Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YND3

Protein Details
Accession A0A448YND3    Localization Confidence Low Confidence Score 8.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
130-149NTLIPRSKKHPDRKLPVTILHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.833, mito_nucl 11.166, cyto 5, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR031120  HIR1-like  
IPR011494  HIRA-like_C  
IPR019015  HIRA_B_motif  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006325  P:chromatin organization  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF07569  Hira  
PF09453  HIRA_B  
Amino Acid Sequences MSAIPLVVARDIAAKTITDVTWDPSGQLLFLSSLDGSVTAVFFDEGELGKPIPLEQNSAQLHRYGADRESMYFPESVEQLKLEDAAKAFIQEHPVHSRMEKLMGQLTEGQQQQGLNEINASTTTSTTSVNTLIPRSKKHPDRKLPVTILQTRPKPAAVLTAATQTVRITKSGKKRVTPTLVSVTGNIAAKPQFGNQVIQKRQTKMAQRFLSRPSIKIPRQGLQTLVASVRDSLIWEKQQGKDDESESTIDHISEAQISNGKKHSLPKTQSSRKKRATEFPTYLRSSITTPFSVFTDMKAQPSVIIEEKSSEDGTPFGSIMEIRNECEDKVVNGEFFEEFDSIAKLFVTDGLSENPMFEFFKNEKVTNVTESEFTRESIKVDYWAISTEKGSIILLSKTGRQLMPSLELGSSLTHLISKGKYVLAVTSNGLVYSWDIDIQKSVMEGISLAPLVNQFASYDSHRRKFENAVRIVELRLVDRGLPLVVLSNRHAFSFDVALECWISVLEPWYFDKLGSKDVEEGLKFASGALRIIGGRLRKKQIDKVDENREVVKRAFVEIERCVSERTVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.18
4 0.17
5 0.16
6 0.17
7 0.2
8 0.23
9 0.23
10 0.21
11 0.2
12 0.2
13 0.16
14 0.15
15 0.13
16 0.1
17 0.1
18 0.11
19 0.08
20 0.08
21 0.08
22 0.08
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.05
27 0.06
28 0.06
29 0.06
30 0.06
31 0.08
32 0.07
33 0.09
34 0.11
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.12
39 0.17
40 0.18
41 0.22
42 0.21
43 0.3
44 0.33
45 0.35
46 0.35
47 0.29
48 0.29
49 0.25
50 0.26
51 0.2
52 0.18
53 0.21
54 0.21
55 0.23
56 0.26
57 0.26
58 0.25
59 0.22
60 0.21
61 0.18
62 0.19
63 0.17
64 0.15
65 0.14
66 0.13
67 0.13
68 0.14
69 0.12
70 0.14
71 0.13
72 0.14
73 0.13
74 0.14
75 0.15
76 0.14
77 0.2
78 0.19
79 0.23
80 0.27
81 0.29
82 0.29
83 0.28
84 0.31
85 0.26
86 0.3
87 0.27
88 0.23
89 0.27
90 0.26
91 0.27
92 0.26
93 0.26
94 0.28
95 0.27
96 0.25
97 0.21
98 0.21
99 0.19
100 0.21
101 0.2
102 0.14
103 0.14
104 0.14
105 0.12
106 0.12
107 0.14
108 0.08
109 0.08
110 0.09
111 0.09
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.14
117 0.15
118 0.18
119 0.23
120 0.26
121 0.3
122 0.35
123 0.44
124 0.51
125 0.6
126 0.67
127 0.71
128 0.77
129 0.8
130 0.83
131 0.77
132 0.74
133 0.71
134 0.68
135 0.65
136 0.63
137 0.59
138 0.53
139 0.5
140 0.44
141 0.37
142 0.29
143 0.27
144 0.21
145 0.19
146 0.17
147 0.19
148 0.19
149 0.18
150 0.18
151 0.12
152 0.15
153 0.14
154 0.14
155 0.15
156 0.22
157 0.32
158 0.42
159 0.47
160 0.49
161 0.53
162 0.61
163 0.65
164 0.6
165 0.55
166 0.52
167 0.49
168 0.44
169 0.38
170 0.31
171 0.26
172 0.24
173 0.19
174 0.14
175 0.11
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.19
182 0.22
183 0.31
184 0.34
185 0.41
186 0.45
187 0.42
188 0.46
189 0.49
190 0.53
191 0.52
192 0.58
193 0.56
194 0.55
195 0.57
196 0.56
197 0.6
198 0.51
199 0.44
200 0.41
201 0.44
202 0.43
203 0.46
204 0.46
205 0.41
206 0.44
207 0.43
208 0.38
209 0.31
210 0.3
211 0.24
212 0.2
213 0.16
214 0.12
215 0.11
216 0.1
217 0.07
218 0.08
219 0.08
220 0.11
221 0.11
222 0.15
223 0.18
224 0.21
225 0.27
226 0.28
227 0.28
228 0.28
229 0.27
230 0.25
231 0.23
232 0.21
233 0.15
234 0.15
235 0.13
236 0.1
237 0.09
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.06
243 0.1
244 0.1
245 0.13
246 0.14
247 0.15
248 0.16
249 0.22
250 0.28
251 0.33
252 0.37
253 0.43
254 0.52
255 0.61
256 0.69
257 0.71
258 0.75
259 0.74
260 0.79
261 0.74
262 0.73
263 0.7
264 0.69
265 0.64
266 0.59
267 0.57
268 0.5
269 0.46
270 0.37
271 0.31
272 0.24
273 0.22
274 0.2
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.14
279 0.16
280 0.14
281 0.12
282 0.17
283 0.17
284 0.17
285 0.17
286 0.16
287 0.14
288 0.15
289 0.16
290 0.1
291 0.1
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.12
296 0.12
297 0.1
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.08
302 0.07
303 0.06
304 0.05
305 0.06
306 0.07
307 0.11
308 0.11
309 0.11
310 0.13
311 0.14
312 0.14
313 0.15
314 0.14
315 0.1
316 0.13
317 0.13
318 0.11
319 0.1
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.08
328 0.07
329 0.07
330 0.06
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.08
337 0.09
338 0.11
339 0.1
340 0.11
341 0.09
342 0.09
343 0.1
344 0.08
345 0.13
346 0.12
347 0.2
348 0.23
349 0.23
350 0.24
351 0.26
352 0.28
353 0.25
354 0.26
355 0.19
356 0.18
357 0.19
358 0.22
359 0.19
360 0.18
361 0.18
362 0.16
363 0.17
364 0.17
365 0.16
366 0.14
367 0.14
368 0.15
369 0.12
370 0.14
371 0.14
372 0.13
373 0.12
374 0.12
375 0.11
376 0.11
377 0.1
378 0.09
379 0.09
380 0.09
381 0.11
382 0.1
383 0.12
384 0.14
385 0.16
386 0.16
387 0.15
388 0.17
389 0.17
390 0.19
391 0.18
392 0.18
393 0.15
394 0.15
395 0.15
396 0.13
397 0.12
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.1
403 0.09
404 0.11
405 0.12
406 0.12
407 0.13
408 0.12
409 0.14
410 0.14
411 0.15
412 0.14
413 0.14
414 0.14
415 0.13
416 0.12
417 0.1
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.09
422 0.1
423 0.1
424 0.11
425 0.11
426 0.11
427 0.09
428 0.09
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.07
438 0.08
439 0.07
440 0.07
441 0.06
442 0.07
443 0.1
444 0.14
445 0.24
446 0.31
447 0.37
448 0.4
449 0.42
450 0.44
451 0.51
452 0.56
453 0.56
454 0.54
455 0.51
456 0.52
457 0.51
458 0.48
459 0.41
460 0.33
461 0.24
462 0.2
463 0.17
464 0.14
465 0.13
466 0.13
467 0.1
468 0.09
469 0.08
470 0.12
471 0.13
472 0.15
473 0.18
474 0.22
475 0.23
476 0.23
477 0.24
478 0.19
479 0.2
480 0.2
481 0.18
482 0.14
483 0.14
484 0.15
485 0.14
486 0.13
487 0.11
488 0.08
489 0.07
490 0.06
491 0.09
492 0.08
493 0.1
494 0.13
495 0.17
496 0.17
497 0.17
498 0.23
499 0.22
500 0.27
501 0.27
502 0.27
503 0.26
504 0.28
505 0.33
506 0.26
507 0.26
508 0.22
509 0.2
510 0.18
511 0.16
512 0.16
513 0.12
514 0.12
515 0.11
516 0.12
517 0.11
518 0.13
519 0.17
520 0.22
521 0.29
522 0.36
523 0.44
524 0.5
525 0.57
526 0.64
527 0.71
528 0.73
529 0.75
530 0.77
531 0.79
532 0.77
533 0.74
534 0.71
535 0.64
536 0.57
537 0.49
538 0.45
539 0.36
540 0.32
541 0.35
542 0.31
543 0.33
544 0.33
545 0.37
546 0.35
547 0.35
548 0.34