Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YQM3

Protein Details
Accession A0A448YQM3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-66YIPPKETGGKKSKKGKKAKKEEQDKAVPQKLYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-55TGGKKSKKGKKAKKE
Subcellular Location(s) cyto_mito 10.832, mito 10.5, cyto 10.5, cyto_nucl 8.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018165  Ala-tRNA-synth_IIc_core  
IPR018163  Thr/Ala-tRNA-synth_IIc_edit  
IPR009000  Transl_B-barrel_sf  
IPR012947  tRNA_SAD  
Gene Ontology GO:0004813  F:alanine-tRNA ligase activity  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006419  P:alanyl-tRNA aminoacylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF07973  tRNA_SAD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50860  AA_TRNA_LIGASE_II_ALA  
Amino Acid Sequences MTISPSCGAVVGALACQRDSYLKKFASTVISCTEYIPPKETGGKKSKKGKKAKKEEQDKAVPQKLYEVELEDTILFPEGGGQPSDTGYLSVDGDGATDLHKITVKEVKREGLKAVHLITEPVEVGAHVSMGVDWDRRFDLMQQHTGQHLLSAVLDKRELPTLGWNLGDMINYVEIPRKLTSEELESVSKEVNGYITDSIPISVEIPDKESVSKNKMPDDYDLENGVLRVVHIGELDANPCCGTHLSSTSQIKGIALLNEGSGKGTNSRLNFLCGDRVIKYARESHALLRELIGSLTCQQETLPEKARTMVKENKKLQSRQSNLMREIASYKVKELKEELKEKDVVFSYRADGDLPYIFEIFKEMSPLEKGTVVLFTGELHESGAVIVFGEEVDKVVKGLKEKLSSLRGGGKDKFQGKVGRYEKGEIEGVLEYLAEERK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.13
5 0.18
6 0.22
7 0.25
8 0.32
9 0.33
10 0.35
11 0.36
12 0.39
13 0.41
14 0.38
15 0.37
16 0.33
17 0.34
18 0.33
19 0.33
20 0.36
21 0.33
22 0.34
23 0.35
24 0.31
25 0.31
26 0.4
27 0.43
28 0.46
29 0.5
30 0.56
31 0.62
32 0.71
33 0.77
34 0.79
35 0.85
36 0.86
37 0.87
38 0.9
39 0.92
40 0.92
41 0.93
42 0.92
43 0.9
44 0.89
45 0.86
46 0.84
47 0.8
48 0.71
49 0.6
50 0.57
51 0.49
52 0.42
53 0.34
54 0.28
55 0.22
56 0.21
57 0.22
58 0.16
59 0.15
60 0.12
61 0.12
62 0.08
63 0.06
64 0.1
65 0.1
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.12
71 0.14
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.07
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.06
86 0.07
87 0.1
88 0.1
89 0.13
90 0.21
91 0.23
92 0.29
93 0.31
94 0.36
95 0.37
96 0.39
97 0.39
98 0.36
99 0.35
100 0.31
101 0.3
102 0.26
103 0.22
104 0.21
105 0.18
106 0.15
107 0.13
108 0.1
109 0.09
110 0.06
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.05
118 0.06
119 0.08
120 0.08
121 0.1
122 0.11
123 0.11
124 0.12
125 0.14
126 0.21
127 0.24
128 0.29
129 0.29
130 0.3
131 0.3
132 0.31
133 0.27
134 0.19
135 0.15
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.11
142 0.1
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.1
147 0.15
148 0.16
149 0.17
150 0.17
151 0.16
152 0.14
153 0.15
154 0.14
155 0.09
156 0.07
157 0.06
158 0.06
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.12
166 0.14
167 0.15
168 0.15
169 0.17
170 0.17
171 0.17
172 0.17
173 0.16
174 0.16
175 0.14
176 0.1
177 0.08
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.08
191 0.07
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.12
196 0.14
197 0.16
198 0.21
199 0.25
200 0.24
201 0.27
202 0.29
203 0.29
204 0.29
205 0.32
206 0.27
207 0.25
208 0.24
209 0.2
210 0.18
211 0.16
212 0.14
213 0.07
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.05
221 0.05
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.1
232 0.12
233 0.18
234 0.2
235 0.2
236 0.21
237 0.2
238 0.18
239 0.17
240 0.16
241 0.11
242 0.1
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.1
252 0.13
253 0.14
254 0.18
255 0.18
256 0.2
257 0.21
258 0.21
259 0.21
260 0.18
261 0.19
262 0.16
263 0.18
264 0.17
265 0.17
266 0.19
267 0.21
268 0.22
269 0.24
270 0.24
271 0.26
272 0.31
273 0.31
274 0.29
275 0.24
276 0.23
277 0.19
278 0.18
279 0.14
280 0.08
281 0.09
282 0.1
283 0.09
284 0.09
285 0.08
286 0.14
287 0.17
288 0.21
289 0.27
290 0.27
291 0.27
292 0.31
293 0.35
294 0.33
295 0.36
296 0.41
297 0.43
298 0.52
299 0.58
300 0.62
301 0.66
302 0.68
303 0.7
304 0.71
305 0.67
306 0.66
307 0.69
308 0.68
309 0.62
310 0.62
311 0.53
312 0.43
313 0.4
314 0.35
315 0.31
316 0.24
317 0.25
318 0.28
319 0.28
320 0.29
321 0.31
322 0.35
323 0.39
324 0.46
325 0.46
326 0.44
327 0.47
328 0.45
329 0.45
330 0.4
331 0.33
332 0.27
333 0.25
334 0.22
335 0.2
336 0.2
337 0.16
338 0.14
339 0.14
340 0.14
341 0.14
342 0.13
343 0.12
344 0.12
345 0.11
346 0.13
347 0.12
348 0.11
349 0.12
350 0.11
351 0.13
352 0.16
353 0.17
354 0.16
355 0.16
356 0.16
357 0.14
358 0.15
359 0.13
360 0.11
361 0.1
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.09
367 0.09
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.04
376 0.05
377 0.05
378 0.05
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.1
383 0.13
384 0.16
385 0.23
386 0.29
387 0.32
388 0.36
389 0.43
390 0.44
391 0.43
392 0.43
393 0.45
394 0.43
395 0.45
396 0.45
397 0.44
398 0.48
399 0.5
400 0.49
401 0.47
402 0.49
403 0.46
404 0.53
405 0.51
406 0.5
407 0.49
408 0.51
409 0.47
410 0.44
411 0.43
412 0.32
413 0.3
414 0.24
415 0.21
416 0.16
417 0.14
418 0.1