Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YFH0

Protein Details
Accession A0A448YFH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
373-397LTSLVKKRKPESSHGRKGKRGKSSSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
378-396KKRKPESSHGRKGKRGKSS
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.166, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MSPKKFSVEITKLLDKGARDMASKQYELAVDHYSEACELSNLESGKDDPDLLYLYGWSLFENAVANSDVLGQNAANATLEETKREAEEIERGGEDSEKAGLEGGGMMQFNDKLAEDEGNDEEEEEEEGEEEEKTAENIEQDKTGDEEESNENPPQVEGQQSDFEIAWEILDLTRTILQKEVSDTEKEEDGDGKRDVPYLTSDKESELEDQPPIVLMKKKLADVYSLLGDISLETENFQQAGADLTTMVDLRRQLYPLATGSLTEAYYKLSLATEFTDLPGSIEAMRMVLKSIEERTSKGEKIEKDVIQEMKQRLYDLEKGDRKIKEEKERIMKGILGGIASTTTANSVEGVASETPIPSDDNSSASQLMVNDLTSLVKKRKPESSHGRKGKRGKSSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.36
3 0.35
4 0.35
5 0.3
6 0.27
7 0.29
8 0.36
9 0.39
10 0.38
11 0.34
12 0.3
13 0.29
14 0.29
15 0.29
16 0.23
17 0.18
18 0.2
19 0.2
20 0.17
21 0.16
22 0.15
23 0.12
24 0.1
25 0.09
26 0.1
27 0.14
28 0.14
29 0.14
30 0.15
31 0.16
32 0.17
33 0.17
34 0.15
35 0.11
36 0.12
37 0.14
38 0.13
39 0.12
40 0.1
41 0.1
42 0.11
43 0.11
44 0.09
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.09
54 0.12
55 0.12
56 0.1
57 0.11
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.07
63 0.07
64 0.09
65 0.14
66 0.14
67 0.15
68 0.16
69 0.17
70 0.17
71 0.17
72 0.16
73 0.12
74 0.17
75 0.17
76 0.18
77 0.17
78 0.17
79 0.17
80 0.17
81 0.15
82 0.11
83 0.1
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.06
92 0.06
93 0.06
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.11
104 0.11
105 0.12
106 0.12
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.09
111 0.07
112 0.06
113 0.05
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.1
125 0.1
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.09
133 0.11
134 0.13
135 0.15
136 0.17
137 0.17
138 0.16
139 0.16
140 0.16
141 0.14
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.12
146 0.13
147 0.13
148 0.14
149 0.13
150 0.12
151 0.11
152 0.09
153 0.07
154 0.05
155 0.06
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.11
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.16
173 0.15
174 0.14
175 0.14
176 0.13
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.12
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.15
188 0.16
189 0.15
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.14
194 0.14
195 0.12
196 0.12
197 0.11
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.11
203 0.15
204 0.17
205 0.18
206 0.19
207 0.19
208 0.19
209 0.17
210 0.18
211 0.14
212 0.12
213 0.11
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.05
219 0.04
220 0.05
221 0.06
222 0.06
223 0.07
224 0.06
225 0.05
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.06
235 0.06
236 0.07
237 0.08
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.13
244 0.14
245 0.12
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.11
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.11
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.09
278 0.12
279 0.17
280 0.18
281 0.2
282 0.25
283 0.3
284 0.3
285 0.32
286 0.36
287 0.32
288 0.38
289 0.44
290 0.39
291 0.38
292 0.42
293 0.41
294 0.4
295 0.45
296 0.4
297 0.37
298 0.36
299 0.33
300 0.29
301 0.31
302 0.32
303 0.3
304 0.38
305 0.39
306 0.42
307 0.48
308 0.48
309 0.48
310 0.51
311 0.55
312 0.56
313 0.58
314 0.63
315 0.67
316 0.69
317 0.67
318 0.6
319 0.53
320 0.42
321 0.38
322 0.29
323 0.19
324 0.15
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.1
344 0.11
345 0.1
346 0.14
347 0.14
348 0.17
349 0.18
350 0.2
351 0.2
352 0.18
353 0.19
354 0.15
355 0.17
356 0.14
357 0.13
358 0.11
359 0.11
360 0.13
361 0.14
362 0.2
363 0.24
364 0.27
365 0.33
366 0.39
367 0.48
368 0.52
369 0.6
370 0.66
371 0.7
372 0.77
373 0.82
374 0.85
375 0.84
376 0.89
377 0.87