Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A448YK08

Protein Details
Accession A0A448YK08    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-126DGVAPRAKMNQQRSRRFRSARDAKIHydrophilic
390-414DDIFRRRHEKERRRDDNFKRRKTEKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
394-414RRRHEKERRRDDNFKRRKTEK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 11.5, mito 4.5, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPSLFRWLSRKYPKIISPVLEEEPVVVGDIEQPIDYGSPNPNGELDNLYLDMNGIVHPCSHPENKPPPENEDEMMLAIFEYTDRVLMMARPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSARDAKIANEEKQREVEEMEARGEVIEQGIKNKRTWDSNAITPGTPFMDILSESLRYWVAYKLANDPGWADLQVIISDPSVPGEGEHKIMNFIRSQRSDPEYNPNTSHCIYGLDADLIFLSLATHEPHFRVIREDVYAKDQMQRKLKDTDRLGMNDETKRQLERLDRKKPFIWLHIGILREYLAVELSIPRLSFNFDLERAIDDWVFMCFFCGNDFLPHLPCLDVRDSSIDTLVSIWKRVMPSLKDYITCDGELDLSAVEKLLAELGYMEDDIFRRRHEKERRRDDNFKRRKTEKEQRSVLKNELLRTVSKGKDNAPLMPSQNMTLMNLNTGRTAGGLNMTNNEIVHNISTISKANTANKSVAEILKQNMMTRAIENGGGAAAKADGSSEPIDVSEDDLKKRSSSSAFSSTFSSESESSMDPEIDNNDDAIRMWEVGYRMRYYEEKFHTTDENEIKQIRREMVQGYIEGISWVLLYYYQGCPSWNWYYPFHYAPFAADFVDLNELKVTFNLAEPFKPFEQLMSVLPAASKHNLPAVFAPLMCDSDSEIIDFYPEEFQIDMNGAKMAWQGISLLPFIDEKRLLTAVRAKYDQLTPAEVNRNTLKSEILLLGSKNKHFEKFKKLYDSKAELIFHGQKTGLSGKVLASEEFDPKGVTKFPLNVSRDSSNENFIDVPNSAYLEIGYRMPPKVHGKSMLLNGYIPHLVILTEQDSENVRNPHKGFYRGNRFEVTNDIDYSQYVGPYGKTMYTLRAGGYKSYLEMYKYNADRYQQSQQFNRYNAQQQYMSRGRGGRGGNYQGRGGYQGGYNGYQGNRGYDDYQGNGGYQGNGGYQGNRGYQGNRGYQGNGGYQGNYQGNYEGGHQGGYQGNYDGYGGNNNRYRNNNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.64
3 0.68
4 0.69
5 0.62
6 0.58
7 0.57
8 0.53
9 0.46
10 0.39
11 0.32
12 0.27
13 0.23
14 0.17
15 0.11
16 0.08
17 0.1
18 0.11
19 0.11
20 0.1
21 0.1
22 0.1
23 0.1
24 0.11
25 0.11
26 0.14
27 0.19
28 0.2
29 0.21
30 0.21
31 0.22
32 0.23
33 0.23
34 0.2
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.15
39 0.14
40 0.13
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.18
49 0.24
50 0.27
51 0.36
52 0.46
53 0.53
54 0.61
55 0.61
56 0.62
57 0.62
58 0.62
59 0.53
60 0.45
61 0.37
62 0.3
63 0.26
64 0.19
65 0.13
66 0.09
67 0.08
68 0.05
69 0.06
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.06
74 0.07
75 0.11
76 0.21
77 0.28
78 0.3
79 0.33
80 0.33
81 0.35
82 0.35
83 0.34
84 0.27
85 0.25
86 0.23
87 0.21
88 0.22
89 0.2
90 0.2
91 0.18
92 0.15
93 0.1
94 0.13
95 0.19
96 0.26
97 0.36
98 0.45
99 0.55
100 0.66
101 0.74
102 0.8
103 0.84
104 0.82
105 0.79
106 0.81
107 0.81
108 0.78
109 0.78
110 0.72
111 0.64
112 0.68
113 0.66
114 0.61
115 0.59
116 0.54
117 0.48
118 0.48
119 0.48
120 0.38
121 0.34
122 0.33
123 0.27
124 0.26
125 0.24
126 0.21
127 0.19
128 0.18
129 0.17
130 0.12
131 0.09
132 0.11
133 0.1
134 0.17
135 0.25
136 0.28
137 0.29
138 0.34
139 0.37
140 0.39
141 0.44
142 0.46
143 0.43
144 0.46
145 0.51
146 0.48
147 0.44
148 0.39
149 0.35
150 0.27
151 0.23
152 0.16
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.12
164 0.13
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.22
169 0.27
170 0.27
171 0.27
172 0.25
173 0.24
174 0.22
175 0.21
176 0.16
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.09
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.07
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.13
193 0.12
194 0.15
195 0.17
196 0.18
197 0.19
198 0.23
199 0.29
200 0.31
201 0.34
202 0.36
203 0.4
204 0.42
205 0.41
206 0.47
207 0.44
208 0.44
209 0.44
210 0.4
211 0.39
212 0.36
213 0.34
214 0.23
215 0.21
216 0.18
217 0.17
218 0.16
219 0.12
220 0.11
221 0.11
222 0.1
223 0.08
224 0.07
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.06
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.15
234 0.17
235 0.17
236 0.21
237 0.21
238 0.22
239 0.24
240 0.26
241 0.22
242 0.25
243 0.27
244 0.24
245 0.28
246 0.32
247 0.35
248 0.42
249 0.44
250 0.43
251 0.49
252 0.53
253 0.55
254 0.53
255 0.53
256 0.49
257 0.48
258 0.48
259 0.43
260 0.43
261 0.38
262 0.37
263 0.34
264 0.3
265 0.29
266 0.26
267 0.27
268 0.32
269 0.39
270 0.47
271 0.54
272 0.57
273 0.61
274 0.63
275 0.66
276 0.6
277 0.55
278 0.52
279 0.43
280 0.43
281 0.41
282 0.39
283 0.31
284 0.27
285 0.22
286 0.15
287 0.13
288 0.09
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.08
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.11
299 0.11
300 0.13
301 0.14
302 0.14
303 0.15
304 0.15
305 0.17
306 0.15
307 0.15
308 0.12
309 0.1
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.07
314 0.07
315 0.06
316 0.06
317 0.07
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.11
322 0.11
323 0.13
324 0.13
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.14
329 0.14
330 0.13
331 0.12
332 0.15
333 0.15
334 0.15
335 0.15
336 0.12
337 0.1
338 0.1
339 0.13
340 0.11
341 0.11
342 0.11
343 0.12
344 0.13
345 0.15
346 0.2
347 0.18
348 0.22
349 0.28
350 0.29
351 0.28
352 0.3
353 0.31
354 0.27
355 0.25
356 0.2
357 0.14
358 0.13
359 0.12
360 0.1
361 0.07
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.03
368 0.04
369 0.04
370 0.03
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.05
378 0.08
379 0.09
380 0.1
381 0.14
382 0.17
383 0.27
384 0.38
385 0.48
386 0.56
387 0.66
388 0.75
389 0.79
390 0.86
391 0.87
392 0.87
393 0.87
394 0.85
395 0.82
396 0.77
397 0.77
398 0.77
399 0.77
400 0.76
401 0.75
402 0.74
403 0.72
404 0.74
405 0.69
406 0.61
407 0.56
408 0.48
409 0.4
410 0.36
411 0.31
412 0.25
413 0.25
414 0.28
415 0.25
416 0.25
417 0.26
418 0.24
419 0.29
420 0.3
421 0.29
422 0.25
423 0.26
424 0.24
425 0.24
426 0.22
427 0.16
428 0.17
429 0.14
430 0.14
431 0.13
432 0.12
433 0.12
434 0.12
435 0.12
436 0.1
437 0.1
438 0.09
439 0.07
440 0.07
441 0.05
442 0.07
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.09
449 0.09
450 0.07
451 0.07
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.06
456 0.07
457 0.08
458 0.08
459 0.11
460 0.13
461 0.17
462 0.19
463 0.2
464 0.21
465 0.2
466 0.2
467 0.19
468 0.18
469 0.14
470 0.13
471 0.12
472 0.14
473 0.15
474 0.14
475 0.14
476 0.14
477 0.13
478 0.12
479 0.12
480 0.1
481 0.1
482 0.09
483 0.07
484 0.06
485 0.05
486 0.05
487 0.04
488 0.03
489 0.03
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.06
500 0.08
501 0.11
502 0.12
503 0.13
504 0.15
505 0.15
506 0.15
507 0.16
508 0.16
509 0.13
510 0.15
511 0.19
512 0.25
513 0.26
514 0.27
515 0.28
516 0.26
517 0.25
518 0.22
519 0.2
520 0.12
521 0.12
522 0.12
523 0.11
524 0.11
525 0.11
526 0.11
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.08
531 0.08
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.07
537 0.07
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.08
542 0.11
543 0.12
544 0.12
545 0.12
546 0.14
547 0.16
548 0.17
549 0.24
550 0.26
551 0.28
552 0.28
553 0.29
554 0.3
555 0.28
556 0.32
557 0.28
558 0.26
559 0.24
560 0.25
561 0.24
562 0.25
563 0.26
564 0.21
565 0.18
566 0.18
567 0.17
568 0.19
569 0.19
570 0.17
571 0.16
572 0.15
573 0.13
574 0.11
575 0.1
576 0.06
577 0.05
578 0.05
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.06
583 0.07
584 0.08
585 0.09
586 0.09
587 0.1
588 0.15
589 0.19
590 0.21
591 0.23
592 0.24
593 0.28
594 0.31
595 0.33
596 0.28
597 0.25
598 0.21
599 0.19
600 0.19
601 0.15
602 0.12
603 0.1
604 0.09
605 0.08
606 0.12
607 0.11
608 0.1
609 0.1
610 0.1
611 0.1
612 0.1
613 0.1
614 0.06
615 0.07
616 0.11
617 0.11
618 0.12
619 0.13
620 0.18
621 0.17
622 0.18
623 0.17
624 0.13
625 0.14
626 0.15
627 0.14
628 0.13
629 0.13
630 0.11
631 0.11
632 0.12
633 0.12
634 0.12
635 0.12
636 0.1
637 0.14
638 0.14
639 0.15
640 0.15
641 0.16
642 0.15
643 0.15
644 0.16
645 0.13
646 0.14
647 0.13
648 0.12
649 0.09
650 0.1
651 0.11
652 0.09
653 0.08
654 0.07
655 0.07
656 0.07
657 0.07
658 0.07
659 0.07
660 0.07
661 0.07
662 0.07
663 0.07
664 0.08
665 0.08
666 0.07
667 0.07
668 0.06
669 0.06
670 0.07
671 0.07
672 0.06
673 0.06
674 0.06
675 0.07
676 0.08
677 0.08
678 0.07
679 0.07
680 0.08
681 0.09
682 0.11
683 0.11
684 0.1
685 0.12
686 0.14
687 0.14
688 0.15
689 0.23
690 0.23
691 0.27
692 0.27
693 0.26
694 0.27
695 0.29
696 0.3
697 0.24
698 0.24
699 0.21
700 0.25
701 0.32
702 0.3
703 0.32
704 0.31
705 0.31
706 0.28
707 0.27
708 0.23
709 0.15
710 0.17
711 0.14
712 0.13
713 0.13
714 0.13
715 0.19
716 0.22
717 0.23
718 0.26
719 0.28
720 0.33
721 0.38
722 0.44
723 0.48
724 0.53
725 0.58
726 0.64
727 0.64
728 0.64
729 0.65
730 0.64
731 0.57
732 0.54
733 0.48
734 0.38
735 0.42
736 0.41
737 0.33
738 0.28
739 0.25
740 0.2
741 0.22
742 0.25
743 0.19
744 0.14
745 0.15
746 0.14
747 0.18
748 0.19
749 0.16
750 0.16
751 0.17
752 0.19
753 0.18
754 0.18
755 0.14
756 0.14
757 0.16
758 0.15
759 0.15
760 0.15
761 0.19
762 0.24
763 0.32
764 0.34
765 0.35
766 0.38
767 0.39
768 0.38
769 0.39
770 0.36
771 0.32
772 0.29
773 0.27
774 0.23
775 0.2
776 0.21
777 0.16
778 0.16
779 0.11
780 0.12
781 0.11
782 0.1
783 0.1
784 0.09
785 0.1
786 0.1
787 0.13
788 0.14
789 0.16
790 0.17
791 0.23
792 0.3
793 0.33
794 0.37
795 0.38
796 0.39
797 0.43
798 0.48
799 0.46
800 0.38
801 0.34
802 0.3
803 0.28
804 0.24
805 0.19
806 0.13
807 0.09
808 0.08
809 0.08
810 0.1
811 0.08
812 0.09
813 0.1
814 0.11
815 0.13
816 0.15
817 0.2
818 0.24
819 0.25
820 0.31
821 0.32
822 0.38
823 0.42
824 0.47
825 0.49
826 0.54
827 0.63
828 0.62
829 0.64
830 0.6
831 0.56
832 0.5
833 0.48
834 0.43
835 0.35
836 0.31
837 0.27
838 0.24
839 0.23
840 0.25
841 0.2
842 0.14
843 0.12
844 0.11
845 0.11
846 0.13
847 0.14
848 0.11
849 0.14
850 0.15
851 0.17
852 0.2
853 0.2
854 0.19
855 0.23
856 0.23
857 0.22
858 0.23
859 0.2
860 0.18
861 0.2
862 0.21
863 0.19
864 0.19
865 0.22
866 0.28
867 0.29
868 0.33
869 0.33
870 0.35
871 0.37
872 0.41
873 0.47
874 0.45
875 0.5
876 0.53
877 0.59
878 0.63
879 0.61
880 0.6
881 0.55
882 0.58
883 0.55
884 0.53
885 0.49
886 0.43
887 0.49
888 0.51
889 0.47
890 0.42
891 0.41
892 0.37
893 0.39
894 0.4
895 0.36
896 0.37
897 0.43
898 0.45
899 0.44
900 0.44
901 0.39
902 0.37
903 0.34
904 0.28
905 0.21
906 0.17
907 0.18
908 0.19
909 0.19
910 0.19
911 0.21
912 0.2
913 0.23
914 0.22
915 0.22
916 0.22
917 0.23
918 0.23
919 0.25
920 0.27
921 0.24
922 0.26
923 0.24
924 0.22
925 0.21
926 0.2
927 0.16
928 0.14
929 0.12
930 0.1
931 0.12
932 0.13
933 0.12
934 0.14
935 0.17
936 0.18
937 0.2
938 0.21
939 0.2
940 0.26
941 0.32
942 0.35
943 0.36
944 0.36
945 0.35
946 0.36
947 0.37
948 0.34
949 0.31
950 0.27
951 0.24
952 0.23
953 0.28
954 0.27
955 0.25
956 0.23
957 0.19
958 0.19
959 0.19
960 0.21
961 0.17
962 0.15
963 0.15
964 0.14
965 0.17
966 0.2
967 0.2
968 0.19
969 0.17
970 0.17
971 0.17
972 0.17
973 0.14
974 0.11
975 0.19
976 0.2
977 0.27
978 0.32
979 0.35
980 0.41