FuNGI

A0A448YL88

Protein Details

Accession

A0A448YL88

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
22-49	GSSGRDPPRPRGPRKYRGDHDNRSPRSP	Basic
54-77	SSFSDRRRTHDRPHTERISRRPTH	Basic
89-108	LNEQRPKKSLWDKRPKLLDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
28-47	PPRPRGPRKYRGDHDNRSPR

Subcellular Location(s)

nucl 20.5, cyto_nucl 13.5, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12232 RRM3_U2AF65

Amino Acid Sequences

MQHSNEDTSDQGFHPSHFRNDGSSGRDPPRPRGPRKYRGDHDNRSPRSPRPVYSSFSDRRRTHDRPHTERISRRPTHRFDRVPEGTPSLNEQRPKKSLWDKRPKLLDDISARDAREIGLFAEPGATLNPSITSERVKEMLSKNLVRHGSLKLEASRLGPSYSRTSKRLVVSGINIEEHSAEKIQKVLEGFLASTVIPGVEPGDYKITTRIVTTDEKILIVETTKPVVTTVLLTLSDTSLPNLDTTFHLERPHEYVAFNWKPEQTKEGDEEEAKEVIIENTHLLCLRHIPYGVDREAILGLLTKYGKLDTLAVLLDKITYESKGSAFFSFKKSKGDDKDNTDDLLSKLNEEELDGAKLECFRPCFNSNTKYSQSANFDSRKLLDYVDQSTASITVHNDSKVLRFLNCVAVADLFDDSKCKEIETSFVEECKRFGNVTEFLLPRPNEAFRKGLDEMKPEFGEIFVQFSTAAEAKDCLYYLAGRTFYGRLVIGGYFDEDDFQRGML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.31
3	0.35
4	0.37
5	0.37
6	0.35
7	0.39
8	0.43
9	0.42
10	0.43
11	0.45
12	0.45
13	0.51
14	0.51
15	0.54
16	0.6
17	0.63
18	0.66
19	0.71
20	0.76
21	0.79
22	0.86
23	0.89
24	0.86
25	0.87
26	0.88
27	0.86
28	0.87
29	0.87
30	0.82
31	0.8
32	0.76
33	0.71
34	0.71
35	0.67
36	0.61
37	0.58
38	0.58
39	0.54
40	0.56
41	0.59
42	0.57
43	0.59
44	0.65
45	0.58
46	0.61
47	0.66
48	0.66
49	0.67
50	0.7
51	0.72
52	0.71
53	0.79
54	0.81
55	0.8
56	0.81
57	0.8
58	0.8
59	0.77
60	0.77
61	0.77
62	0.76
63	0.77
64	0.79
65	0.76
66	0.71
67	0.74
68	0.7
69	0.64
70	0.59
71	0.54
72	0.45
73	0.39
74	0.39
75	0.36
76	0.36
77	0.38
78	0.4
79	0.44
80	0.46
81	0.47
82	0.51
83	0.54
84	0.6
85	0.65
86	0.71
87	0.7
88	0.75
89	0.82
90	0.75
91	0.7
92	0.63
93	0.59
94	0.53
95	0.52
96	0.49
97	0.43
98	0.4
99	0.35
100	0.32
101	0.25
102	0.2
103	0.15
104	0.11
105	0.1
106	0.1
107	0.09
108	0.1
109	0.09
110	0.08
111	0.08
112	0.08
113	0.06
114	0.06
115	0.07
116	0.08
117	0.1
118	0.11
119	0.13
120	0.14
121	0.16
122	0.18
123	0.18
124	0.22
125	0.24
126	0.3
127	0.34
128	0.36
129	0.35
130	0.4
131	0.4
132	0.35
133	0.35
134	0.3
135	0.27
136	0.26
137	0.28
138	0.22
139	0.23
140	0.23
141	0.22
142	0.21
143	0.18
144	0.18
145	0.15
146	0.17
147	0.23
148	0.29
149	0.32
150	0.32
151	0.35
152	0.39
153	0.4
154	0.4
155	0.35
156	0.3
157	0.29
158	0.3
159	0.28
160	0.23
161	0.2
162	0.17
163	0.15
164	0.13
165	0.12
166	0.1
167	0.09
168	0.09
169	0.11
170	0.1
171	0.12
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.1
176	0.1
177	0.08
178	0.09
179	0.07
180	0.07
181	0.06
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.04
187	0.04
188	0.05
189	0.08
190	0.09
191	0.09
192	0.11
193	0.12
194	0.12
195	0.12
196	0.12
197	0.13
198	0.15
199	0.16
200	0.17
201	0.16
202	0.15
203	0.15
204	0.14
205	0.11
206	0.09
207	0.09
208	0.07
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.08
214	0.07
215	0.07
216	0.06
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.06
228	0.06
229	0.07
230	0.06
231	0.12
232	0.14
233	0.15
234	0.16
235	0.17
236	0.18
237	0.2
238	0.22
239	0.17
240	0.14
241	0.14
242	0.22
243	0.23
244	0.22
245	0.21
246	0.21
247	0.23
248	0.23
249	0.25
250	0.18
251	0.19
252	0.21
253	0.21
254	0.21
255	0.19
256	0.2
257	0.2
258	0.17
259	0.15
260	0.11
261	0.1
262	0.08
263	0.08
264	0.06
265	0.05
266	0.05
267	0.06
268	0.07
269	0.07
270	0.07
271	0.1
272	0.11
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.14
277	0.19
278	0.19
279	0.16
280	0.14
281	0.14
282	0.13
283	0.12
284	0.1
285	0.06
286	0.06
287	0.07
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.08
293	0.07
294	0.08
295	0.06
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.07
300	0.07
301	0.07
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.08
308	0.09
309	0.11
310	0.12
311	0.13
312	0.15
313	0.17
314	0.23
315	0.28
316	0.29
317	0.32
318	0.34
319	0.4
320	0.45
321	0.52
322	0.51
323	0.53
324	0.58
325	0.54
326	0.51
327	0.43
328	0.38
329	0.29
330	0.29
331	0.21
332	0.15
333	0.14
334	0.14
335	0.14
336	0.12
337	0.14
338	0.09
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.11
344	0.12
345	0.12
346	0.14
347	0.14
348	0.2
349	0.23
350	0.27
351	0.33
352	0.38
353	0.4
354	0.45
355	0.46
356	0.44
357	0.44
358	0.44
359	0.43
360	0.42
361	0.44
362	0.4
363	0.39
364	0.36
365	0.36
366	0.33
367	0.28
368	0.23
369	0.2
370	0.2
371	0.23
372	0.24
373	0.22
374	0.2
375	0.19
376	0.19
377	0.15
378	0.13
379	0.1
380	0.11
381	0.13
382	0.13
383	0.14
384	0.14
385	0.17
386	0.2
387	0.2
388	0.18
389	0.18
390	0.2
391	0.25
392	0.25
393	0.23
394	0.2
395	0.19
396	0.18
397	0.17
398	0.15
399	0.09
400	0.09
401	0.09
402	0.09
403	0.12
404	0.12
405	0.12
406	0.13
407	0.13
408	0.18
409	0.21
410	0.27
411	0.25
412	0.29
413	0.31
414	0.3
415	0.3
416	0.27
417	0.25
418	0.19
419	0.2
420	0.23
421	0.22
422	0.25
423	0.32
424	0.3
425	0.3
426	0.37
427	0.34
428	0.31
429	0.32
430	0.34
431	0.31
432	0.33
433	0.35
434	0.29
435	0.36
436	0.35
437	0.39
438	0.37
439	0.39
440	0.39
441	0.43
442	0.42
443	0.35
444	0.33
445	0.26
446	0.25
447	0.2
448	0.19
449	0.13
450	0.13
451	0.12
452	0.12
453	0.16
454	0.14
455	0.14
456	0.12
457	0.13
458	0.14
459	0.15
460	0.15
461	0.12
462	0.12
463	0.13
464	0.15
465	0.2
466	0.2
467	0.19
468	0.22
469	0.22
470	0.21
471	0.22
472	0.19
473	0.14
474	0.15
475	0.15
476	0.13
477	0.13
478	0.14
479	0.13
480	0.13
481	0.14
482	0.13
483	0.15

A0A448YL88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer