Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YPL6

Protein Details
Accession A0A448YPL6    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-149KVVEGGKKRKRRDETRNRHDETRKBasic
296-324GEDVKKEVKKEVRKEKRRKVEYKALGDYEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
129-140EGGKKRKRRDET
294-314KGGEDVKKEVKKEVRKEKRRK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MTRDRDGAQCKICTRPFTVFKWAPRKGGAFKRTVICLTCARAKNCCQSCMLDLSLGIDLNTRDHLLKMAGESEGGNIEIVHNAKNEVARIYNAEQLDRKFNREDDERGVKTDSGDRAKLLLGKIEKVVEGGKKRKRRDETRNRHDETRKNVNITKGDLLKLCKNLPFNGSLNHIPKNEQIKTFFLFGVNDETTDYSIKEYFGDLLGDRKVIESVFVNTRGKFGFVEFINREIAEMAAKKMKKDGDDKATLFVLNRVPIRVCWAGKTVTSGSDYSNIELDKIGQLVRKQMIKLAKGGEDVKKEVKKEVRKEKRRKVEYKALGDYEID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.51
3 0.51
4 0.5
5 0.58
6 0.56
7 0.61
8 0.67
9 0.67
10 0.62
11 0.61
12 0.62
13 0.6
14 0.64
15 0.61
16 0.55
17 0.56
18 0.56
19 0.55
20 0.52
21 0.45
22 0.38
23 0.36
24 0.36
25 0.4
26 0.42
27 0.41
28 0.44
29 0.48
30 0.55
31 0.55
32 0.52
33 0.46
34 0.43
35 0.43
36 0.41
37 0.36
38 0.26
39 0.21
40 0.21
41 0.19
42 0.16
43 0.13
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.11
48 0.11
49 0.1
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.12
56 0.11
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.06
64 0.06
65 0.08
66 0.09
67 0.1
68 0.09
69 0.1
70 0.11
71 0.12
72 0.13
73 0.12
74 0.13
75 0.12
76 0.16
77 0.17
78 0.2
79 0.2
80 0.21
81 0.23
82 0.23
83 0.32
84 0.29
85 0.31
86 0.29
87 0.3
88 0.33
89 0.34
90 0.36
91 0.34
92 0.41
93 0.38
94 0.37
95 0.38
96 0.33
97 0.3
98 0.31
99 0.29
100 0.24
101 0.24
102 0.22
103 0.22
104 0.22
105 0.24
106 0.19
107 0.18
108 0.15
109 0.16
110 0.17
111 0.16
112 0.15
113 0.13
114 0.16
115 0.16
116 0.22
117 0.29
118 0.36
119 0.44
120 0.49
121 0.58
122 0.65
123 0.7
124 0.74
125 0.77
126 0.81
127 0.83
128 0.88
129 0.82
130 0.8
131 0.77
132 0.72
133 0.68
134 0.67
135 0.59
136 0.53
137 0.52
138 0.49
139 0.44
140 0.4
141 0.36
142 0.27
143 0.26
144 0.24
145 0.24
146 0.23
147 0.23
148 0.22
149 0.21
150 0.21
151 0.21
152 0.2
153 0.21
154 0.19
155 0.18
156 0.21
157 0.22
158 0.23
159 0.25
160 0.24
161 0.22
162 0.26
163 0.31
164 0.3
165 0.28
166 0.28
167 0.27
168 0.28
169 0.28
170 0.24
171 0.18
172 0.15
173 0.14
174 0.17
175 0.14
176 0.13
177 0.11
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.07
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.07
200 0.1
201 0.13
202 0.17
203 0.19
204 0.19
205 0.21
206 0.2
207 0.2
208 0.17
209 0.14
210 0.15
211 0.14
212 0.21
213 0.2
214 0.21
215 0.22
216 0.21
217 0.2
218 0.16
219 0.15
220 0.11
221 0.11
222 0.12
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.22
227 0.25
228 0.27
229 0.32
230 0.38
231 0.39
232 0.46
233 0.46
234 0.44
235 0.42
236 0.38
237 0.32
238 0.28
239 0.22
240 0.2
241 0.2
242 0.19
243 0.19
244 0.19
245 0.25
246 0.27
247 0.25
248 0.23
249 0.25
250 0.25
251 0.25
252 0.29
253 0.24
254 0.21
255 0.23
256 0.21
257 0.19
258 0.23
259 0.23
260 0.2
261 0.22
262 0.19
263 0.17
264 0.17
265 0.17
266 0.13
267 0.13
268 0.13
269 0.14
270 0.16
271 0.22
272 0.27
273 0.29
274 0.28
275 0.33
276 0.39
277 0.37
278 0.4
279 0.38
280 0.35
281 0.35
282 0.4
283 0.4
284 0.38
285 0.4
286 0.44
287 0.45
288 0.44
289 0.49
290 0.53
291 0.57
292 0.63
293 0.7
294 0.73
295 0.79
296 0.89
297 0.91
298 0.93
299 0.94
300 0.92
301 0.9
302 0.9
303 0.89
304 0.87
305 0.83
306 0.74