Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YLN3

Protein Details
Accession A0A448YLN3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
160-182VTEADMKRKRTRRRSSATRKVVGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
166-196KRKRTRRRSSATRKVVGVNAKRATKIAPKKD
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
Amino Acid Sequences MPDNYPIRNYPPGVLAGVPPDQRDLLPKPNSIPRRKYSTSIDPRNFLTVYEYQIGDHWVIWDYHSGLVHLTGLWKAVGNNKADIVKLVESSPELEKDLRRIRGGYLKIQGTWVPYSVAKTLASKFCYTIRYALIPVFGPEFVDMCLKPDEIGFGMLRMHVTEADMKRKRTRRRSSATRKVVGVNAKRATKIAPKKDARQVLSRHPLPQHQQQPQIAKYSPYHLPLSSSVSHILSPTSPSHYSLQYPEMTLPTLPKTDGLISVLRAAENLESYPLNRLSKSASASNVLHFPAYQPLVPATKFCRTSPISSPASSSSASLASSPPRSYNYVPISATRTTLPISPPYAGGIPLEGILRELPLPSNNVFMKKDGGQEIRRKMSIDGLVSSHRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.24
3 0.21
4 0.25
5 0.24
6 0.22
7 0.22
8 0.22
9 0.21
10 0.27
11 0.28
12 0.32
13 0.36
14 0.38
15 0.41
16 0.5
17 0.59
18 0.63
19 0.66
20 0.63
21 0.68
22 0.69
23 0.69
24 0.67
25 0.69
26 0.7
27 0.72
28 0.7
29 0.64
30 0.62
31 0.61
32 0.53
33 0.42
34 0.37
35 0.28
36 0.28
37 0.27
38 0.26
39 0.21
40 0.22
41 0.24
42 0.19
43 0.16
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.14
49 0.13
50 0.15
51 0.15
52 0.14
53 0.12
54 0.13
55 0.12
56 0.1
57 0.1
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.1
63 0.16
64 0.2
65 0.21
66 0.22
67 0.24
68 0.25
69 0.24
70 0.24
71 0.2
72 0.17
73 0.16
74 0.15
75 0.13
76 0.13
77 0.15
78 0.16
79 0.14
80 0.14
81 0.16
82 0.17
83 0.25
84 0.31
85 0.33
86 0.32
87 0.32
88 0.34
89 0.4
90 0.42
91 0.39
92 0.38
93 0.36
94 0.35
95 0.35
96 0.33
97 0.28
98 0.25
99 0.2
100 0.15
101 0.15
102 0.16
103 0.16
104 0.16
105 0.14
106 0.15
107 0.19
108 0.22
109 0.24
110 0.23
111 0.24
112 0.25
113 0.27
114 0.25
115 0.24
116 0.21
117 0.2
118 0.2
119 0.2
120 0.17
121 0.15
122 0.15
123 0.13
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.1
130 0.09
131 0.1
132 0.11
133 0.11
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.08
140 0.07
141 0.08
142 0.08
143 0.08
144 0.07
145 0.07
146 0.05
147 0.06
148 0.12
149 0.14
150 0.24
151 0.28
152 0.31
153 0.39
154 0.47
155 0.56
156 0.61
157 0.69
158 0.69
159 0.75
160 0.83
161 0.86
162 0.89
163 0.87
164 0.79
165 0.71
166 0.62
167 0.56
168 0.53
169 0.45
170 0.42
171 0.37
172 0.35
173 0.34
174 0.32
175 0.31
176 0.32
177 0.36
178 0.36
179 0.42
180 0.45
181 0.5
182 0.57
183 0.6
184 0.54
185 0.53
186 0.49
187 0.48
188 0.53
189 0.49
190 0.45
191 0.41
192 0.43
193 0.41
194 0.46
195 0.46
196 0.43
197 0.47
198 0.47
199 0.5
200 0.47
201 0.47
202 0.39
203 0.33
204 0.29
205 0.27
206 0.26
207 0.24
208 0.24
209 0.2
210 0.21
211 0.2
212 0.23
213 0.2
214 0.19
215 0.17
216 0.16
217 0.16
218 0.14
219 0.13
220 0.09
221 0.11
222 0.11
223 0.14
224 0.14
225 0.17
226 0.19
227 0.19
228 0.21
229 0.2
230 0.23
231 0.19
232 0.19
233 0.17
234 0.16
235 0.15
236 0.14
237 0.13
238 0.12
239 0.12
240 0.12
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.12
247 0.12
248 0.14
249 0.14
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.12
260 0.16
261 0.17
262 0.16
263 0.17
264 0.19
265 0.22
266 0.25
267 0.24
268 0.22
269 0.25
270 0.26
271 0.27
272 0.26
273 0.22
274 0.19
275 0.16
276 0.15
277 0.16
278 0.17
279 0.15
280 0.14
281 0.16
282 0.18
283 0.19
284 0.2
285 0.2
286 0.26
287 0.28
288 0.27
289 0.33
290 0.34
291 0.39
292 0.43
293 0.46
294 0.42
295 0.4
296 0.42
297 0.37
298 0.36
299 0.31
300 0.25
301 0.18
302 0.16
303 0.16
304 0.14
305 0.14
306 0.16
307 0.19
308 0.2
309 0.21
310 0.23
311 0.28
312 0.3
313 0.37
314 0.37
315 0.38
316 0.38
317 0.38
318 0.4
319 0.36
320 0.35
321 0.27
322 0.24
323 0.2
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.24
328 0.23
329 0.23
330 0.24
331 0.23
332 0.2
333 0.18
334 0.14
335 0.11
336 0.11
337 0.11
338 0.09
339 0.09
340 0.08
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.11
345 0.12
346 0.16
347 0.16
348 0.22
349 0.24
350 0.29
351 0.3
352 0.29
353 0.32
354 0.31
355 0.36
356 0.37
357 0.42
358 0.45
359 0.53
360 0.6
361 0.62
362 0.61
363 0.57
364 0.51
365 0.5
366 0.48
367 0.42
368 0.35
369 0.31