEKVQRLERDANKDYTKKIRSYEQKIAIKYNQFSAITAELSKWYYKLSDLQIQDKVSQFEKLYLKNREQSAVALIKELEAIQEKLHLDYRKFKAEYEKIKESPEYKEIQAMNERTSEEVRKVIAELAEPYFENNTFTEETIRRKIEHLEDELSIMSTADRGSETLLRAKLAEIDRAEIDLPKFESDKSNLDERIKTISSSWESELDKFVYQISMAFSKRFSKVASDGRVELAKSERFKDWKLQIMVKFREESELKVLDHQSQSGGERAVSTIFFIMALQGLSDAPFRIVDEINQGMDPKNEQMAHRYLVHTACKNSKSQYFLVTPKLLTGLYYHPDMMVHCIFTGPLIEENNDNNNSEGSFMDFANNLISV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.72
2	0.78
3	0.81
4	0.85
5	0.89
6	0.89
7	0.84
8	0.78
9	0.73
10	0.66
11	0.6
12	0.51
13	0.43
14	0.34
15	0.4
16	0.4
17	0.4
18	0.38
19	0.37
20	0.37
21	0.36
22	0.39
23	0.31
24	0.31
25	0.26
26	0.25
27	0.23
28	0.2
29	0.2
30	0.19
31	0.17
32	0.14
33	0.14
34	0.14
35	0.12
36	0.12
37	0.12
38	0.1
39	0.1
40	0.11
41	0.12
42	0.11
43	0.12
44	0.13
45	0.12
46	0.12
47	0.12
48	0.14
49	0.12
50	0.11
51	0.11
52	0.11
53	0.1
54	0.09
55	0.08
56	0.05
57	0.05
58	0.05
59	0.06
60	0.08
61	0.12
62	0.2
63	0.22
64	0.31
65	0.39
66	0.44
67	0.51
68	0.57
69	0.63
70	0.63
71	0.7
72	0.7
73	0.71
74	0.71
75	0.71
76	0.7
77	0.67
78	0.62
79	0.57
80	0.51
81	0.42
82	0.39
83	0.37
84	0.32
85	0.29
86	0.28
87	0.24
88	0.2
89	0.19
90	0.22
91	0.18
92	0.18
93	0.2
94	0.24
95	0.31
96	0.34
97	0.38
98	0.4
99	0.5
100	0.52
101	0.51
102	0.56
103	0.49
104	0.51
105	0.48
106	0.43
107	0.34
108	0.34
109	0.33
110	0.3
111	0.34
112	0.31
113	0.32
114	0.31
115	0.32
116	0.34
117	0.35
118	0.39
119	0.46
120	0.54
121	0.59
122	0.66
123	0.73
124	0.7
125	0.7
126	0.7
127	0.69
128	0.68
129	0.65
130	0.66
131	0.64
132	0.64
133	0.6
134	0.5
135	0.39
136	0.32
137	0.29
138	0.24
139	0.2
140	0.21
141	0.2
142	0.22
143	0.22
144	0.22
145	0.2
146	0.17
147	0.19
148	0.15
149	0.15
150	0.13
151	0.13
152	0.13
153	0.13
154	0.13
155	0.09
156	0.13
157	0.16
158	0.21
159	0.21
160	0.22
161	0.22
162	0.21
163	0.25
164	0.22
165	0.21
166	0.18
167	0.18
168	0.2
169	0.21
170	0.21
171	0.16
172	0.15
173	0.15
174	0.18
175	0.21
176	0.19
177	0.21
178	0.26
179	0.26
180	0.29
181	0.3
182	0.3
183	0.31
184	0.34
185	0.32
186	0.33
187	0.36
188	0.36
189	0.37
190	0.36
191	0.32
192	0.31
193	0.33
194	0.27
195	0.26
196	0.29
197	0.29
198	0.35
199	0.35
200	0.34
201	0.31
202	0.31
203	0.31
204	0.27
205	0.27
206	0.22
207	0.23
208	0.26
209	0.27
210	0.26
211	0.25
212	0.27
213	0.28
214	0.27
215	0.32
216	0.31
217	0.32
218	0.33
219	0.33
220	0.37
221	0.39
222	0.42
223	0.37
224	0.39
225	0.37
226	0.36
227	0.36
228	0.33
229	0.28
230	0.28
231	0.28
232	0.29
233	0.29
234	0.31
235	0.39
236	0.4
237	0.47
238	0.47
239	0.52
240	0.51
241	0.56
242	0.64
243	0.65
244	0.71
245	0.72
246	0.74
247	0.75
248	0.81
249	0.85
250	0.85
251	0.86
252	0.84
253	0.79
254	0.77
255	0.75
256	0.75
257	0.73
258	0.72
259	0.65
260	0.6
261	0.57
262	0.53
263	0.51
264	0.44
265	0.41
266	0.34
267	0.35
268	0.33
269	0.35
270	0.33
271	0.29
272	0.28
273	0.23
274	0.21
275	0.19
276	0.25
277	0.22
278	0.22
279	0.26
280	0.24
281	0.24
282	0.27
283	0.32
284	0.28
285	0.28
286	0.29
287	0.25
288	0.3
289	0.32
290	0.31
291	0.29
292	0.26
293	0.26
294	0.27
295	0.29
296	0.25
297	0.25
298	0.24
299	0.25
300	0.34
301	0.35
302	0.37
303	0.38
304	0.39
305	0.39
306	0.39
307	0.34
308	0.24
309	0.23
310	0.19
311	0.18
312	0.17
313	0.15
314	0.14
315	0.13
316	0.12
317	0.15
318	0.16
319	0.13
320	0.16
321	0.2
322	0.22
323	0.32
324	0.4
325	0.48
326	0.54
327	0.62
328	0.69
329	0.69
330	0.74
331	0.69
332	0.64
333	0.61
334	0.55
335	0.46
336	0.36
337	0.32
338	0.24
339	0.21
340	0.18
341	0.1
342	0.08
343	0.1
344	0.1
345	0.11
346	0.12
347	0.14
348	0.14
349	0.19
350	0.19
351	0.19
352	0.23
353	0.22
354	0.2
355	0.2
356	0.18
357	0.14
358	0.16
359	0.14
360	0.12
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.12
365	0.14
366	0.12
367	0.13
368	0.15
369	0.21
370	0.26
371	0.32
372	0.4
373	0.4
374	0.44
375	0.45
376	0.43
377	0.39
378	0.4
379	0.33
380	0.27
381	0.29
382	0.25
383	0.23
384	0.22
385	0.2
386	0.14
387	0.12
388	0.1
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.05
393	0.06
394	0.06
395	0.06
396	0.07
397	0.07
398	0.11
399	0.18
400	0.23
401	0.26
402	0.31
403	0.33
404	0.36
405	0.43
406	0.49
407	0.5
408	0.5
409	0.49
410	0.45
411	0.42
412	0.39
413	0.32
414	0.23
415	0.16
416	0.1
417	0.07
418	0.08
419	0.07
420	0.09
421	0.1
422	0.1
423	0.09
424	0.15
425	0.17
426	0.19
427	0.21
428	0.24
429	0.28
430	0.28
431	0.29
432	0.26
433	0.26
434	0.27
435	0.27
436	0.24
437	0.21
438	0.2
439	0.21
440	0.24
441	0.21
442	0.2
443	0.19
444	0.19
445	0.18
446	0.18
447	0.16
448	0.11
449	0.11
450	0.1
451	0.09
452	0.09
453	0.09
454	0.1
455	0.09
456	0.1
457	0.09
458	0.09
459	0.09
460	0.1
461	0.11
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.11
466	0.1
467	0.09
468	0.09
469	0.11
470	0.11
471	0.11
472	0.1
473	0.09
474	0.1
475	0.09
476	0.08
477	0.06
478	0.07
479	0.07
480	0.08
481	0.07
482	0.07
483	0.07
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.1
490	0.14
491	0.19
492	0.23
493	0.29
494	0.33
495	0.38
496	0.47
497	0.54
498	0.57
499	0.62
500	0.66
501	0.62
502	0.63
503	0.59
504	0.52
505	0.48
506	0.41
507	0.32
508	0.25
509	0.23
510	0.17
511	0.17
512	0.16
513	0.09
514	0.1
515	0.1
516	0.09
517	0.09
518	0.08
519	0.08
520	0.07
521	0.07
522	0.05
523	0.04
524	0.04
525	0.05
526	0.04
527	0.06
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.06
532	0.06
533	0.05
534	0.05
535	0.04
536	0.05
537	0.05
538	0.05
539	0.05
540	0.06
541	0.07
542	0.07
543	0.08
544	0.08
545	0.09
546	0.13
547	0.13
548	0.16
549	0.19
550	0.22
551	0.24
552	0.29
553	0.33
554	0.29
555	0.28
556	0.28
557	0.25
558	0.25
559	0.32
560	0.28
561	0.27
562	0.3
563	0.3
564	0.27
565	0.28
566	0.27
567	0.23
568	0.25
569	0.26
570	0.29
571	0.34
572	0.33
573	0.32
574	0.31
575	0.26
576	0.29
577	0.24
578	0.18
579	0.2
580	0.21
581	0.21
582	0.21
583	0.23
584	0.17
585	0.17
586	0.17
587	0.1
588	0.11
589	0.11
590	0.12
591	0.14
592	0.21
593	0.23
594	0.23
595	0.26
596	0.25
597	0.28
598	0.31
599	0.28
600	0.24
601	0.25
602	0.24
603	0.23
604	0.26
605	0.22
606	0.2
607	0.2
608	0.17
609	0.15
610	0.15
611	0.14
612	0.11
613	0.11
614	0.14
615	0.15
616	0.16
617	0.16
618	0.17
619	0.17
620	0.16
621	0.2
622	0.23
623	0.23
624	0.24
625	0.25
626	0.25
627	0.25
628	0.24
629	0.19
630	0.12
631	0.1
632	0.09
633	0.09
634	0.09
635	0.11
636	0.12
637	0.13
638	0.13
639	0.16
640	0.19
641	0.25
642	0.31
643	0.35
644	0.36
645	0.35
646	0.36
647	0.34
648	0.3
649	0.24
650	0.18
651	0.17
652	0.15
653	0.17
654	0.17
655	0.16
656	0.16
657	0.17
658	0.16
659	0.11
660	0.13
661	0.17
662	0.18
663	0.22
664	0.25
665	0.31
666	0.33
667	0.33
668	0.35
669	0.31
670	0.28
671	0.25
672	0.22
673	0.16
674	0.14
675	0.15
676	0.13
677	0.11
678	0.1
679	0.11
680	0.1
681	0.1
682	0.11
683	0.11
684	0.13
685	0.14
686	0.15
687	0.16
688	0.17
689	0.22
690	0.27
691	0.29
692	0.31
693	0.35
694	0.35
695	0.38
696	0.45
697	0.45
698	0.47
699	0.45
700	0.47
701	0.47
702	0.49
703	0.48
704	0.48
705	0.48
706	0.43
707	0.42
708	0.46
709	0.5
710	0.56
711	0.61
712	0.61
713	0.62
714	0.61
715	0.63
716	0.59
717	0.54
718	0.47
719	0.41
720	0.35
721	0.3
722	0.28
723	0.25
724	0.22
725	0.17
726	0.17
727	0.14
728	0.11
729	0.13
730	0.13
731	0.11
732	0.1
733	0.1
734	0.11
735	0.16
736	0.18
737	0.24
738	0.26
739	0.3
740	0.33
741	0.34
742	0.35
743	0.32
744	0.3
745	0.24
746	0.25
747	0.21
748	0.24
749	0.27
750	0.3
751	0.36
752	0.4
753	0.44
754	0.47
755	0.48
756	0.43
757	0.39
758	0.34
759	0.32
760	0.3
761	0.25
762	0.2
763	0.19
764	0.17
765	0.17
766	0.15
767	0.11
768	0.09
769	0.1
770	0.09
771	0.13
772	0.13
773	0.15
774	0.21
775	0.22
776	0.23
777	0.31
778	0.36
779	0.41
780	0.41
781	0.41
782	0.45
783	0.51
784	0.58
785	0.57
786	0.61
787	0.54
788	0.56
789	0.58
790	0.5
791	0.46
792	0.41
793	0.37
794	0.29
795	0.34
796	0.32
797	0.32
798	0.37
799	0.34
800	0.3
801	0.29
802	0.29
803	0.25
804	0.27
805	0.26
806	0.2
807	0.2
808	0.19
809	0.17
810	0.18
811	0.18
812	0.15
813	0.14
814	0.15
815	0.14
816	0.15
817	0.14
818	0.14
819	0.14
820	0.13
821	0.14
822	0.11
823	0.14
824	0.14
825	0.15
826	0.19
827	0.21
828	0.27
829	0.32
830	0.34
831	0.31
832	0.32
833	0.37
834	0.38
835	0.4
836	0.39
837	0.34
838	0.32
839	0.32
840	0.31
841	0.26
842	0.19
843	0.13
844	0.09
845	0.07
846	0.06
847	0.06
848	0.06
849	0.06
850	0.08
851	0.11
852	0.13
853	0.18
854	0.19
855	0.19
856	0.19
857	0.19
858	0.24
859	0.22
860	0.26
861	0.21
862	0.22
863	0.22
864	0.23
865	0.23
866	0.19
867	0.18
868	0.16
869	0.17
870	0.16
871	0.17
872	0.17
873	0.21
874	0.22
875	0.27
876	0.28
877	0.32
878	0.35
879	0.38
880	0.39
881	0.36
882	0.39
883	0.34
884	0.31
885	0.26
886	0.29
887	0.29
888	0.3
889	0.3
890	0.29
891	0.3
892	0.31
893	0.33
894	0.27
895	0.24
896	0.21
897	0.2
898	0.15
899	0.13
900	0.13
901	0.13
902	0.17
903	0.18
904	0.18
905	0.2
906	0.24
907	0.27
908	0.27
909	0.25
910	0.25
911	0.32
912	0.39
913	0.43
914	0.42
915	0.41
916	0.42
917	0.43
918	0.37
919	0.32
920	0.28
921	0.28
922	0.27
923	0.3
924	0.33
925	0.36
926	0.38
927	0.45
928	0.46
929	0.5
930	0.52
931	0.56
932	0.56
933	0.62
934	0.63
935	0.58
936	0.54
937	0.45
938	0.47
939	0.41
940	0.38
941	0.35
942	0.34
943	0.31
944	0.34
945	0.36
946	0.34
947	0.34
948	0.31
949	0.26
950	0.25
951	0.26
952	0.23
953	0.22
954	0.16
955	0.16
956	0.16
957	0.16
958	0.13
959	0.13
960	0.1
961	0.09
962	0.09
963	0.08
964	0.08
965	0.07
966	0.07
967	0.06
968	0.06
969	0.06
970	0.07
971	0.08
972	0.08
973	0.08
974	0.08
975	0.09
976	0.12
977	0.12
978	0.13
979	0.17
980	0.19
981	0.19
982	0.19
983	0.2
984	0.19
985	0.2
986	0.21
987	0.17
988	0.21
989	0.23
990	0.23
991	0.28
992	0.31
993	0.33
994	0.34
995	0.33
996	0.32
997	0.34
998	0.4
999	0.39
1000	0.41
1001	0.46
1002	0.45
1003	0.48
1004	0.5
1005	0.51
1006	0.49
1007	0.47
1008	0.47
1009	0.46
1010	0.48
1011	0.51
1012	0.48
1013	0.43
1014	0.38
1015	0.37
1016	0.3
1017	0.24
1018	0.22
1019	0.21
1020	0.2
1021	0.22
1022	0.21
1023	0.19
1024	0.2
1025	0.21
1026	0.24
1027	0.2
1028	0.18
1029	0.16
1030	0.16
1031	0.15
1032	0.15
1033	0.16
1034	0.12
1035	0.14
1036	0.15
1037	0.16
1038	0.19
1039	0.22
1040	0.29
1041	0.29
1042	0.28
1043	0.25
1044	0.24
1045	0.22
1046	0.21
1047	0.18
1048	0.15
1049	0.15
1050	0.14
1051	0.15
1052	0.15
1053	0.15

A5DSB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer