Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YPR0

Protein Details
Accession A0A448YPR0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MTERTRKRGSKTKGKEVKEAREAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-21RKRGSKTKGKEVKEAR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003923  TFIID_30kDa  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF03540  TFIID_30kDa  
Amino Acid Sequences MTERTRKRGSKTKGKEVKEAREAKEAGEQQNDNKEEGAAVGEAEAEEAEEVTPAEEPAEGAAPAEGVEKAEEAEEAEEPAEEPAEEPAEEESQQPKDPQQPKEELTTAPQPSTGTGLFSANDVDELMDEEEGNEGEEEENDGEEGENDGEEAENEDKEEGNDEEGNEEEGGDDEGNDNQQNEDDQRPTKKRAGESLTDEPAAKKTSSRESSKGVESSEDNAEDPALQKKEVPLRRLPELTREDKTLEEVLDMMDDEDFTPIIPDAVTDYYLAKNGFSTSNRKIKRLLALATQKFVSDIATDAYEYSRIRSNSAVYNSANPQVRARALMMATMMNSQGNEEASEEADGEGNGGNDNTVSGSLGGGPSQQNQNLKVTLTMEDLSSALDEYGLNVNRPQFYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.83
3 0.82
4 0.82
5 0.81
6 0.79
7 0.72
8 0.71
9 0.67
10 0.58
11 0.58
12 0.54
13 0.48
14 0.47
15 0.45
16 0.4
17 0.49
18 0.49
19 0.41
20 0.36
21 0.31
22 0.24
23 0.22
24 0.19
25 0.1
26 0.08
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.06
31 0.06
32 0.04
33 0.04
34 0.04
35 0.04
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.06
40 0.05
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.06
45 0.08
46 0.07
47 0.07
48 0.07
49 0.06
50 0.07
51 0.08
52 0.07
53 0.06
54 0.07
55 0.06
56 0.07
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.08
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.07
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.08
72 0.07
73 0.08
74 0.09
75 0.11
76 0.11
77 0.13
78 0.16
79 0.17
80 0.19
81 0.2
82 0.22
83 0.3
84 0.37
85 0.41
86 0.44
87 0.47
88 0.47
89 0.52
90 0.5
91 0.41
92 0.38
93 0.4
94 0.35
95 0.3
96 0.28
97 0.23
98 0.21
99 0.24
100 0.19
101 0.12
102 0.12
103 0.12
104 0.11
105 0.11
106 0.11
107 0.08
108 0.08
109 0.07
110 0.06
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.06
117 0.06
118 0.06
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.06
132 0.05
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.09
146 0.07
147 0.08
148 0.09
149 0.09
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.08
154 0.08
155 0.06
156 0.05
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.07
168 0.09
169 0.11
170 0.13
171 0.16
172 0.23
173 0.27
174 0.31
175 0.35
176 0.37
177 0.37
178 0.41
179 0.42
180 0.39
181 0.42
182 0.42
183 0.39
184 0.35
185 0.33
186 0.26
187 0.23
188 0.21
189 0.15
190 0.12
191 0.13
192 0.21
193 0.26
194 0.3
195 0.31
196 0.33
197 0.36
198 0.38
199 0.36
200 0.28
201 0.24
202 0.21
203 0.21
204 0.18
205 0.15
206 0.13
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.1
211 0.12
212 0.11
213 0.11
214 0.12
215 0.15
216 0.24
217 0.28
218 0.32
219 0.32
220 0.35
221 0.39
222 0.42
223 0.39
224 0.39
225 0.4
226 0.41
227 0.37
228 0.35
229 0.32
230 0.29
231 0.31
232 0.24
233 0.18
234 0.13
235 0.11
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.06
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.04
248 0.05
249 0.04
250 0.04
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.11
258 0.12
259 0.1
260 0.09
261 0.1
262 0.14
263 0.15
264 0.22
265 0.27
266 0.36
267 0.39
268 0.4
269 0.42
270 0.43
271 0.48
272 0.47
273 0.42
274 0.41
275 0.49
276 0.49
277 0.47
278 0.43
279 0.35
280 0.3
281 0.27
282 0.19
283 0.1
284 0.09
285 0.08
286 0.08
287 0.09
288 0.09
289 0.09
290 0.11
291 0.11
292 0.12
293 0.17
294 0.17
295 0.19
296 0.2
297 0.22
298 0.26
299 0.3
300 0.32
301 0.27
302 0.31
303 0.32
304 0.37
305 0.37
306 0.31
307 0.3
308 0.29
309 0.29
310 0.27
311 0.25
312 0.23
313 0.2
314 0.2
315 0.18
316 0.15
317 0.15
318 0.14
319 0.13
320 0.1
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.1
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.08
350 0.1
351 0.11
352 0.15
353 0.2
354 0.24
355 0.27
356 0.3
357 0.34
358 0.33
359 0.32
360 0.31
361 0.27
362 0.25
363 0.24
364 0.22
365 0.18
366 0.17
367 0.16
368 0.14
369 0.12
370 0.11
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.16
376 0.17
377 0.18
378 0.21
379 0.25