Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A448YTD0

Protein Details
Accession A0A448YTD0    Localization Confidence High Confidence Score 25.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAPRKARTSKKTTKVGKVEKVEEHydrophilic
32-60RVPQTKTKGTTTKRGRRKGKEAVNEDVKEHydrophilic
66-91EPSKVVKVTKKANKKASKNTANNVSEHydrophilic
444-468VKDDPKEGPAKPKRTRSKRTPKTKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-51RKARTSKKTTKVGKVEKVEEVKPVKEAKRVPQTKTKGTTTKRGRRKGK
393-428ERKRKHEEAIKEKESARKETLKKAKTGTKGKRAAVA
449-468KEGPAKPKRTRSKRTPKTKA
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MAPRKARTSKKTTKVGKVEKVEEVKPVKEAKRVPQTKTKGTTTKRGRRKGKEAVNEDVKEIADDPEPSKVVKVTKKANKKASKNTANNVSEAVSSPAIKDSILDKAASELKKWSQRQVEQAEQKSSKRSLFEQDDEDLSLYLQATSGKFFAKKPTLKPKAIRLAHTVHNLDEFKICLFVKDGSIDEKLLSEIEAEEIPNLSKIIPANELKTTYKTFETRRRLASEYDMFLSDDNIVTILPKLLGKIFYGNSKYPIPIRIGTKEEAVSIVTLKSKIEKAVNSVYYIPPTGVNLSIKIGRVDQDSEKLRENVHLIVEHLAKFPIRMVQLKMTNSPAIPVYISEKIYDEGDVVDDEAEVDRKELEDDEEEVDLGTFEKGLIELAVDEDEAKEIIGERKRKHEEAIKEKESARKETLKKAKTGTKGKRAAVAKAEVQKDSEAADSQAVKDDPKEGPAKPKRTRSKRTPKTKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.87
3 0.86
4 0.84
5 0.79
6 0.77
7 0.73
8 0.64
9 0.62
10 0.56
11 0.48
12 0.45
13 0.48
14 0.44
15 0.46
16 0.5
17 0.52
18 0.58
19 0.64
20 0.65
21 0.67
22 0.71
23 0.73
24 0.74
25 0.73
26 0.71
27 0.7
28 0.75
29 0.75
30 0.78
31 0.79
32 0.82
33 0.84
34 0.84
35 0.88
36 0.88
37 0.87
38 0.87
39 0.82
40 0.81
41 0.8
42 0.71
43 0.62
44 0.54
45 0.44
46 0.34
47 0.29
48 0.22
49 0.14
50 0.16
51 0.16
52 0.18
53 0.19
54 0.19
55 0.19
56 0.2
57 0.26
58 0.3
59 0.37
60 0.43
61 0.52
62 0.62
63 0.7
64 0.77
65 0.8
66 0.82
67 0.86
68 0.87
69 0.88
70 0.84
71 0.82
72 0.82
73 0.74
74 0.65
75 0.55
76 0.45
77 0.35
78 0.29
79 0.24
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.15
89 0.16
90 0.15
91 0.13
92 0.17
93 0.23
94 0.23
95 0.22
96 0.21
97 0.27
98 0.36
99 0.38
100 0.43
101 0.45
102 0.49
103 0.57
104 0.6
105 0.63
106 0.62
107 0.65
108 0.65
109 0.6
110 0.57
111 0.54
112 0.5
113 0.43
114 0.37
115 0.36
116 0.36
117 0.39
118 0.41
119 0.39
120 0.37
121 0.35
122 0.33
123 0.3
124 0.21
125 0.15
126 0.12
127 0.09
128 0.07
129 0.06
130 0.07
131 0.07
132 0.08
133 0.09
134 0.11
135 0.12
136 0.14
137 0.21
138 0.28
139 0.33
140 0.41
141 0.51
142 0.58
143 0.63
144 0.66
145 0.67
146 0.69
147 0.67
148 0.62
149 0.55
150 0.51
151 0.5
152 0.51
153 0.42
154 0.32
155 0.33
156 0.31
157 0.27
158 0.23
159 0.18
160 0.13
161 0.15
162 0.14
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.11
173 0.11
174 0.1
175 0.09
176 0.08
177 0.06
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.12
192 0.13
193 0.15
194 0.16
195 0.19
196 0.18
197 0.21
198 0.2
199 0.18
200 0.2
201 0.22
202 0.27
203 0.34
204 0.41
205 0.43
206 0.45
207 0.47
208 0.46
209 0.44
210 0.44
211 0.37
212 0.3
213 0.27
214 0.23
215 0.19
216 0.17
217 0.16
218 0.1
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.06
230 0.07
231 0.07
232 0.09
233 0.1
234 0.14
235 0.17
236 0.17
237 0.19
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.21
242 0.19
243 0.2
244 0.22
245 0.23
246 0.25
247 0.25
248 0.25
249 0.23
250 0.2
251 0.17
252 0.14
253 0.11
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.1
261 0.13
262 0.15
263 0.15
264 0.19
265 0.25
266 0.25
267 0.25
268 0.26
269 0.23
270 0.21
271 0.21
272 0.17
273 0.11
274 0.11
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.13
281 0.14
282 0.13
283 0.13
284 0.12
285 0.14
286 0.16
287 0.16
288 0.21
289 0.24
290 0.25
291 0.28
292 0.27
293 0.26
294 0.25
295 0.26
296 0.21
297 0.18
298 0.17
299 0.14
300 0.17
301 0.18
302 0.16
303 0.15
304 0.14
305 0.13
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.14
310 0.16
311 0.18
312 0.24
313 0.29
314 0.31
315 0.33
316 0.32
317 0.31
318 0.27
319 0.26
320 0.2
321 0.15
322 0.14
323 0.12
324 0.13
325 0.15
326 0.16
327 0.15
328 0.16
329 0.16
330 0.17
331 0.16
332 0.12
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.07
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.1
349 0.11
350 0.13
351 0.14
352 0.14
353 0.14
354 0.13
355 0.12
356 0.1
357 0.08
358 0.06
359 0.05
360 0.04
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.04
366 0.04
367 0.05
368 0.06
369 0.05
370 0.06
371 0.06
372 0.06
373 0.06
374 0.06
375 0.05
376 0.07
377 0.14
378 0.21
379 0.28
380 0.31
381 0.41
382 0.48
383 0.5
384 0.55
385 0.57
386 0.6
387 0.63
388 0.71
389 0.64
390 0.61
391 0.63
392 0.63
393 0.59
394 0.54
395 0.5
396 0.5
397 0.52
398 0.58
399 0.65
400 0.63
401 0.64
402 0.66
403 0.67
404 0.68
405 0.73
406 0.73
407 0.73
408 0.76
409 0.73
410 0.74
411 0.68
412 0.65
413 0.6
414 0.55
415 0.51
416 0.51
417 0.52
418 0.45
419 0.44
420 0.38
421 0.32
422 0.29
423 0.24
424 0.17
425 0.15
426 0.18
427 0.18
428 0.18
429 0.23
430 0.22
431 0.21
432 0.21
433 0.24
434 0.22
435 0.27
436 0.31
437 0.28
438 0.38
439 0.47
440 0.57
441 0.61
442 0.71
443 0.76
444 0.82
445 0.89
446 0.9
447 0.91
448 0.92