Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YQH2

Protein Details
Accession A0A448YQH2    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
306-335VKRGVFRPELTRKCKKTRENEYSKLKRSIEHydrophilic
358-385SPEEQEKLTKRQSERRQRRAMNRQKVRTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
350-383EKDRRAKLSPEEQEKLTKRQSERRQRRAMNRQKV
Subcellular Location(s) nucl 9, plas 7, cyto 3, extr 3, pero 2, E.R. 1, golg 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MLSLPVLLLASVAFAADVSDVASDAASVTSSAVAATSTSTIQQLANLPFWQRLASYPWQLEIVSLSFMAVYIVFFYIGSKYNQRLVNRFMDSILPTLKDNFFQVGVTTTRLLAQDDHQHYTLYASGRLRVESLIARFELQSRQNPFVWIMELVTSQFFDSIDKPEDKVTFEFKIDADGSAQYDDFVWGIVTKDNMNKYRKDNYYLSLTKTSESGKLPAEFVFMNEVPEMNEVLFTKKLPNLLEKSKNLLQLIAITDQPIDKPEKISQLRPTKRIILQLRVPKSKEEVVAAQELLSYVLNEFIDFVVKRGVFRPELTRKCKKTRENEYSKLKRSIEDAAKEEANARKLEQEKDRRAKLSPEEQEKLTKRQSERRQRRAMNRQKVRT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.04
5 0.04
6 0.05
7 0.05
8 0.05
9 0.05
10 0.05
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.06
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.06
23 0.07
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.1
28 0.1
29 0.13
30 0.18
31 0.19
32 0.22
33 0.22
34 0.23
35 0.24
36 0.24
37 0.22
38 0.17
39 0.17
40 0.2
41 0.24
42 0.29
43 0.28
44 0.29
45 0.29
46 0.28
47 0.26
48 0.22
49 0.17
50 0.12
51 0.11
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.06
63 0.08
64 0.1
65 0.13
66 0.16
67 0.18
68 0.25
69 0.3
70 0.33
71 0.36
72 0.39
73 0.44
74 0.42
75 0.4
76 0.35
77 0.33
78 0.3
79 0.28
80 0.25
81 0.18
82 0.16
83 0.19
84 0.19
85 0.17
86 0.17
87 0.16
88 0.14
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.11
96 0.13
97 0.13
98 0.14
99 0.12
100 0.14
101 0.22
102 0.25
103 0.28
104 0.26
105 0.26
106 0.25
107 0.25
108 0.25
109 0.17
110 0.17
111 0.15
112 0.18
113 0.19
114 0.19
115 0.19
116 0.16
117 0.16
118 0.15
119 0.16
120 0.14
121 0.13
122 0.14
123 0.13
124 0.15
125 0.19
126 0.19
127 0.24
128 0.26
129 0.29
130 0.29
131 0.3
132 0.29
133 0.25
134 0.23
135 0.16
136 0.13
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.08
141 0.07
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.07
147 0.1
148 0.13
149 0.14
150 0.15
151 0.17
152 0.18
153 0.19
154 0.19
155 0.19
156 0.17
157 0.17
158 0.18
159 0.15
160 0.17
161 0.15
162 0.14
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.06
169 0.06
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.09
180 0.14
181 0.2
182 0.23
183 0.26
184 0.3
185 0.38
186 0.39
187 0.42
188 0.39
189 0.36
190 0.41
191 0.4
192 0.38
193 0.35
194 0.33
195 0.27
196 0.27
197 0.26
198 0.21
199 0.2
200 0.19
201 0.17
202 0.17
203 0.18
204 0.16
205 0.17
206 0.13
207 0.12
208 0.14
209 0.12
210 0.12
211 0.11
212 0.11
213 0.1
214 0.11
215 0.11
216 0.06
217 0.07
218 0.06
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.11
223 0.12
224 0.15
225 0.15
226 0.21
227 0.24
228 0.32
229 0.39
230 0.38
231 0.43
232 0.43
233 0.45
234 0.4
235 0.35
236 0.27
237 0.22
238 0.23
239 0.18
240 0.14
241 0.11
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.12
248 0.15
249 0.18
250 0.27
251 0.3
252 0.35
253 0.42
254 0.49
255 0.55
256 0.55
257 0.56
258 0.53
259 0.53
260 0.57
261 0.53
262 0.49
263 0.51
264 0.56
265 0.6
266 0.6
267 0.58
268 0.51
269 0.5
270 0.46
271 0.41
272 0.35
273 0.3
274 0.26
275 0.27
276 0.25
277 0.21
278 0.17
279 0.15
280 0.13
281 0.1
282 0.08
283 0.05
284 0.07
285 0.07
286 0.07
287 0.08
288 0.07
289 0.11
290 0.11
291 0.12
292 0.15
293 0.16
294 0.17
295 0.19
296 0.24
297 0.22
298 0.25
299 0.34
300 0.39
301 0.48
302 0.56
303 0.63
304 0.66
305 0.74
306 0.81
307 0.81
308 0.81
309 0.83
310 0.85
311 0.85
312 0.87
313 0.88
314 0.88
315 0.86
316 0.83
317 0.73
318 0.64
319 0.57
320 0.57
321 0.54
322 0.51
323 0.47
324 0.43
325 0.42
326 0.41
327 0.43
328 0.38
329 0.33
330 0.28
331 0.26
332 0.29
333 0.33
334 0.4
335 0.45
336 0.51
337 0.58
338 0.66
339 0.72
340 0.68
341 0.67
342 0.67
343 0.66
344 0.65
345 0.64
346 0.63
347 0.61
348 0.6
349 0.67
350 0.64
351 0.63
352 0.6
353 0.59
354 0.57
355 0.64
356 0.72
357 0.74
358 0.81
359 0.84
360 0.87
361 0.88
362 0.92
363 0.93
364 0.93
365 0.93