Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YH84

Protein Details
Accession A0A448YH84    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
358-386TSSGNSNKERKYKRPKHRRRQQEEEVNGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-377KERKYKRPKHRRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047157  PHRF1-like  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR024766  Znf_RING_H2  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF12678  zf-rbx1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd15489  PHD_SF  
Amino Acid Sequences MDIGDRDDERTPSGVERARLESPECDTGSTKGLKLDPMEPMELMVAPEDSEVSSTGGIPGSCQSEAADVGDPGDPGDPGDDTCAICLDELPDPGQKITRETRQTQFMARVRPCGHLYHDFCIKAWAEKANTCPQCRGRFNIIELVAEHHVIDQIHIDDKLFPLEVDESIPPEFVDELSPEQPPEFHHQHLQNQLCCLCDASTDAPFAICTECSSGYHLSCLGISDFTHFHCPVCDSEQDLDSIVTNRAGQRVRRSVHSRAIRSSFMQELRRQIQSNRYNQLGLTVPVRRRIIRPSYRPSVDDDNIDYVSIVERNKQRMNKEGHSDEAPDDSHLNKEERMAWRILDTMASGREVTPHETSSGNSNKERKYKRPKHRRRQQEEEVNGEIVINSAHNPLRLTERALSLHDLQLEKTTLQPIHHQDHNSSKELSYNQKMIVQRLLLKPKLKSLHLPSNRYTRTNRAVSRKLYREIAARSDAVYWLNSLEETAERDGIDMRNKSQVDELLRKDERDSAFRRDFDPLVNRLLVEELKHE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.3
3 0.33
4 0.36
5 0.38
6 0.38
7 0.39
8 0.35
9 0.35
10 0.38
11 0.34
12 0.31
13 0.3
14 0.29
15 0.32
16 0.32
17 0.28
18 0.26
19 0.28
20 0.29
21 0.3
22 0.32
23 0.32
24 0.32
25 0.32
26 0.28
27 0.26
28 0.24
29 0.21
30 0.18
31 0.12
32 0.09
33 0.08
34 0.08
35 0.08
36 0.07
37 0.07
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.09
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.12
47 0.14
48 0.14
49 0.14
50 0.13
51 0.13
52 0.14
53 0.15
54 0.14
55 0.11
56 0.12
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.09
62 0.08
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.1
67 0.11
68 0.1
69 0.11
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.12
77 0.13
78 0.15
79 0.16
80 0.17
81 0.21
82 0.19
83 0.23
84 0.28
85 0.35
86 0.4
87 0.44
88 0.49
89 0.52
90 0.53
91 0.51
92 0.54
93 0.5
94 0.52
95 0.48
96 0.51
97 0.46
98 0.48
99 0.46
100 0.4
101 0.41
102 0.41
103 0.43
104 0.4
105 0.43
106 0.39
107 0.37
108 0.38
109 0.33
110 0.26
111 0.25
112 0.26
113 0.23
114 0.25
115 0.3
116 0.36
117 0.41
118 0.4
119 0.45
120 0.47
121 0.53
122 0.54
123 0.55
124 0.53
125 0.51
126 0.52
127 0.51
128 0.45
129 0.37
130 0.34
131 0.31
132 0.24
133 0.2
134 0.17
135 0.11
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.11
144 0.09
145 0.1
146 0.11
147 0.1
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.1
154 0.11
155 0.11
156 0.11
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.07
161 0.08
162 0.07
163 0.1
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.2
171 0.2
172 0.21
173 0.27
174 0.3
175 0.35
176 0.43
177 0.46
178 0.39
179 0.39
180 0.38
181 0.32
182 0.28
183 0.24
184 0.15
185 0.11
186 0.12
187 0.11
188 0.11
189 0.11
190 0.11
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.12
201 0.13
202 0.12
203 0.13
204 0.12
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.08
212 0.08
213 0.09
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.14
219 0.14
220 0.16
221 0.15
222 0.14
223 0.15
224 0.15
225 0.15
226 0.14
227 0.12
228 0.1
229 0.11
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.12
235 0.15
236 0.17
237 0.22
238 0.29
239 0.3
240 0.36
241 0.41
242 0.41
243 0.47
244 0.52
245 0.47
246 0.44
247 0.46
248 0.41
249 0.36
250 0.34
251 0.29
252 0.26
253 0.27
254 0.26
255 0.28
256 0.29
257 0.31
258 0.3
259 0.29
260 0.34
261 0.38
262 0.42
263 0.4
264 0.37
265 0.35
266 0.33
267 0.34
268 0.25
269 0.19
270 0.15
271 0.17
272 0.17
273 0.23
274 0.25
275 0.23
276 0.24
277 0.3
278 0.37
279 0.41
280 0.48
281 0.5
282 0.55
283 0.56
284 0.54
285 0.52
286 0.49
287 0.41
288 0.35
289 0.29
290 0.24
291 0.23
292 0.22
293 0.17
294 0.1
295 0.1
296 0.1
297 0.09
298 0.12
299 0.16
300 0.21
301 0.26
302 0.31
303 0.33
304 0.39
305 0.46
306 0.45
307 0.49
308 0.45
309 0.43
310 0.4
311 0.39
312 0.31
313 0.25
314 0.21
315 0.15
316 0.14
317 0.12
318 0.12
319 0.13
320 0.14
321 0.12
322 0.14
323 0.19
324 0.21
325 0.24
326 0.23
327 0.21
328 0.2
329 0.21
330 0.2
331 0.14
332 0.11
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.09
337 0.08
338 0.11
339 0.12
340 0.15
341 0.15
342 0.15
343 0.16
344 0.16
345 0.17
346 0.22
347 0.26
348 0.27
349 0.3
350 0.35
351 0.4
352 0.49
353 0.55
354 0.58
355 0.63
356 0.7
357 0.77
358 0.82
359 0.88
360 0.9
361 0.94
362 0.95
363 0.93
364 0.92
365 0.91
366 0.9
367 0.83
368 0.77
369 0.69
370 0.58
371 0.48
372 0.38
373 0.27
374 0.17
375 0.12
376 0.07
377 0.05
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.11
382 0.12
383 0.18
384 0.19
385 0.22
386 0.21
387 0.24
388 0.24
389 0.26
390 0.28
391 0.24
392 0.25
393 0.25
394 0.23
395 0.2
396 0.21
397 0.21
398 0.17
399 0.17
400 0.2
401 0.18
402 0.19
403 0.26
404 0.29
405 0.33
406 0.37
407 0.37
408 0.37
409 0.45
410 0.48
411 0.44
412 0.39
413 0.34
414 0.34
415 0.37
416 0.4
417 0.36
418 0.34
419 0.32
420 0.37
421 0.38
422 0.36
423 0.37
424 0.32
425 0.33
426 0.38
427 0.45
428 0.45
429 0.48
430 0.47
431 0.51
432 0.53
433 0.49
434 0.5
435 0.5
436 0.56
437 0.6
438 0.64
439 0.6
440 0.66
441 0.67
442 0.63
443 0.59
444 0.57
445 0.57
446 0.61
447 0.63
448 0.62
449 0.67
450 0.69
451 0.75
452 0.73
453 0.69
454 0.64
455 0.6
456 0.57
457 0.54
458 0.51
459 0.45
460 0.39
461 0.35
462 0.32
463 0.3
464 0.24
465 0.2
466 0.15
467 0.12
468 0.12
469 0.1
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.12
474 0.14
475 0.15
476 0.14
477 0.15
478 0.18
479 0.2
480 0.26
481 0.26
482 0.26
483 0.33
484 0.33
485 0.34
486 0.35
487 0.36
488 0.37
489 0.42
490 0.44
491 0.46
492 0.48
493 0.48
494 0.46
495 0.48
496 0.44
497 0.44
498 0.45
499 0.45
500 0.5
501 0.51
502 0.52
503 0.5
504 0.47
505 0.46
506 0.48
507 0.42
508 0.4
509 0.38
510 0.36
511 0.31
512 0.33
513 0.27