Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YQD9

Protein Details
Accession A0A448YQD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
420-440EIQAIKRKEENERRHSKKGSVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
401-440SRHRHLPEVIKKAQDIKRTEIQAIKRKEENERRHSKKGSV
Subcellular Location(s) nucl 20.5, mito_nucl 13, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007287  Sof1  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MKIKTISRSSETYVPVRNTQENAIPRNLNPALHPFERGREYTRALNATKLERMFAQPFVAQLGQGHRDGVYCLAKNFKAVNKIATGSGDGIVKYWDVTSREEQYSFKAHYGMVSGLVVTPDNKMLSCGSDKSIKLWDLNNETNYGQNYDDTEETSTKGLLKTFLAEFALQSMDHHRDEGLFVTGGAEINLWDENRSRPISNLSWGADNVTCVKFNQTETSIIASAGTDNSLILYDTRTNSATQKIKTRMRTNAISWNPMEAYIFATANEDQNGYLWDMRKMDRATNVYQDHVSAVMDIDFAPTGQEVVTGSYDKTIRIYRYLQGHSRDVYHTKRMQRVFITKFSMDSKYIFSGSDDGNIRIWRSKSNERSAPKSTRERNKLEYDEKLKERYASMPEIRRISRHRHLPEVIKKAQDIKRTEIQAIKRKEENERRHSKKGSVPYKSERERPVMGKVHTNEGV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.5
4 0.49
5 0.45
6 0.44
7 0.46
8 0.46
9 0.46
10 0.47
11 0.44
12 0.4
13 0.46
14 0.45
15 0.38
16 0.33
17 0.36
18 0.36
19 0.35
20 0.39
21 0.32
22 0.36
23 0.4
24 0.41
25 0.39
26 0.37
27 0.4
28 0.42
29 0.46
30 0.46
31 0.42
32 0.44
33 0.43
34 0.42
35 0.43
36 0.38
37 0.33
38 0.29
39 0.34
40 0.32
41 0.29
42 0.27
43 0.22
44 0.22
45 0.24
46 0.22
47 0.16
48 0.16
49 0.2
50 0.2
51 0.2
52 0.2
53 0.17
54 0.17
55 0.18
56 0.2
57 0.21
58 0.19
59 0.2
60 0.25
61 0.25
62 0.28
63 0.32
64 0.31
65 0.33
66 0.34
67 0.35
68 0.33
69 0.34
70 0.32
71 0.28
72 0.25
73 0.19
74 0.18
75 0.16
76 0.13
77 0.12
78 0.12
79 0.11
80 0.1
81 0.09
82 0.12
83 0.13
84 0.17
85 0.21
86 0.27
87 0.29
88 0.3
89 0.3
90 0.3
91 0.33
92 0.3
93 0.27
94 0.22
95 0.2
96 0.19
97 0.2
98 0.17
99 0.13
100 0.11
101 0.1
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.07
106 0.08
107 0.08
108 0.09
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.12
113 0.14
114 0.15
115 0.16
116 0.21
117 0.22
118 0.23
119 0.27
120 0.26
121 0.26
122 0.27
123 0.31
124 0.32
125 0.36
126 0.34
127 0.31
128 0.3
129 0.3
130 0.28
131 0.24
132 0.17
133 0.14
134 0.14
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.14
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.12
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.1
155 0.1
156 0.08
157 0.08
158 0.11
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.13
163 0.12
164 0.13
165 0.13
166 0.11
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.06
174 0.04
175 0.05
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.07
180 0.09
181 0.13
182 0.15
183 0.14
184 0.15
185 0.2
186 0.2
187 0.22
188 0.24
189 0.2
190 0.19
191 0.19
192 0.2
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.13
200 0.12
201 0.13
202 0.15
203 0.14
204 0.15
205 0.15
206 0.17
207 0.15
208 0.13
209 0.12
210 0.09
211 0.08
212 0.07
213 0.06
214 0.04
215 0.03
216 0.03
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.07
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.19
228 0.22
229 0.23
230 0.3
231 0.36
232 0.41
233 0.47
234 0.52
235 0.52
236 0.52
237 0.54
238 0.49
239 0.51
240 0.47
241 0.43
242 0.37
243 0.32
244 0.26
245 0.23
246 0.2
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.09
251 0.07
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.1
256 0.09
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.08
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.13
265 0.14
266 0.2
267 0.2
268 0.22
269 0.25
270 0.28
271 0.28
272 0.34
273 0.34
274 0.29
275 0.28
276 0.26
277 0.21
278 0.17
279 0.15
280 0.08
281 0.07
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.04
294 0.06
295 0.07
296 0.07
297 0.08
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.14
302 0.16
303 0.17
304 0.2
305 0.23
306 0.25
307 0.32
308 0.36
309 0.39
310 0.4
311 0.41
312 0.39
313 0.38
314 0.38
315 0.36
316 0.36
317 0.38
318 0.4
319 0.44
320 0.5
321 0.5
322 0.51
323 0.52
324 0.56
325 0.53
326 0.52
327 0.51
328 0.43
329 0.43
330 0.42
331 0.39
332 0.31
333 0.28
334 0.25
335 0.22
336 0.22
337 0.2
338 0.18
339 0.18
340 0.17
341 0.21
342 0.2
343 0.19
344 0.21
345 0.22
346 0.22
347 0.24
348 0.25
349 0.25
350 0.31
351 0.4
352 0.45
353 0.54
354 0.61
355 0.61
356 0.66
357 0.69
358 0.69
359 0.67
360 0.69
361 0.7
362 0.72
363 0.75
364 0.75
365 0.74
366 0.75
367 0.75
368 0.7
369 0.69
370 0.66
371 0.66
372 0.63
373 0.6
374 0.53
375 0.47
376 0.43
377 0.39
378 0.37
379 0.37
380 0.4
381 0.44
382 0.48
383 0.52
384 0.52
385 0.53
386 0.54
387 0.55
388 0.57
389 0.59
390 0.59
391 0.61
392 0.66
393 0.69
394 0.73
395 0.73
396 0.69
397 0.62
398 0.59
399 0.6
400 0.59
401 0.57
402 0.52
403 0.5
404 0.53
405 0.53
406 0.56
407 0.53
408 0.57
409 0.58
410 0.61
411 0.6
412 0.58
413 0.58
414 0.65
415 0.68
416 0.7
417 0.71
418 0.75
419 0.77
420 0.81
421 0.82
422 0.78
423 0.76
424 0.76
425 0.76
426 0.73
427 0.74
428 0.74
429 0.79
430 0.79
431 0.79
432 0.75
433 0.71
434 0.69
435 0.64
436 0.64
437 0.62
438 0.58
439 0.59
440 0.55