Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YP52

Protein Details
Accession A0A448YP52    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-89TKVKRARAMKAAKKVRYGKKGRVDDKEVKBasic
600-626SDTPMVRRPHHHHHHHHHHHKPGKPIPBasic
633-656HKNSKEKVIKSSKKTGFRKELNFGHydrophilic
661-689MSPSEPLKLRKGSKKRMRRKSIVEAQAEGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
63-82VKRARAMKAAKKVRYGKKGR
610-650HHHHHHHHHHKPGKPIPIALKLGHKNSKEKVIKSSKKTGFR
668-680KLRKGSKKRMRRK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018837  TF_CRF1/IFH1  
Gene Ontology GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0060962  P:regulation of ribosomal protein gene transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10380  CRF1  
Amino Acid Sequences MAASPRRTSPRKVRISEDDDEEEGEEGEGEVGDEVHDANSASSFSSSDSSSDDDVDFVQLTKVKRARAMKAAKKVRYGKKGRVDDKEVKADDKPTRSTTIPSVAIPGEEIELDDSIVDAVISAEEKRMPELFENSSGGAALVTSSSDEREFPFEFQSVATPKDEPSGLNDEDLGELVESLSPLPPQKSALKVSGEPMTLDVPKFDENEINSDADYDFDPNELIRTLQNDDDELELLGNSDEDYSNFLLRATSGGIAASDRIDNYLTKQETEVMVNDLDGFGRSKVSDLGSDAIKVEELADKEEEEEESEGEGQDEDSDDDVEDSLDLLGFREIFDGDKLESGGLYVPQSAVFSEDEDGDDEEIDGDLENSREEGQDDDLSDYSDGSDNETNLLHYFFSSSSSESEGEEGRQMVGDTIASDSEETDEDTTIPRKSTHKIGSKRAKEVLSSSKNNFRAPKLGTFIVSQNRKPFGIIDGYSTRFLHPKGNKLSILKGTRAPVDITKGLSKEQRLVLQHQQLQQQRIQRQAQRPNSKSAVALDELLNISEFEDDEAINDASKFEWDSFFSQKRVPLNAFRNRGLVNNGSSNNYADATREYTFQSDTPMVRRPHHHHHHHHHHHKPGKPIPIALKLGHKNSKEKVIKSSKKTGFRKELNFGDEFVMSPSEPLKLRKGSKKRMRRKSIVEAQAEGFRATKSGLFNEEVLNDIEALLMDVGATEDYNFLFSNEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.77
3 0.73
4 0.69
5 0.62
6 0.53
7 0.49
8 0.41
9 0.32
10 0.25
11 0.19
12 0.12
13 0.08
14 0.08
15 0.06
16 0.06
17 0.05
18 0.05
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.05
23 0.06
24 0.06
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.1
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.14
36 0.16
37 0.16
38 0.18
39 0.16
40 0.15
41 0.15
42 0.15
43 0.14
44 0.11
45 0.13
46 0.15
47 0.16
48 0.25
49 0.28
50 0.3
51 0.37
52 0.43
53 0.48
54 0.54
55 0.63
56 0.63
57 0.7
58 0.77
59 0.74
60 0.77
61 0.81
62 0.8
63 0.8
64 0.79
65 0.79
66 0.79
67 0.84
68 0.83
69 0.81
70 0.8
71 0.79
72 0.78
73 0.78
74 0.69
75 0.61
76 0.56
77 0.55
78 0.53
79 0.5
80 0.47
81 0.42
82 0.44
83 0.43
84 0.44
85 0.41
86 0.41
87 0.37
88 0.32
89 0.31
90 0.27
91 0.26
92 0.22
93 0.18
94 0.12
95 0.1
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.05
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.07
111 0.09
112 0.09
113 0.12
114 0.13
115 0.14
116 0.17
117 0.21
118 0.22
119 0.24
120 0.25
121 0.23
122 0.22
123 0.2
124 0.16
125 0.12
126 0.08
127 0.06
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.07
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.15
137 0.16
138 0.17
139 0.19
140 0.18
141 0.18
142 0.17
143 0.21
144 0.18
145 0.19
146 0.18
147 0.17
148 0.17
149 0.19
150 0.19
151 0.15
152 0.18
153 0.22
154 0.21
155 0.2
156 0.2
157 0.18
158 0.17
159 0.17
160 0.12
161 0.06
162 0.05
163 0.05
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.06
168 0.07
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.14
173 0.18
174 0.22
175 0.25
176 0.28
177 0.3
178 0.3
179 0.32
180 0.32
181 0.29
182 0.24
183 0.22
184 0.2
185 0.18
186 0.17
187 0.14
188 0.13
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.15
193 0.15
194 0.19
195 0.2
196 0.19
197 0.17
198 0.17
199 0.15
200 0.13
201 0.12
202 0.09
203 0.08
204 0.07
205 0.08
206 0.07
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.1
212 0.11
213 0.13
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.1
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.08
235 0.08
236 0.09
237 0.07
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.06
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.1
251 0.16
252 0.16
253 0.16
254 0.17
255 0.18
256 0.18
257 0.19
258 0.18
259 0.12
260 0.11
261 0.11
262 0.1
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.05
268 0.06
269 0.06
270 0.07
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.09
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.09
286 0.09
287 0.09
288 0.1
289 0.1
290 0.1
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.05
300 0.04
301 0.05
302 0.05
303 0.05
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.03
313 0.03
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.05
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.06
346 0.06
347 0.05
348 0.05
349 0.04
350 0.04
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.07
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.09
367 0.09
368 0.08
369 0.07
370 0.08
371 0.07
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.06
381 0.06
382 0.07
383 0.06
384 0.08
385 0.09
386 0.09
387 0.1
388 0.12
389 0.12
390 0.11
391 0.13
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.04
403 0.05
404 0.05
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.05
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.06
414 0.08
415 0.1
416 0.1
417 0.11
418 0.13
419 0.15
420 0.17
421 0.25
422 0.32
423 0.4
424 0.46
425 0.55
426 0.63
427 0.66
428 0.67
429 0.64
430 0.57
431 0.48
432 0.46
433 0.46
434 0.43
435 0.43
436 0.41
437 0.44
438 0.46
439 0.49
440 0.47
441 0.39
442 0.38
443 0.37
444 0.38
445 0.34
446 0.32
447 0.29
448 0.28
449 0.3
450 0.32
451 0.33
452 0.31
453 0.32
454 0.33
455 0.32
456 0.31
457 0.27
458 0.22
459 0.23
460 0.2
461 0.2
462 0.22
463 0.23
464 0.25
465 0.25
466 0.23
467 0.2
468 0.21
469 0.25
470 0.25
471 0.32
472 0.37
473 0.41
474 0.43
475 0.43
476 0.46
477 0.45
478 0.45
479 0.39
480 0.36
481 0.33
482 0.32
483 0.31
484 0.28
485 0.22
486 0.23
487 0.23
488 0.22
489 0.22
490 0.21
491 0.23
492 0.25
493 0.25
494 0.25
495 0.26
496 0.29
497 0.29
498 0.33
499 0.38
500 0.42
501 0.46
502 0.45
503 0.5
504 0.49
505 0.49
506 0.48
507 0.48
508 0.44
509 0.48
510 0.5
511 0.51
512 0.55
513 0.62
514 0.69
515 0.72
516 0.71
517 0.7
518 0.66
519 0.59
520 0.51
521 0.43
522 0.36
523 0.27
524 0.25
525 0.18
526 0.17
527 0.16
528 0.15
529 0.13
530 0.09
531 0.09
532 0.07
533 0.07
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.06
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.09
545 0.09
546 0.08
547 0.09
548 0.11
549 0.15
550 0.22
551 0.26
552 0.27
553 0.29
554 0.32
555 0.35
556 0.38
557 0.38
558 0.4
559 0.46
560 0.53
561 0.56
562 0.53
563 0.52
564 0.48
565 0.47
566 0.42
567 0.36
568 0.3
569 0.31
570 0.31
571 0.3
572 0.3
573 0.28
574 0.25
575 0.22
576 0.19
577 0.14
578 0.15
579 0.17
580 0.17
581 0.17
582 0.17
583 0.18
584 0.2
585 0.18
586 0.21
587 0.2
588 0.22
589 0.24
590 0.31
591 0.33
592 0.36
593 0.44
594 0.46
595 0.53
596 0.62
597 0.68
598 0.71
599 0.78
600 0.85
601 0.88
602 0.91
603 0.88
604 0.88
605 0.86
606 0.81
607 0.8
608 0.76
609 0.74
610 0.66
611 0.63
612 0.59
613 0.59
614 0.57
615 0.5
616 0.52
617 0.48
618 0.54
619 0.56
620 0.54
621 0.53
622 0.53
623 0.62
624 0.59
625 0.57
626 0.59
627 0.63
628 0.68
629 0.69
630 0.76
631 0.73
632 0.76
633 0.82
634 0.81
635 0.81
636 0.8
637 0.8
638 0.77
639 0.75
640 0.69
641 0.62
642 0.54
643 0.45
644 0.37
645 0.3
646 0.23
647 0.18
648 0.13
649 0.13
650 0.12
651 0.14
652 0.16
653 0.19
654 0.25
655 0.32
656 0.41
657 0.51
658 0.61
659 0.68
660 0.76
661 0.84
662 0.88
663 0.91
664 0.93
665 0.92
666 0.9
667 0.9
668 0.9
669 0.88
670 0.81
671 0.73
672 0.65
673 0.6
674 0.51
675 0.41
676 0.31
677 0.22
678 0.19
679 0.17
680 0.18
681 0.16
682 0.19
683 0.22
684 0.23
685 0.24
686 0.26
687 0.25
688 0.24
689 0.22
690 0.19
691 0.15
692 0.13
693 0.11
694 0.09
695 0.09
696 0.07
697 0.05
698 0.04
699 0.04
700 0.05
701 0.05
702 0.05
703 0.05
704 0.06
705 0.06
706 0.08
707 0.08