Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YMB5

Protein Details
Accession A0A448YMB5    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-417RRSGRDRDLNRERQRERERRRDRDGDRDRGRRSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
372-421PVRERRNGGKEDERRSGRDRDLNRERQRERERRRDRDGDRDRGRRSIHPY
426-427KR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.833, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024977  Apc4-like_WD40_dom  
IPR040132  Tex1/THOC3  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF12894  ANAPC4_WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MFSSRIDTINLDKLPFASSSSSQQKHASKPQTITLEWNSDGTRLAYSKNDKSVRIVKFEHGRFNATQPMIIEEAHDKPVGSINWDPKLTSRFVTVARDSTVHCWDVHGHTVKLVREFQANGEHSVNFMVKYSKDGSHLAVGSIDGKITIFNTQQEFQFEELITLQLQDQLFEFDWNKASDCILCSLGRGVVEIYRLDSERPSIYLLQSLQLTASDITSLRYAKNDKLFAVGTKDSQVQVVDAQELVTVKSFENYCDQPVGTVDVFPLPKSTSSAGLKRDDPEATLDDSSVSGVLLAITYEYGSPAVVYSTDQDPVKDEPLLKIEECQRSEFLAIARFNPKNYRVIAYNDSQGDSKILYPGTNGIKNGESREPVRERRNGGKEDERRSGRDRDLNRERQRERERRRDRDGDRDRGRRSIHPYDRDVKRPRLN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.21
4 0.18
5 0.18
6 0.26
7 0.36
8 0.37
9 0.39
10 0.46
11 0.5
12 0.54
13 0.62
14 0.62
15 0.6
16 0.61
17 0.65
18 0.63
19 0.58
20 0.56
21 0.51
22 0.47
23 0.41
24 0.4
25 0.33
26 0.28
27 0.28
28 0.22
29 0.2
30 0.16
31 0.17
32 0.22
33 0.29
34 0.34
35 0.42
36 0.45
37 0.43
38 0.5
39 0.56
40 0.53
41 0.53
42 0.5
43 0.48
44 0.54
45 0.56
46 0.58
47 0.52
48 0.52
49 0.47
50 0.48
51 0.48
52 0.39
53 0.36
54 0.27
55 0.28
56 0.24
57 0.23
58 0.21
59 0.16
60 0.18
61 0.19
62 0.19
63 0.16
64 0.15
65 0.21
66 0.19
67 0.2
68 0.23
69 0.27
70 0.32
71 0.32
72 0.32
73 0.31
74 0.34
75 0.31
76 0.27
77 0.24
78 0.21
79 0.24
80 0.29
81 0.28
82 0.27
83 0.26
84 0.27
85 0.25
86 0.26
87 0.27
88 0.23
89 0.2
90 0.19
91 0.2
92 0.22
93 0.27
94 0.27
95 0.23
96 0.25
97 0.29
98 0.3
99 0.31
100 0.3
101 0.25
102 0.24
103 0.24
104 0.24
105 0.28
106 0.28
107 0.27
108 0.26
109 0.25
110 0.22
111 0.23
112 0.21
113 0.13
114 0.12
115 0.11
116 0.1
117 0.14
118 0.17
119 0.17
120 0.19
121 0.2
122 0.21
123 0.23
124 0.23
125 0.19
126 0.16
127 0.15
128 0.13
129 0.11
130 0.09
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.08
136 0.08
137 0.11
138 0.14
139 0.15
140 0.16
141 0.18
142 0.19
143 0.17
144 0.18
145 0.15
146 0.13
147 0.12
148 0.12
149 0.1
150 0.08
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.12
159 0.13
160 0.1
161 0.12
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.07
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.09
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.12
192 0.12
193 0.12
194 0.11
195 0.1
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.13
209 0.16
210 0.21
211 0.21
212 0.2
213 0.22
214 0.22
215 0.2
216 0.22
217 0.19
218 0.15
219 0.15
220 0.16
221 0.14
222 0.14
223 0.13
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.07
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.13
240 0.14
241 0.14
242 0.15
243 0.15
244 0.13
245 0.13
246 0.15
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.1
255 0.1
256 0.12
257 0.13
258 0.16
259 0.19
260 0.24
261 0.27
262 0.29
263 0.31
264 0.3
265 0.32
266 0.26
267 0.23
268 0.21
269 0.19
270 0.18
271 0.17
272 0.15
273 0.13
274 0.12
275 0.12
276 0.09
277 0.06
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.03
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.07
296 0.09
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.15
301 0.17
302 0.19
303 0.18
304 0.18
305 0.17
306 0.2
307 0.22
308 0.19
309 0.22
310 0.27
311 0.32
312 0.33
313 0.34
314 0.31
315 0.3
316 0.31
317 0.28
318 0.22
319 0.22
320 0.21
321 0.22
322 0.29
323 0.28
324 0.3
325 0.35
326 0.36
327 0.34
328 0.35
329 0.35
330 0.31
331 0.36
332 0.38
333 0.34
334 0.37
335 0.33
336 0.33
337 0.29
338 0.27
339 0.22
340 0.18
341 0.16
342 0.14
343 0.13
344 0.12
345 0.12
346 0.18
347 0.23
348 0.25
349 0.25
350 0.24
351 0.27
352 0.29
353 0.33
354 0.31
355 0.29
356 0.28
357 0.37
358 0.42
359 0.47
360 0.53
361 0.55
362 0.57
363 0.63
364 0.69
365 0.65
366 0.65
367 0.67
368 0.67
369 0.68
370 0.71
371 0.66
372 0.63
373 0.63
374 0.64
375 0.61
376 0.61
377 0.59
378 0.6
379 0.66
380 0.72
381 0.77
382 0.8
383 0.76
384 0.78
385 0.83
386 0.83
387 0.83
388 0.84
389 0.85
390 0.84
391 0.9
392 0.9
393 0.85
394 0.85
395 0.85
396 0.84
397 0.84
398 0.83
399 0.78
400 0.75
401 0.73
402 0.69
403 0.69
404 0.69
405 0.68
406 0.67
407 0.7
408 0.73
409 0.76
410 0.78
411 0.78