Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YJX6

Protein Details
Accession A0A448YJX6    Localization Confidence High Confidence Score 20.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-58MSISKDNKKKHLQDQPGHTRIHydrophilic
289-316LPSIDNKKKVKSKKARRKKGATTDTSSYHydrophilic
400-425ADTVSKSKLAERRRKEKGRALNGATSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-308KKKVKSKKARRKKG
405-418KSKLAERRRKEKGR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MPTKKWIDKKKALNFALVHRSHEDAHYYDDDVSGSVFMSISKDNKKKHLQDQPGHTRIETKNELEDNLAESDKMRSNEGEAAMYGITYDDSEYDYMQHLRTIGSGGDGVFISKTAEEDDTAKKEFKLKEILPNEMLPTEQGEYDYQRQQSIPDEISGFKPDLNPDLREALTALDDEAYLDDSKDVDDIDVFASLLNGKKHKDLSLREYNELALKDEGQEQWDLDQYDEYGDVDAGDDDFSWEKDFNHFKKANMSGKIKNDWDTDDEFESDEDEDEVVNREETRDTIGELPSIDNKKKVKSKKARRKKGATTDTSSYSMSSSALCRTEQLSIIDDRFDVMKKKYEQDEVEAEEEEEPEPFDFKNERSDFASLIDDFLDNYEQKGKKIVRKDEESERIREAADTVSKSKLAERRRKEKGRALNGATSLKGLTKGINGLNI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.7
2 0.67
3 0.68
4 0.59
5 0.53
6 0.44
7 0.45
8 0.39
9 0.38
10 0.34
11 0.25
12 0.29
13 0.27
14 0.26
15 0.24
16 0.23
17 0.21
18 0.17
19 0.16
20 0.1
21 0.08
22 0.07
23 0.07
24 0.06
25 0.09
26 0.12
27 0.18
28 0.27
29 0.34
30 0.39
31 0.48
32 0.58
33 0.64
34 0.71
35 0.75
36 0.76
37 0.77
38 0.83
39 0.85
40 0.8
41 0.73
42 0.63
43 0.61
44 0.52
45 0.52
46 0.47
47 0.38
48 0.39
49 0.39
50 0.4
51 0.34
52 0.32
53 0.26
54 0.23
55 0.21
56 0.15
57 0.14
58 0.17
59 0.2
60 0.21
61 0.2
62 0.18
63 0.21
64 0.25
65 0.25
66 0.22
67 0.17
68 0.17
69 0.15
70 0.14
71 0.11
72 0.07
73 0.06
74 0.05
75 0.05
76 0.05
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.11
82 0.12
83 0.12
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.12
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.06
100 0.07
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.12
105 0.16
106 0.19
107 0.21
108 0.22
109 0.21
110 0.27
111 0.28
112 0.29
113 0.33
114 0.32
115 0.4
116 0.41
117 0.45
118 0.4
119 0.39
120 0.36
121 0.28
122 0.25
123 0.16
124 0.15
125 0.11
126 0.09
127 0.09
128 0.1
129 0.13
130 0.17
131 0.22
132 0.21
133 0.21
134 0.21
135 0.21
136 0.23
137 0.24
138 0.2
139 0.17
140 0.17
141 0.17
142 0.19
143 0.19
144 0.16
145 0.13
146 0.13
147 0.13
148 0.17
149 0.18
150 0.18
151 0.18
152 0.2
153 0.2
154 0.18
155 0.18
156 0.13
157 0.11
158 0.1
159 0.08
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.05
181 0.08
182 0.09
183 0.11
184 0.12
185 0.15
186 0.16
187 0.2
188 0.25
189 0.27
190 0.33
191 0.41
192 0.43
193 0.42
194 0.41
195 0.38
196 0.34
197 0.3
198 0.23
199 0.14
200 0.11
201 0.11
202 0.12
203 0.12
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.09
208 0.11
209 0.1
210 0.08
211 0.08
212 0.07
213 0.07
214 0.07
215 0.07
216 0.05
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.03
224 0.04
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.12
231 0.2
232 0.2
233 0.29
234 0.31
235 0.3
236 0.37
237 0.44
238 0.45
239 0.45
240 0.48
241 0.45
242 0.48
243 0.52
244 0.46
245 0.42
246 0.37
247 0.32
248 0.3
249 0.26
250 0.24
251 0.21
252 0.2
253 0.17
254 0.15
255 0.14
256 0.11
257 0.09
258 0.07
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.11
270 0.1
271 0.11
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.14
277 0.17
278 0.21
279 0.21
280 0.24
281 0.27
282 0.33
283 0.41
284 0.49
285 0.54
286 0.61
287 0.71
288 0.77
289 0.86
290 0.9
291 0.92
292 0.93
293 0.92
294 0.92
295 0.9
296 0.85
297 0.8
298 0.73
299 0.66
300 0.58
301 0.48
302 0.37
303 0.28
304 0.22
305 0.16
306 0.13
307 0.11
308 0.12
309 0.13
310 0.13
311 0.14
312 0.15
313 0.16
314 0.18
315 0.18
316 0.17
317 0.18
318 0.19
319 0.18
320 0.16
321 0.15
322 0.14
323 0.15
324 0.16
325 0.16
326 0.24
327 0.27
328 0.33
329 0.37
330 0.42
331 0.42
332 0.43
333 0.45
334 0.41
335 0.39
336 0.33
337 0.3
338 0.23
339 0.22
340 0.17
341 0.12
342 0.1
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.11
347 0.13
348 0.14
349 0.24
350 0.25
351 0.27
352 0.3
353 0.31
354 0.28
355 0.28
356 0.3
357 0.2
358 0.19
359 0.17
360 0.14
361 0.12
362 0.13
363 0.14
364 0.11
365 0.12
366 0.2
367 0.21
368 0.21
369 0.3
370 0.35
371 0.39
372 0.49
373 0.57
374 0.58
375 0.65
376 0.7
377 0.72
378 0.76
379 0.73
380 0.67
381 0.6
382 0.52
383 0.45
384 0.39
385 0.3
386 0.26
387 0.27
388 0.26
389 0.25
390 0.27
391 0.27
392 0.28
393 0.33
394 0.35
395 0.4
396 0.47
397 0.55
398 0.62
399 0.73
400 0.82
401 0.84
402 0.86
403 0.87
404 0.87
405 0.86
406 0.81
407 0.77
408 0.72
409 0.66
410 0.56
411 0.47
412 0.37
413 0.29
414 0.25
415 0.2
416 0.17
417 0.17
418 0.21