Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YM56

Protein Details
Accession A0A448YM56    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
267-295RDTYRPEGGRSRRRGRRGANKYRSSRDDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-300GGRSRRRGRRGANKYRSSRDDDGRRRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019416  NCBP3  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000340  F:RNA 7-methylguanosine cap binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF10309  NCBP3  
Amino Acid Sequences MDTDDVNMLPPHLQYQQPEGTEQTELPEQSELPEQGTLPEQSTLPEQTEPPEQDPTEPRPNALYLRGVESLDTRAIKGYVDSYIKPDYTFAEREKYAKFNYKLEWVNDDSINIVFLAGEDAPEGAQTALRLLTDESADIETLEPTAERTARPYLKEATNEEATATIAPQPEHIDLTIRQSFYGDRKVKNARIYSRYYLLHGEPDRTERAPAARDRMRGKSFGYHDYSRDLITGEEHEPELISGGGERTSYRDVYEPSNDRWDHDRYRDTYRPEGGRSRRRGRRGANKYRSSRDDDGRRRKADEDDLFPDFFKRKEDNRDREESPSRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.27
3 0.32
4 0.32
5 0.33
6 0.32
7 0.3
8 0.29
9 0.27
10 0.23
11 0.22
12 0.21
13 0.2
14 0.19
15 0.17
16 0.18
17 0.23
18 0.2
19 0.17
20 0.18
21 0.16
22 0.17
23 0.2
24 0.19
25 0.15
26 0.16
27 0.14
28 0.15
29 0.18
30 0.18
31 0.17
32 0.18
33 0.17
34 0.19
35 0.26
36 0.28
37 0.27
38 0.31
39 0.29
40 0.32
41 0.37
42 0.41
43 0.44
44 0.41
45 0.39
46 0.36
47 0.38
48 0.36
49 0.33
50 0.3
51 0.22
52 0.26
53 0.26
54 0.24
55 0.22
56 0.21
57 0.2
58 0.19
59 0.18
60 0.14
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.13
65 0.12
66 0.13
67 0.16
68 0.16
69 0.18
70 0.21
71 0.21
72 0.21
73 0.2
74 0.18
75 0.2
76 0.23
77 0.21
78 0.24
79 0.25
80 0.27
81 0.29
82 0.31
83 0.3
84 0.36
85 0.37
86 0.35
87 0.37
88 0.41
89 0.43
90 0.4
91 0.41
92 0.34
93 0.34
94 0.3
95 0.28
96 0.21
97 0.17
98 0.16
99 0.11
100 0.08
101 0.05
102 0.04
103 0.06
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.03
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.04
131 0.04
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.09
136 0.15
137 0.18
138 0.19
139 0.21
140 0.24
141 0.26
142 0.29
143 0.28
144 0.26
145 0.25
146 0.24
147 0.21
148 0.17
149 0.15
150 0.12
151 0.1
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.1
161 0.09
162 0.15
163 0.17
164 0.16
165 0.15
166 0.15
167 0.17
168 0.18
169 0.27
170 0.26
171 0.25
172 0.31
173 0.37
174 0.41
175 0.46
176 0.49
177 0.46
178 0.46
179 0.5
180 0.47
181 0.46
182 0.42
183 0.37
184 0.34
185 0.28
186 0.29
187 0.25
188 0.24
189 0.21
190 0.23
191 0.24
192 0.22
193 0.22
194 0.17
195 0.18
196 0.2
197 0.22
198 0.27
199 0.28
200 0.33
201 0.37
202 0.43
203 0.43
204 0.4
205 0.4
206 0.39
207 0.38
208 0.39
209 0.41
210 0.35
211 0.34
212 0.35
213 0.35
214 0.27
215 0.24
216 0.19
217 0.13
218 0.12
219 0.14
220 0.12
221 0.12
222 0.12
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.1
227 0.07
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.09
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.16
239 0.17
240 0.22
241 0.3
242 0.3
243 0.31
244 0.39
245 0.38
246 0.38
247 0.4
248 0.42
249 0.41
250 0.43
251 0.47
252 0.42
253 0.51
254 0.55
255 0.56
256 0.56
257 0.57
258 0.55
259 0.53
260 0.59
261 0.6
262 0.64
263 0.68
264 0.72
265 0.74
266 0.77
267 0.81
268 0.82
269 0.83
270 0.84
271 0.86
272 0.86
273 0.87
274 0.87
275 0.87
276 0.82
277 0.79
278 0.75
279 0.74
280 0.74
281 0.75
282 0.78
283 0.79
284 0.77
285 0.72
286 0.68
287 0.65
288 0.64
289 0.6
290 0.56
291 0.52
292 0.51
293 0.48
294 0.45
295 0.42
296 0.35
297 0.29
298 0.28
299 0.3
300 0.34
301 0.45
302 0.55
303 0.62
304 0.67
305 0.73
306 0.7
307 0.72