Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YIN5

Protein Details
Accession A0A448YIN5    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MSKKSELKKSSKSKKGEEKVSKGKKVEKEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-26KSELKKSSKSKKGEEKVSKGKKV
322-356GGNRRGGDRGGWGGNRGGNRHGGDRGSWGGRERRP
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKKSELKKSSKSKKGEEKVSKGKKVEKEEVSESESESESEASVSDPESESESESESASESESESEDKEEEKAASGSESESESESESESDDEKASKKHKSDDDEEDVPATKKSKPSEASESSEPGTLFVGRLSWGVDDDMLRKFFEDNAEGVLSARVLTDRASGRSKGFGYVDFDTKEHVESAIEKLQGSEIDGRPVNLDVAASKRNDSSNDRSHDRAKRFGDAPSEPSDTLFVGNLSFEAESDDIREAFEQFGSVLGIRIPTHPGTEDPRGFAYVQFSSADEAKAALEGLNGEYVKGRPVRLDYSSPKPQGGNSSFGGNRGGNRRGGDRGGWGGNRGGNRHGGDRGSWGGRERRPAASGANSVPVHFKGAKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.87
4 0.86
5 0.85
6 0.87
7 0.89
8 0.87
9 0.82
10 0.81
11 0.78
12 0.77
13 0.76
14 0.71
15 0.67
16 0.65
17 0.63
18 0.59
19 0.51
20 0.43
21 0.36
22 0.3
23 0.24
24 0.19
25 0.15
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.13
36 0.13
37 0.14
38 0.14
39 0.16
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.12
44 0.11
45 0.1
46 0.1
47 0.08
48 0.09
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.14
59 0.13
60 0.12
61 0.12
62 0.12
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.1
78 0.12
79 0.13
80 0.18
81 0.22
82 0.27
83 0.3
84 0.37
85 0.42
86 0.47
87 0.52
88 0.55
89 0.57
90 0.53
91 0.5
92 0.43
93 0.38
94 0.32
95 0.27
96 0.21
97 0.17
98 0.2
99 0.22
100 0.29
101 0.31
102 0.36
103 0.43
104 0.46
105 0.48
106 0.46
107 0.45
108 0.39
109 0.37
110 0.31
111 0.22
112 0.18
113 0.13
114 0.11
115 0.09
116 0.08
117 0.06
118 0.07
119 0.07
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.09
126 0.11
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.14
133 0.13
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.12
139 0.1
140 0.08
141 0.06
142 0.06
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.08
147 0.1
148 0.13
149 0.16
150 0.17
151 0.18
152 0.21
153 0.21
154 0.19
155 0.19
156 0.17
157 0.18
158 0.19
159 0.2
160 0.18
161 0.17
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.11
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.11
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.14
178 0.11
179 0.14
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.13
185 0.08
186 0.08
187 0.05
188 0.08
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.12
193 0.13
194 0.16
195 0.21
196 0.26
197 0.31
198 0.36
199 0.38
200 0.39
201 0.46
202 0.5
203 0.48
204 0.49
205 0.43
206 0.43
207 0.42
208 0.41
209 0.39
210 0.33
211 0.33
212 0.3
213 0.31
214 0.26
215 0.25
216 0.23
217 0.17
218 0.16
219 0.13
220 0.08
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.08
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.05
245 0.07
246 0.07
247 0.08
248 0.11
249 0.11
250 0.12
251 0.13
252 0.15
253 0.19
254 0.26
255 0.26
256 0.25
257 0.25
258 0.26
259 0.26
260 0.24
261 0.23
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.14
266 0.14
267 0.15
268 0.14
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.06
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.11
283 0.15
284 0.17
285 0.17
286 0.16
287 0.2
288 0.24
289 0.27
290 0.35
291 0.36
292 0.42
293 0.51
294 0.5
295 0.49
296 0.45
297 0.43
298 0.45
299 0.42
300 0.38
301 0.3
302 0.34
303 0.33
304 0.33
305 0.35
306 0.26
307 0.28
308 0.3
309 0.32
310 0.3
311 0.32
312 0.34
313 0.34
314 0.36
315 0.32
316 0.29
317 0.31
318 0.32
319 0.31
320 0.29
321 0.28
322 0.29
323 0.31
324 0.29
325 0.27
326 0.28
327 0.29
328 0.31
329 0.32
330 0.3
331 0.28
332 0.3
333 0.33
334 0.29
335 0.29
336 0.31
337 0.36
338 0.39
339 0.46
340 0.46
341 0.45
342 0.44
343 0.44
344 0.44
345 0.42
346 0.42
347 0.36
348 0.4
349 0.36
350 0.35
351 0.36
352 0.32
353 0.31
354 0.3
355 0.32
356 0.34