Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YI88

Protein Details
Accession A0A448YI88    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-133VRLAIQSVRRNKKRSEKRLASKLIQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-141RRNKKRSEKRLASKLIQAEQRKRRR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007147  TF_Vhr  
Pfam View protein in Pfam  
PF04001  Vhr1  
Amino Acid Sequences MSDGKTSGANSGGSESVISPRPSSLTALSSIPRYNSSNGATSIIRRRLHFNDEALWKKFTTRRLQLVETLSLSSKKASEQDDQINICARTLMAEFGFPESTLAEFVKLVRLAIQSVRRNKKRSEKRLASKLIQAEQRKRRRSVEEHNEGTNFLSSIMYEENTPTTHHHTYSHDSSSSSSPITSPAITAPSTNKPDDPSVSRLAINSLVSPALHDPDRLPSIRKLNANPEFADAAQKILLLIKRSKTCYEFSCTSGLQAGGSTSYQTYELLEEMGSYCVSSAVLFTLEKWFDHLLLDSASYIKLRLKSDLTLSLVVKNLDSNSVEVNRLSDYVASQLFKKLIGGCVKDFGFDSVLYPLCDIFRGVILKDYPLLSKESKMHRWLTEQQQQLPRPLQQQPPSQPSIGKSPFSLTNEMSVAASKSLTATGLPPILTASRIGFSSRLPPLGHKYTTVIIKFNEQELKFIYSSHSNAPPTLLELITNSRTAFGIADHSRPLRIKEHLSGAAINSDFELEKLFRSDNDHIELELVFASSDHGYLKLNYEKKKETTILPPMKDQQGNTRGENSASTISNLTNFQRLL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.13
3 0.16
4 0.21
5 0.22
6 0.2
7 0.21
8 0.23
9 0.23
10 0.26
11 0.24
12 0.21
13 0.22
14 0.24
15 0.25
16 0.26
17 0.27
18 0.26
19 0.27
20 0.28
21 0.28
22 0.3
23 0.31
24 0.32
25 0.31
26 0.32
27 0.3
28 0.33
29 0.39
30 0.42
31 0.42
32 0.4
33 0.46
34 0.48
35 0.54
36 0.53
37 0.46
38 0.46
39 0.51
40 0.56
41 0.52
42 0.49
43 0.42
44 0.44
45 0.45
46 0.46
47 0.47
48 0.49
49 0.54
50 0.58
51 0.61
52 0.61
53 0.61
54 0.56
55 0.47
56 0.41
57 0.34
58 0.29
59 0.26
60 0.22
61 0.18
62 0.17
63 0.21
64 0.24
65 0.27
66 0.32
67 0.39
68 0.44
69 0.44
70 0.43
71 0.44
72 0.39
73 0.34
74 0.27
75 0.2
76 0.15
77 0.15
78 0.15
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.13
83 0.14
84 0.12
85 0.12
86 0.1
87 0.1
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.14
94 0.13
95 0.13
96 0.14
97 0.15
98 0.16
99 0.21
100 0.3
101 0.33
102 0.43
103 0.53
104 0.58
105 0.63
106 0.69
107 0.75
108 0.78
109 0.8
110 0.82
111 0.82
112 0.84
113 0.88
114 0.88
115 0.8
116 0.75
117 0.69
118 0.64
119 0.61
120 0.59
121 0.59
122 0.62
123 0.68
124 0.7
125 0.69
126 0.7
127 0.71
128 0.72
129 0.73
130 0.74
131 0.73
132 0.69
133 0.67
134 0.61
135 0.52
136 0.45
137 0.34
138 0.23
139 0.14
140 0.1
141 0.07
142 0.08
143 0.09
144 0.08
145 0.08
146 0.09
147 0.09
148 0.1
149 0.12
150 0.13
151 0.19
152 0.21
153 0.21
154 0.23
155 0.26
156 0.32
157 0.36
158 0.36
159 0.3
160 0.28
161 0.3
162 0.29
163 0.26
164 0.2
165 0.16
166 0.13
167 0.14
168 0.15
169 0.13
170 0.11
171 0.1
172 0.12
173 0.12
174 0.13
175 0.15
176 0.2
177 0.24
178 0.25
179 0.25
180 0.25
181 0.27
182 0.3
183 0.3
184 0.27
185 0.27
186 0.27
187 0.27
188 0.24
189 0.23
190 0.22
191 0.18
192 0.14
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.1
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.13
203 0.17
204 0.17
205 0.19
206 0.21
207 0.27
208 0.32
209 0.35
210 0.33
211 0.4
212 0.46
213 0.45
214 0.41
215 0.37
216 0.33
217 0.29
218 0.3
219 0.2
220 0.15
221 0.12
222 0.11
223 0.09
224 0.11
225 0.12
226 0.12
227 0.15
228 0.19
229 0.23
230 0.25
231 0.28
232 0.28
233 0.3
234 0.3
235 0.33
236 0.31
237 0.29
238 0.3
239 0.27
240 0.24
241 0.22
242 0.19
243 0.12
244 0.1
245 0.09
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.03
268 0.03
269 0.04
270 0.04
271 0.05
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.1
276 0.1
277 0.09
278 0.1
279 0.1
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.06
284 0.06
285 0.06
286 0.05
287 0.06
288 0.08
289 0.11
290 0.12
291 0.15
292 0.16
293 0.17
294 0.19
295 0.21
296 0.21
297 0.19
298 0.19
299 0.18
300 0.18
301 0.17
302 0.15
303 0.12
304 0.11
305 0.1
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.11
311 0.1
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.07
317 0.06
318 0.08
319 0.1
320 0.09
321 0.09
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.12
326 0.11
327 0.14
328 0.18
329 0.2
330 0.18
331 0.21
332 0.21
333 0.21
334 0.2
335 0.16
336 0.13
337 0.11
338 0.11
339 0.1
340 0.11
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.09
346 0.08
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.13
355 0.13
356 0.11
357 0.12
358 0.15
359 0.13
360 0.16
361 0.22
362 0.28
363 0.32
364 0.36
365 0.39
366 0.38
367 0.43
368 0.47
369 0.5
370 0.51
371 0.5
372 0.52
373 0.56
374 0.55
375 0.54
376 0.5
377 0.44
378 0.42
379 0.45
380 0.45
381 0.44
382 0.51
383 0.53
384 0.56
385 0.55
386 0.5
387 0.46
388 0.4
389 0.43
390 0.38
391 0.32
392 0.26
393 0.27
394 0.3
395 0.32
396 0.33
397 0.24
398 0.23
399 0.23
400 0.23
401 0.2
402 0.15
403 0.13
404 0.1
405 0.09
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.07
412 0.08
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.11
419 0.11
420 0.1
421 0.09
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.11
426 0.17
427 0.19
428 0.21
429 0.21
430 0.24
431 0.3
432 0.36
433 0.36
434 0.3
435 0.31
436 0.32
437 0.37
438 0.35
439 0.31
440 0.25
441 0.3
442 0.3
443 0.32
444 0.35
445 0.29
446 0.3
447 0.3
448 0.33
449 0.28
450 0.27
451 0.25
452 0.22
453 0.24
454 0.27
455 0.3
456 0.26
457 0.27
458 0.28
459 0.25
460 0.23
461 0.23
462 0.18
463 0.13
464 0.13
465 0.18
466 0.18
467 0.19
468 0.16
469 0.15
470 0.15
471 0.15
472 0.14
473 0.1
474 0.16
475 0.18
476 0.2
477 0.23
478 0.23
479 0.27
480 0.29
481 0.32
482 0.29
483 0.32
484 0.35
485 0.36
486 0.42
487 0.4
488 0.4
489 0.38
490 0.34
491 0.33
492 0.28
493 0.23
494 0.17
495 0.15
496 0.13
497 0.12
498 0.14
499 0.1
500 0.11
501 0.14
502 0.14
503 0.14
504 0.22
505 0.27
506 0.28
507 0.32
508 0.32
509 0.29
510 0.3
511 0.28
512 0.22
513 0.17
514 0.13
515 0.07
516 0.06
517 0.09
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.09
522 0.1
523 0.12
524 0.18
525 0.24
526 0.31
527 0.38
528 0.44
529 0.5
530 0.52
531 0.59
532 0.56
533 0.53
534 0.56
535 0.6
536 0.62
537 0.58
538 0.6
539 0.59
540 0.64
541 0.61
542 0.54
543 0.53
544 0.53
545 0.55
546 0.51
547 0.5
548 0.43
549 0.41
550 0.4
551 0.33
552 0.29
553 0.25
554 0.24
555 0.21
556 0.21
557 0.22
558 0.24
559 0.23