Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YNB1

Protein Details
Accession A0A448YNB1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
298-321CEEMKLRTRRYAKRQVKWIRNTLIHydrophilic
419-445DQYELHLRSRRHKRSERAAKRPRHYRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
426-445RSRRHKRSERAAKRPRHYRS
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10.5, cyto_nucl 8.833, cyto_mito 7.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039657  Dimethylallyltransferase  
IPR030666  IPP_transferase_euk  
IPR018022  IPT  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0052381  F:tRNA dimethylallyltransferase activity  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01715  IPPT  
Amino Acid Sequences MSTIKQRPGSVVSIIGTTGVGKSDLGVALAEALGGEIINADSMQMYKGLPQITNKHPMPERHGIPHHIMDHVAWNEEYHIHRFQKECLAKIDEIHSRGKLPILVGGTHYYLQSVLFVNKTIDTRETQDQEQLGDISKEQKKILDEGSPELLHQLLVQYDPVVAMKFHPHDVRRIKRALEVFYRTGKPASEYYREQQKAQRYESRLRYNTLFLWLYALPEELDKRLDKRVDKMMDQGGLEELGELYEYYDKLPEPKPGMDQGCFQVIGFKEFLPFLEQNPIREMSKEEVLRDPLFIECCEEMKLRTRRYAKRQVKWIRNTLIPDLEIESQHNWCNGGRVYVLNATDLSRWDEVEERGLEIVREFVDKGKVGEVIEQVPEGLESEGLVRSKKERFDESKWVYHTCNICLDKEGKKLVLVGDQYELHLRSRRHKRSERAAKRPRHYRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.19
3 0.15
4 0.12
5 0.11
6 0.08
7 0.08
8 0.07
9 0.08
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.09
14 0.08
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.05
19 0.04
20 0.04
21 0.04
22 0.03
23 0.03
24 0.03
25 0.04
26 0.04
27 0.04
28 0.04
29 0.05
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.09
34 0.13
35 0.16
36 0.18
37 0.23
38 0.31
39 0.36
40 0.45
41 0.44
42 0.47
43 0.51
44 0.53
45 0.55
46 0.57
47 0.55
48 0.54
49 0.58
50 0.54
51 0.54
52 0.55
53 0.48
54 0.39
55 0.36
56 0.28
57 0.3
58 0.27
59 0.24
60 0.18
61 0.17
62 0.17
63 0.2
64 0.22
65 0.2
66 0.26
67 0.26
68 0.3
69 0.32
70 0.34
71 0.41
72 0.42
73 0.41
74 0.39
75 0.42
76 0.38
77 0.39
78 0.42
79 0.36
80 0.35
81 0.36
82 0.31
83 0.27
84 0.28
85 0.27
86 0.23
87 0.18
88 0.18
89 0.17
90 0.16
91 0.16
92 0.18
93 0.17
94 0.17
95 0.16
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.11
104 0.12
105 0.13
106 0.14
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.2
111 0.25
112 0.28
113 0.27
114 0.29
115 0.28
116 0.26
117 0.25
118 0.21
119 0.16
120 0.13
121 0.12
122 0.17
123 0.2
124 0.22
125 0.22
126 0.24
127 0.24
128 0.27
129 0.28
130 0.24
131 0.22
132 0.23
133 0.26
134 0.23
135 0.21
136 0.19
137 0.17
138 0.12
139 0.1
140 0.09
141 0.05
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.05
150 0.06
151 0.1
152 0.11
153 0.15
154 0.19
155 0.2
156 0.28
157 0.38
158 0.44
159 0.46
160 0.48
161 0.46
162 0.46
163 0.49
164 0.45
165 0.41
166 0.39
167 0.36
168 0.38
169 0.38
170 0.33
171 0.31
172 0.26
173 0.22
174 0.22
175 0.24
176 0.24
177 0.26
178 0.29
179 0.38
180 0.39
181 0.39
182 0.4
183 0.43
184 0.44
185 0.46
186 0.49
187 0.44
188 0.51
189 0.57
190 0.61
191 0.55
192 0.51
193 0.48
194 0.43
195 0.38
196 0.34
197 0.26
198 0.17
199 0.18
200 0.15
201 0.14
202 0.12
203 0.12
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.06
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.14
212 0.18
213 0.19
214 0.22
215 0.3
216 0.31
217 0.31
218 0.33
219 0.3
220 0.28
221 0.27
222 0.23
223 0.15
224 0.12
225 0.11
226 0.08
227 0.05
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.1
238 0.12
239 0.15
240 0.18
241 0.19
242 0.21
243 0.25
244 0.28
245 0.25
246 0.25
247 0.22
248 0.21
249 0.2
250 0.17
251 0.16
252 0.14
253 0.15
254 0.14
255 0.13
256 0.12
257 0.12
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.12
262 0.21
263 0.22
264 0.22
265 0.25
266 0.26
267 0.22
268 0.22
269 0.24
270 0.17
271 0.23
272 0.23
273 0.22
274 0.23
275 0.26
276 0.26
277 0.24
278 0.21
279 0.17
280 0.17
281 0.15
282 0.15
283 0.11
284 0.12
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.22
289 0.29
290 0.3
291 0.37
292 0.46
293 0.53
294 0.62
295 0.72
296 0.72
297 0.73
298 0.81
299 0.83
300 0.84
301 0.83
302 0.81
303 0.75
304 0.69
305 0.64
306 0.57
307 0.49
308 0.39
309 0.32
310 0.27
311 0.23
312 0.2
313 0.18
314 0.17
315 0.16
316 0.18
317 0.17
318 0.16
319 0.14
320 0.18
321 0.16
322 0.16
323 0.15
324 0.14
325 0.16
326 0.18
327 0.19
328 0.15
329 0.15
330 0.15
331 0.15
332 0.15
333 0.17
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.17
338 0.16
339 0.21
340 0.2
341 0.17
342 0.17
343 0.17
344 0.16
345 0.13
346 0.14
347 0.09
348 0.1
349 0.1
350 0.12
351 0.15
352 0.16
353 0.17
354 0.17
355 0.18
356 0.17
357 0.21
358 0.2
359 0.18
360 0.18
361 0.17
362 0.15
363 0.13
364 0.12
365 0.1
366 0.08
367 0.06
368 0.05
369 0.07
370 0.1
371 0.11
372 0.12
373 0.13
374 0.17
375 0.23
376 0.29
377 0.33
378 0.39
379 0.46
380 0.52
381 0.62
382 0.64
383 0.66
384 0.64
385 0.61
386 0.54
387 0.53
388 0.49
389 0.41
390 0.44
391 0.38
392 0.36
393 0.37
394 0.4
395 0.39
396 0.42
397 0.44
398 0.36
399 0.35
400 0.36
401 0.33
402 0.35
403 0.3
404 0.26
405 0.25
406 0.24
407 0.25
408 0.27
409 0.26
410 0.24
411 0.28
412 0.3
413 0.37
414 0.48
415 0.57
416 0.63
417 0.72
418 0.78
419 0.83
420 0.91
421 0.92
422 0.92
423 0.92
424 0.91
425 0.92