Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YKP1

Protein Details
Accession A0A448YKP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
254-286PESLKNKKDAPIQQRKQKKPRRGKITNIHMKGIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-61KGKRARK
260-277KKDAPIQQRKQKKPRRGK
Subcellular Location(s) nucl 13, mito 13, mito_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MSDSLASQLTAFKRSLKRASAVLPAQKRVVQSSAKSRSPLRSAVKRSMNDREDQKGKRARKADHSASSDSLSSMSSMAPPPAGSSLSIRLMTASDFIKGSDRPVTIQDLEMHLNSRVDPQLLKCLANVDRIKYDPVNKTLEYLSLHNIKTAEDLLKVLENQPTFQGLSVKQLRDGWNGCLPTIAELEKENKIIVHKTKKENSPRHIWLNYGNIKVGDRMDVEFYDMWGKVEVPKGGDLVQALLDNGMKPTNVDPESLKNKKDAPIQQRKQKKPRRGKITNIHMKGILKDYSGRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.47
3 0.46
4 0.47
5 0.49
6 0.52
7 0.53
8 0.52
9 0.54
10 0.52
11 0.5
12 0.5
13 0.48
14 0.45
15 0.4
16 0.39
17 0.35
18 0.35
19 0.43
20 0.48
21 0.49
22 0.51
23 0.52
24 0.54
25 0.53
26 0.56
27 0.54
28 0.55
29 0.59
30 0.64
31 0.68
32 0.65
33 0.67
34 0.68
35 0.62
36 0.59
37 0.57
38 0.56
39 0.57
40 0.55
41 0.59
42 0.58
43 0.61
44 0.62
45 0.65
46 0.63
47 0.64
48 0.71
49 0.7
50 0.7
51 0.69
52 0.64
53 0.58
54 0.54
55 0.43
56 0.34
57 0.26
58 0.17
59 0.13
60 0.1
61 0.08
62 0.08
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.08
67 0.09
68 0.1
69 0.1
70 0.09
71 0.1
72 0.13
73 0.15
74 0.16
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.1
81 0.09
82 0.09
83 0.09
84 0.11
85 0.11
86 0.13
87 0.15
88 0.15
89 0.15
90 0.17
91 0.2
92 0.18
93 0.2
94 0.19
95 0.17
96 0.18
97 0.17
98 0.16
99 0.13
100 0.13
101 0.12
102 0.12
103 0.11
104 0.1
105 0.11
106 0.11
107 0.18
108 0.19
109 0.19
110 0.16
111 0.2
112 0.2
113 0.27
114 0.27
115 0.21
116 0.22
117 0.23
118 0.25
119 0.23
120 0.27
121 0.23
122 0.26
123 0.28
124 0.26
125 0.26
126 0.24
127 0.25
128 0.2
129 0.17
130 0.17
131 0.18
132 0.18
133 0.18
134 0.18
135 0.16
136 0.15
137 0.15
138 0.13
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.09
145 0.11
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.11
152 0.12
153 0.1
154 0.17
155 0.21
156 0.21
157 0.21
158 0.25
159 0.26
160 0.28
161 0.3
162 0.26
163 0.25
164 0.25
165 0.24
166 0.21
167 0.19
168 0.15
169 0.15
170 0.12
171 0.08
172 0.09
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.12
177 0.12
178 0.14
179 0.18
180 0.25
181 0.32
182 0.38
183 0.46
184 0.53
185 0.61
186 0.69
187 0.73
188 0.71
189 0.7
190 0.69
191 0.68
192 0.62
193 0.55
194 0.49
195 0.49
196 0.48
197 0.4
198 0.35
199 0.29
200 0.28
201 0.28
202 0.24
203 0.17
204 0.13
205 0.13
206 0.14
207 0.13
208 0.15
209 0.13
210 0.14
211 0.15
212 0.13
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.17
218 0.17
219 0.16
220 0.17
221 0.17
222 0.17
223 0.18
224 0.15
225 0.12
226 0.11
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.08
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.09
236 0.1
237 0.18
238 0.18
239 0.19
240 0.21
241 0.29
242 0.39
243 0.43
244 0.42
245 0.38
246 0.42
247 0.46
248 0.52
249 0.53
250 0.54
251 0.61
252 0.69
253 0.75
254 0.82
255 0.87
256 0.89
257 0.9
258 0.9
259 0.9
260 0.91
261 0.92
262 0.91
263 0.91
264 0.9
265 0.91
266 0.91
267 0.84
268 0.76
269 0.69
270 0.62
271 0.55
272 0.49
273 0.4
274 0.31