Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YSR5

Protein Details
Accession A0A448YSR5    Localization Confidence Low Confidence Score 6.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-262DDTKVRVYRKQKGAKKSNNGDIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 10.5, nucl 6.5, extr 3, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028608  CIAO1/Cia1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0097361  C:CIA complex  
GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016226  P:iron-sulfur cluster assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MPLTLEYTFEAHKTACWAVAVHPQLQLIATVSGDKTCKIFDLESKQLLATLGDGTHSKTTRCASFKPSVDFPTVAVGSFDGTVSIWGRDLTVDEEEDEEAGSHDASSTTGESDWELLAVIEGHENEVKSVDWSHDGRYLATCSRDKSAWIWETDDTNEEFECINVIQEHDQDVKHVTWHPRENLLATCSYDETCRVFRQDPYDEDDWMCVAKLDDAEGTVWSSAFEKFSEEGIVRLVTCSDDTKVRVYRKQKGAKKSNNGDIPPVPSSLKDEEEWVLEAVLPQVHDRPIYSVDWSDDGMIVSGGCDGRIGVYREVDGKWQVVATQERAHGVYEINCVKWWDGKVLSAGDDGKVKLWQLTE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.16
3 0.16
4 0.17
5 0.18
6 0.26
7 0.28
8 0.26
9 0.26
10 0.25
11 0.24
12 0.24
13 0.21
14 0.14
15 0.12
16 0.1
17 0.11
18 0.11
19 0.13
20 0.14
21 0.14
22 0.14
23 0.13
24 0.15
25 0.16
26 0.18
27 0.23
28 0.31
29 0.36
30 0.37
31 0.38
32 0.36
33 0.33
34 0.31
35 0.24
36 0.16
37 0.11
38 0.09
39 0.09
40 0.1
41 0.12
42 0.17
43 0.18
44 0.18
45 0.21
46 0.25
47 0.31
48 0.35
49 0.36
50 0.37
51 0.45
52 0.49
53 0.51
54 0.51
55 0.47
56 0.46
57 0.43
58 0.36
59 0.34
60 0.29
61 0.23
62 0.18
63 0.15
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.06
68 0.05
69 0.07
70 0.08
71 0.08
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.1
81 0.11
82 0.11
83 0.11
84 0.09
85 0.07
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.08
118 0.11
119 0.12
120 0.14
121 0.17
122 0.18
123 0.17
124 0.18
125 0.2
126 0.18
127 0.21
128 0.21
129 0.19
130 0.21
131 0.21
132 0.2
133 0.2
134 0.25
135 0.24
136 0.23
137 0.23
138 0.22
139 0.23
140 0.22
141 0.22
142 0.15
143 0.13
144 0.12
145 0.1
146 0.09
147 0.08
148 0.08
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.07
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.12
160 0.11
161 0.12
162 0.16
163 0.18
164 0.22
165 0.26
166 0.27
167 0.27
168 0.27
169 0.27
170 0.25
171 0.22
172 0.17
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.11
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.15
183 0.16
184 0.18
185 0.23
186 0.26
187 0.26
188 0.29
189 0.29
190 0.27
191 0.25
192 0.24
193 0.18
194 0.14
195 0.12
196 0.07
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.05
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.09
222 0.08
223 0.08
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.11
229 0.13
230 0.18
231 0.24
232 0.29
233 0.35
234 0.41
235 0.5
236 0.57
237 0.66
238 0.68
239 0.73
240 0.79
241 0.81
242 0.84
243 0.81
244 0.8
245 0.77
246 0.7
247 0.64
248 0.55
249 0.5
250 0.41
251 0.35
252 0.27
253 0.21
254 0.24
255 0.22
256 0.23
257 0.19
258 0.19
259 0.19
260 0.2
261 0.2
262 0.16
263 0.13
264 0.11
265 0.11
266 0.09
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.12
274 0.14
275 0.16
276 0.17
277 0.18
278 0.17
279 0.18
280 0.19
281 0.18
282 0.16
283 0.14
284 0.13
285 0.11
286 0.09
287 0.07
288 0.06
289 0.08
290 0.07
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.07
295 0.12
296 0.16
297 0.16
298 0.17
299 0.19
300 0.21
301 0.22
302 0.24
303 0.21
304 0.18
305 0.17
306 0.16
307 0.16
308 0.19
309 0.22
310 0.23
311 0.25
312 0.26
313 0.27
314 0.28
315 0.28
316 0.24
317 0.22
318 0.2
319 0.23
320 0.25
321 0.24
322 0.24
323 0.25
324 0.25
325 0.29
326 0.28
327 0.26
328 0.25
329 0.26
330 0.28
331 0.28
332 0.28
333 0.26
334 0.25
335 0.21
336 0.23
337 0.21
338 0.19
339 0.19
340 0.19