Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YKK5

Protein Details
Accession A0A448YKK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
27-53LENKRNSSGGKRRRKFRTNKLKMGHGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
31-47RNSSGGKRRRKFRTNKL
Subcellular Location(s) nucl 16, mito_nucl 12.333, cyto_nucl 10.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
Amino Acid Sequences MTSRLCLDKVNKILSHAECFQSAMKDLENKRNSSGGKRRRKFRTNKLKMGHGGTLDPIASGILILGVGSGTKKLGEYTNGSTKIYESVALLGGSTTTGDSEGQLLMTTENDFITREMLERTREKFIGSLSQTPPIFSALKMNGKPLYEYAREGLPLPREIKPRTVQIYSLDLADDCLSTDHDYNFLKSEVCEDGSTLVDKLSNNPTLNDHKILFSEEYMQRAKEDPTLSVESEDARKVTDVKKYDSDDYRAPLLHFTSKVSSGTYIRSLISDFGRAMGSSAYMVSLVRRTQSDWELGKNCFELSDFEDYGEEVWGPVIQKVFEQGPAVDVRQELEEAGNAANVKKVKEDTKRAVETV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.44
4 0.39
5 0.32
6 0.33
7 0.32
8 0.27
9 0.26
10 0.21
11 0.21
12 0.27
13 0.32
14 0.41
15 0.44
16 0.44
17 0.45
18 0.5
19 0.49
20 0.52
21 0.57
22 0.57
23 0.63
24 0.69
25 0.76
26 0.8
27 0.88
28 0.88
29 0.88
30 0.89
31 0.89
32 0.9
33 0.86
34 0.84
35 0.79
36 0.73
37 0.66
38 0.56
39 0.46
40 0.37
41 0.33
42 0.24
43 0.18
44 0.13
45 0.09
46 0.07
47 0.06
48 0.05
49 0.03
50 0.03
51 0.03
52 0.03
53 0.03
54 0.03
55 0.03
56 0.04
57 0.04
58 0.05
59 0.05
60 0.07
61 0.1
62 0.13
63 0.17
64 0.23
65 0.32
66 0.33
67 0.33
68 0.32
69 0.3
70 0.29
71 0.25
72 0.19
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.1
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.05
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.07
95 0.06
96 0.06
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.1
104 0.12
105 0.16
106 0.2
107 0.23
108 0.26
109 0.26
110 0.26
111 0.25
112 0.24
113 0.27
114 0.25
115 0.29
116 0.26
117 0.31
118 0.3
119 0.3
120 0.29
121 0.24
122 0.22
123 0.15
124 0.19
125 0.18
126 0.24
127 0.24
128 0.26
129 0.25
130 0.25
131 0.26
132 0.22
133 0.24
134 0.19
135 0.19
136 0.18
137 0.16
138 0.16
139 0.17
140 0.18
141 0.15
142 0.16
143 0.18
144 0.22
145 0.26
146 0.27
147 0.31
148 0.31
149 0.34
150 0.35
151 0.33
152 0.3
153 0.27
154 0.29
155 0.24
156 0.22
157 0.16
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.08
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.07
168 0.09
169 0.1
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.09
175 0.12
176 0.1
177 0.11
178 0.1
179 0.09
180 0.1
181 0.1
182 0.1
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.1
188 0.14
189 0.18
190 0.17
191 0.18
192 0.22
193 0.25
194 0.28
195 0.28
196 0.24
197 0.2
198 0.2
199 0.22
200 0.19
201 0.14
202 0.18
203 0.16
204 0.19
205 0.2
206 0.19
207 0.18
208 0.19
209 0.2
210 0.18
211 0.18
212 0.15
213 0.19
214 0.22
215 0.21
216 0.2
217 0.19
218 0.16
219 0.17
220 0.17
221 0.12
222 0.1
223 0.1
224 0.13
225 0.16
226 0.21
227 0.22
228 0.26
229 0.31
230 0.34
231 0.4
232 0.41
233 0.41
234 0.38
235 0.37
236 0.35
237 0.31
238 0.28
239 0.24
240 0.22
241 0.22
242 0.2
243 0.19
244 0.19
245 0.2
246 0.2
247 0.19
248 0.19
249 0.17
250 0.19
251 0.19
252 0.18
253 0.16
254 0.16
255 0.16
256 0.16
257 0.16
258 0.15
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.12
263 0.12
264 0.1
265 0.09
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.1
273 0.1
274 0.12
275 0.13
276 0.15
277 0.2
278 0.23
279 0.29
280 0.28
281 0.34
282 0.36
283 0.36
284 0.36
285 0.32
286 0.29
287 0.22
288 0.21
289 0.16
290 0.16
291 0.22
292 0.2
293 0.19
294 0.2
295 0.19
296 0.19
297 0.17
298 0.13
299 0.06
300 0.06
301 0.08
302 0.08
303 0.1
304 0.11
305 0.1
306 0.11
307 0.14
308 0.15
309 0.16
310 0.17
311 0.15
312 0.17
313 0.19
314 0.2
315 0.18
316 0.17
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.13
321 0.12
322 0.12
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.11
327 0.12
328 0.15
329 0.17
330 0.17
331 0.2
332 0.25
333 0.32
334 0.41
335 0.51
336 0.56
337 0.64